Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4F8

Tubgcp4, Gamma-tubulin complex component 4, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubgcp4Q9D4F8 4930521E06Rik-201ENSMUST00000186732 905 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Tubgcp4Q9D4F8 Gm28917-201ENSMUST00000187294 237 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Tubgcp4Q9D4F8 Gm28766-201ENSMUST00000191086 234 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Tubgcp4Q9D4F8 Gm37884-201ENSMUST00000191857 818 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Tubgcp4Q9D4F8 Gm37610-201ENSMUST00000191867 620 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Tubgcp4Q9D4F8 Gm37213-201ENSMUST00000193077 586 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Tubgcp4Q9D4F8 Gm18255-201ENSMUST00000211316 765 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Tubgcp4Q9D4F8 1700092E16Rik-201ENSMUST00000214766 753 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Tubgcp4Q9D4F8 AC127302.1-201ENSMUST00000215973 1111 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Tubgcp4Q9D4F8 Gm46102-201ENSMUST00000217005 731 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Tubgcp4Q9D4F8 Gm18510-201ENSMUST00000219335 1096 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Tubgcp4Q9D4F8 Gm36501-201ENSMUST00000221857 745 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Tubgcp4Q9D4F8 AC153794.2-201ENSMUST00000222650 550 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Tubgcp4Q9D4F8 AC141425.1-201ENSMUST00000224989 265 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Tubgcp4Q9D4F8 Defb10-201ENSMUST00000054162 298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Tubgcp4Q9D4F8 Bcl2l15-201ENSMUST00000062945 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Tubgcp4Q9D4F8 Olfr780-201ENSMUST00000063168 1025 ntAPPRIS P1 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Tubgcp4Q9D4F8 Fxyd3-201ENSMUST00000072331 439 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Tubgcp4Q9D4F8 Trim6-201ENSMUST00000098180 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Tubgcp4Q9D4F8 Olfr1105-201ENSMUST00000099868 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Tubgcp4Q9D4F8 Gm3604-201ENSMUST00000107989 1677 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
Tubgcp4Q9D4F8 Cyp4a12a-201ENSMUST00000084343 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
Tubgcp4Q9D4F8 Tgtp2-201ENSMUST00000046745 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
Tubgcp4Q9D4F8 Vmn1r37-203ENSMUST00000226886 1308 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
Tubgcp4Q9D4F8 D5Ertd577e-201ENSMUST00000094593 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
Tubgcp4Q9D4F8 Mboat2-204ENSMUST00000221952 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
Tubgcp4Q9D4F8 Gm4011-201ENSMUST00000174657 2555 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
Tubgcp4Q9D4F8 Vmn1r201-203ENSMUST00000226965 4741 ntAPPRIS P1 BASIC5.9□□□□□ -1.47
Tubgcp4Q9D4F8 Alkbh8-204ENSMUST00000211933 7674 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
Tubgcp4Q9D4F8 AC168274.1-201ENSMUST00000218657 1864 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
Tubgcp4Q9D4F8 AC158982.1-205ENSMUST00000227339 1876 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
Tubgcp4Q9D4F8 Gm37124-201ENSMUST00000192140 1992 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Tubgcp4Q9D4F8 Gm26691-202ENSMUST00000181952 4183 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Tubgcp4Q9D4F8 Rgs2-202ENSMUST00000127206 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Tubgcp4Q9D4F8 Fam122b-202ENSMUST00000114838 3536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Tubgcp4Q9D4F8 CT009734.1-201ENSMUST00000227657 1687 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Tubgcp4Q9D4F8 Olfr701-203ENSMUST00000217739 4100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Tubgcp4Q9D4F8 Mfn1-202ENSMUST00000118286 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Tubgcp4Q9D4F8 Trav10-201ENSMUST00000103583 406 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Tubgcp4Q9D4F8 Gm13991-201ENSMUST00000120190 648 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Tubgcp4Q9D4F8 Gm13062-201ENSMUST00000151337 562 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Tubgcp4Q9D4F8 G630016G05Rik-201ENSMUST00000152412 796 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Tubgcp4Q9D4F8 Gm22818-201ENSMUST00000157446 104 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Tubgcp4Q9D4F8 Gm25430-201ENSMUST00000157614 289 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Tubgcp4Q9D4F8 Vmn1r10-201ENSMUST00000176073 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Tubgcp4Q9D4F8 Gm21915-201ENSMUST00000177787 402 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Tubgcp4Q9D4F8 Mir7087-201ENSMUST00000184840 70 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Tubgcp4Q9D4F8 Gm28429-201ENSMUST00000188521 363 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Tubgcp4Q9D4F8 Gm29592-201ENSMUST00000189434 370 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Tubgcp4Q9D4F8 Gm37982-201ENSMUST00000193076 