Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHD8

Rab11fip3, Rab11 family-interacting protein 3, mousemouse

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Length 1,047 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11fip3Q8CHD8 Pcdh15-202ENSMUST00000092420 6917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rab11fip3Q8CHD8 Nxf2-201ENSMUST00000010085 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rab11fip3Q8CHD8 Gm20287-201ENSMUST00000172848 2367 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Rab11fip3Q8CHD8 Cx3cr1-201ENSMUST00000064165 3753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rab11fip3Q8CHD8 Gabra6-203ENSMUST00000155218 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Rab11fip3Q8CHD8 Gm7792-201ENSMUST00000201555 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Rab11fip3Q8CHD8 Vmn1r34-202ENSMUST00000226262 2952 ntAPPRIS P1 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Rab11fip3Q8CHD8 Smad2-203ENSMUST00000113930 1305 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Rab11fip3Q8CHD8 Hsf3-204ENSMUST00000164693 2076 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Rab11fip3Q8CHD8 Vmn2r124-201ENSMUST00000176802 2568 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Rab11fip3Q8CHD8 AC154682.1-201ENSMUST00000225871 3124 ntAPPRIS P1 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Rab11fip3Q8CHD8 Gm19619-201ENSMUST00000200707 3201 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Rab11fip3Q8CHD8 Hmgn2l6-201ENSMUST00000115986 267 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Rab11fip3Q8CHD8 5033423K11Rik-201ENSMUST00000117311 787 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Rab11fip3Q8CHD8 Gm13214-201ENSMUST00000122137 408 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Rab11fip3Q8CHD8 Gm25906-201ENSMUST00000158489 126 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Rab11fip3Q8CHD8 Ppp1r2-ps9-201ENSMUST00000173100 549 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Rab11fip3Q8CHD8 Gm27225-201ENSMUST00000183833 557 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Rab11fip3Q8CHD8 Gm19739-201ENSMUST00000195941 153 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Rab11fip3Q8CHD8 Gm43390-201ENSMUST00000196614 421 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Rab11fip3Q8CHD8 Olfr27-201ENSMUST00000214052 1076 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Rab11fip3Q8CHD8 AC123944.2-201ENSMUST00000215290 382 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Rab11fip3Q8CHD8 Gm41002-201ENSMUST00000222479 312 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Rab11fip3Q8CHD8 AC099934.5-201ENSMUST00000222699 945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Rab11fip3Q8CHD8 AC154806.3-201ENSMUST00000227376 439 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Rab11fip3Q8CHD8 3830403N18Rik-201ENSMUST00000033458 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Rab11fip3Q8CHD8 Olfr767-201ENSMUST00000082131 1086 ntAPPRIS P1 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Rab11fip3Q8CHD8 Gm22807-201ENSMUST00000082737 129 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Rab11fip3Q8CHD8 Gm24525-201ENSMUST00000082917 151 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Rab11fip3Q8CHD8 Gm5152-202ENSMUST00000088625 417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Rab11fip3Q8CHD8 Olfr1087-201ENSMUST00000099877 942 ntAPPRIS P1 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Rab11fip3Q8CHD8 Gm44829-201ENSMUST00000208008 3193 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Rab11fip3Q8CHD8 Olfr1353-201ENSMUST00000039718 1992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Rab11fip3Q8CHD8 Olfr25-202ENSMUST00000212354 1362 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Rab11fip3Q8CHD8 Gm45179-201ENSMUST00000208452 4337 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Rab11fip3Q8CHD8 Fbxw13-201ENSMUST00000061456 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Rab11fip3Q8CHD8 Gm38590-202ENSMUST00000210654 1803 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Rab11fip3Q8CHD8 Cbx5-201ENSMUST00000108813 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Rab11fip3Q8CHD8 Clca1-201ENSMUST00000029919 3655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Rab11fip3Q8CHD8 Speer4a-201ENSMUST00000079447 2980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Rab11fip3Q8CHD8 Havcr2-201ENSMUST00000020668 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Rab11fip3Q8CHD8 Uty-204ENSMUST00000139365 4684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Rab11fip3Q8CHD8 Prr14l-201ENSMUST00000120129 9959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Rab11fip3Q8CHD8 Vmn1r71-209ENSMUST00000228526 5137 ntAPPRIS P2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Rab11fip3Q8CHD8 Glyat-202ENSMUST00000119960 3296 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Rab11fip3Q8CHD8 AC102847.2-201ENSMUST00000227799 2906 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Rab11fip3Q8CHD8 Vmn2r22-201ENSMUST00000170808 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Rab11fip3Q8CHD8 Slco1c1-203ENSMUST00000203140 2771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Rab11fip3Q8CHD8 Usp25-201ENSMUST00000023580 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Rab11fip3Q8CHD8 Gm15779-201ENSMUST00000117470 412 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Rab11fip3Q8CHD8 Gm8569-201ENSMUST00000117630 647 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Rab11fip3Q8CHD8 Gm12656-201ENSMUST00000118149 577 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Rab11fip3Q8CHD8 Rpl27-ps2-201ENSMUST00000120378 399 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Rab11fip3Q8CHD8 Gm11677-201ENSMUST00000121349 977 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Rab11fip3Q8CHD8 Gm12327-201ENSMUST00000121729 1168 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Rab11fip3Q8CHD8 Gm11575-201ENSMUST00000122243 228 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Rab11fip3Q8CHD8 Gm16373-201ENSMUST00000129517 303 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Rab11fip3Q8CHD8 Crem-216ENSMUST00000136961 807 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Rab11fip3Q8CHD8 Gm23205-201ENSMUST00000158671 103 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Rab11fip3Q8CHD8 Esp1-201ENSMUST00000161110 1049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Rab11fip3Q8CHD8 Gm17066-202ENSMUST00000165350 1113 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Rab11fip3Q8CHD8 Gm23872-201ENSMUST00000175432 77 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Rab11fip3Q8CHD8 Vmn1r10-201ENSMUST00000176073 936 ntAPPRIS P1 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Rab11fip3Q8CHD8 Arhgap39-209ENSMUST00000177026 371 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Rab11fip3Q8CHD8 Gm20795-201ENSMUST00000178528 699 ntAPPRIS P1 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Rab11fip3Q8CHD8 Gm38040-201ENSMUST00000193505 225 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Rab11fip3Q8CHD8 Gatad1-204ENSMUST00000196304 704 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Rab11fip3Q8CHD8 Pvrig-ps-201ENSMUST00000199472 204 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Rab11fip3Q8CHD8 Gm44580-201ENSMUST00000206333 877 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Rab11fip3Q8CHD8 Gm45830-201ENSMUST00000212945 344 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Rab11fip3Q8CHD8 AC132104.1-201ENSMUST00000213615 260 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Rab11fip3Q8CHD8 AC145731.1-201ENSMUST00000214083 344 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Rab11fip3Q8CHD8 AC138284.5-201ENSMUST00000214389 652 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Rab11fip3Q8CHD8 Gm46102-201ENSMUST00000217005 731 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Rab11fip3Q8CHD8 AC173345.3-201ENSMUST00000221245 1093 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Rab11fip3Q8CHD8 C2cd6b-201ENSMUST00000054653 878 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Rab11fip3Q8CHD8 Olfr664-201ENSMUST00000072887 966 ntAPPRIS P5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Rab11fip3Q8CHD8 Gm23511-201ENSMUST00000083084 164 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Rab11fip3Q8CHD8 Gm2245-201ENSMUST00000160698 3376 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Rab11fip3Q8CHD8 AC127371.2-201ENSMUST00000228108 1933 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Rab11fip3Q8CHD8 Olfr181-201ENSMUST00000075361 1391 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Rab11fip3Q8CHD8 Olfr1036-201ENSMUST00000164985 3203 ntAPPRIS P1 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Rab11fip3Q8CHD8 Omd-202ENSMUST00000221170 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Rab11fip3Q8CHD8 AC154755.2-201ENSMUST00000224384 2857 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Rab11fip3Q8CHD8 Mctp1-201ENSMUST00000109583 2283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.24
Rab11fip3Q8CHD8 Gm44288-201ENSMUST00000205061 2795 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Rab11fip3Q8CHD8 Enpp2-201ENSMUST00000041591 3095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Rab11fip3Q8CHD8 Gm36963-201ENSMUST00000193506 2324 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Rab11fip3Q8CHD8 Wrn-202ENSMUST00000033991 6262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Rab11fip3Q8CHD8 Trav12n-1-201ENSMUST00000103587 344 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Rab11fip3Q8CHD8 Gm14267-201ENSMUST00000119751 496 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Rab11fip3Q8CHD8 Gm15428-201ENSMUST00000121352 333 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Rab11fip3Q8CHD8 Gm11761-201ENSMUST00000121392 445 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Rab11fip3Q8CHD8 Gm12753-201ENSMUST00000152086 653 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Rab11fip3Q8CHD8 Gm15344-201ENSMUST00000152600 421 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Rab11fip3Q8CHD8 Gm25898-201ENSMUST00000158303 106 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Rab11fip3Q8CHD8 Gm27754-201ENSMUST00000183340 126 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Rab11fip3Q8CHD8 Trav12d-1-202ENSMUST00000183652 344 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Rab11fip3Q8CHD8 AV026068-202ENSMUST00000185793 486 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Rab11fip3Q8CHD8 Gm28054-201ENSMUST00000187280 872 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.9 ms