561 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Tubgcp4Q9D4F8 Gm38040-201ENSMUST00000193505 225 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Tubgcp4Q9D4F8 2900002M20Rik-201ENSMUST00000195754 330 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Tubgcp4Q9D4F8 Gm36535-201ENSMUST00000198395 511 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Tubgcp4Q9D4F8 Gm9332-201ENSMUST00000198431 730 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Tubgcp4Q9D4F8 4930500F04Rik-202ENSMUST00000202156 251 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Tubgcp4Q9D4F8 Gm44795-201ENSMUST00000205496 319 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Tubgcp4Q9D4F8 Gm7706-202ENSMUST00000211278 590 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Tubgcp4Q9D4F8 Gm7607-201ENSMUST00000214920 518 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Tubgcp4Q9D4F8 Gm18541-201ENSMUST00000215935 538 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Tubgcp4Q9D4F8 AC162467.1-201ENSMUST00000220254 621 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Tubgcp4Q9D4F8 AC101709.1-201ENSMUST00000220276 909 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Tubgcp4Q9D4F8 AC156572.1-201ENSMUST00000221040 1161 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Tubgcp4Q9D4F8 Gm34081-201ENSMUST00000221332 690 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Tubgcp4Q9D4F8 AC153646.1-201ENSMUST00000223229 1279 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Tubgcp4Q9D4F8 AC129085.4-201ENSMUST00000224536 570 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Tubgcp4Q9D4F8 AC154806.3-201ENSMUST00000227376 439 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Tubgcp4Q9D4F8 Olfr902-201ENSMUST00000050733 1056 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Tubgcp4Q9D4F8 Olfr1102-201ENSMUST00000055129 1063 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Tubgcp4Q9D4F8 Plac1-201ENSMUST00000074861 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Tubgcp4Q9D4F8 Vmn1r46-201ENSMUST00000075797 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Tubgcp4Q9D4F8 Mir129-1-201ENSMUST00000083535 73 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Tubgcp4Q9D4F8 Mir449a-201ENSMUST00000083641 91 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Tubgcp4Q9D4F8 Gm38590-202ENSMUST00000210654 1803 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Tubgcp4Q9D4F8 Ireb2-201ENSMUST00000034843 5770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Tubgcp4Q9D4F8 Cyp4a28-ps-201ENSMUST00000121884 1477 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Tubgcp4Q9D4F8 AC166344.3-203ENSMUST00000228117 1466 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Tubgcp4Q9D4F8 Casp1-201ENSMUST00000027015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Tubgcp4Q9D4F8 Gm33609-201ENSMUST00000198559 2694 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Tubgcp4Q9D4F8 Cd44-203ENSMUST00000099673 2848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Tubgcp4Q9D4F8 Olfr461-202ENSMUST00000215009 4292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Tubgcp4Q9D4F8 Arhgap12-202ENSMUST00000077128 4431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Tubgcp4Q9D4F8 Vmn2r-ps119-201ENSMUST00000177481 2406 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Tubgcp4Q9D4F8 Akap5-202ENSMUST00000154078 6685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Tubgcp4Q9D4F8 Akap5-201ENSMUST00000095610 6687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Tubgcp4Q9D4F8 Gm6545-201ENSMUST00000217186 1786 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Tubgcp4Q9D4F8 Chd9-202ENSMUST00000109614 11565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Tubgcp4Q9D4F8 9230109A22Rik-202ENSMUST00000228644 1853 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Tubgcp4Q9D4F8 Agbl2-204ENSMUST00000111481 3448 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Tubgcp4Q9D4F8 Abcg3-202ENSMUST00000130644 2668 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Tubgcp4Q9D4F8 Gm37137-201ENSMUST00000195138 2684 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Tubgcp4Q9D4F8 Gm38067-201ENSMUST00000192346 1911 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Tubgcp4Q9D4F8 Abcc2-202ENSMUST00000099413 1926 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Tubgcp4Q9D4F8 Olfr145-201ENSMUST00000086062 6796 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Tubgcp4Q9D4F8 Gm35066-201ENSMUST00000198898 2074 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Tubgcp4Q9D4F8 Npsr1-201ENSMUST00000059650 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Tubgcp4Q9D4F8 Gm10488-201ENSMUST00000101657 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Tubgcp4Q9D4F8 Zcchc9-ps-201ENSMUST00000117884 786 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Tubgcp4Q9D4F8 Gm13924-201ENSMUST00000119899 486 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Tubgcp4Q9D4F8 Gm13808-201ENSMUST00000121353 184 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Tubgcp4Q9D4F8 Mettl4-ps1-201ENSMUST00000127676 1272 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.2 ms