Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 1,455 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Gabrg2-202ENSMUST00000070735 2234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
Ccdc18Q640L5 Gabra6-201ENSMUST00000020703 2436 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
Ccdc18Q640L5 Ect2-202ENSMUST00000108298 4024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
Ccdc18Q640L5 Zfp37-207ENSMUST00000222748 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.27□□□□□ -1.09
Ccdc18Q640L5 Zfp78-206ENSMUST00000208390 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
Ccdc18Q640L5 Gm38190-201ENSMUST00000192350 4755 ntBASIC8.27□□□□□ -1.09
Ccdc18Q640L5 Gm24124-201ENSMUST00000104103 132 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
Ccdc18Q640L5 Olfr1149-ps1-201ENSMUST00000118232 691 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
Ccdc18Q640L5 Mir3620-201ENSMUST00000184710 61 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
Ccdc18Q640L5 Gm42640-201ENSMUST00000199792 1195 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
Ccdc18Q640L5 Gm44134-202ENSMUST00000204777 545 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
Ccdc18Q640L5 AC168881.1-201ENSMUST00000226018 430 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
Ccdc18Q640L5 H2al3-201ENSMUST00000057113 553 ntAPPRIS P1 BASIC8.26□□□□□ -1.09
Ccdc18Q640L5 Olfr390-204ENSMUST00000215161 3740 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.26□□□□□ -1.09
Ccdc18Q640L5 AC154329.1-201ENSMUST00000224408 3129 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
Ccdc18Q640L5 A2ml1-201ENSMUST00000060574 4695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Ccdc18Q640L5 Gm44242-201ENSMUST00000204212 2721 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
Ccdc18Q640L5 Gm36963-201ENSMUST00000193506 2324 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
Ccdc18Q640L5 B830042I05Rik-201ENSMUST00000208333 1620 ntTSL 5 BASIC8.26□□□□□ -1.09
Ccdc18Q640L5 Vmn2r102-201ENSMUST00000171741 2574 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.26□□□□□ -1.09
Ccdc18Q640L5 BB019430-202ENSMUST00000218015 1320 ntTSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Ccdc18Q640L5 AC125487.2-201ENSMUST00000219810 1300 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
Ccdc18Q640L5 Olfr1564-202ENSMUST00000208645 5213 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.26□□□□□ -1.09
Ccdc18Q640L5 Fbxw25-201ENSMUST00000163839 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Ccdc18Q640L5 4930533I22Rik-201ENSMUST00000176290 2564 ntTSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Ccdc18Q640L5 Tgif1-202ENSMUST00000118283 1388 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Ccdc18Q640L5 Fyttd1-202ENSMUST00000120345 648 ntTSL 5 BASIC8.26□□□□□ -1.09
Ccdc18Q640L5 Gm14037-201ENSMUST00000120576 313 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
Ccdc18Q640L5 Tex50-201ENSMUST00000135643 1192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.26□□□□□ -1.09
Ccdc18Q640L5 Gm26350-201ENSMUST00000157531 288 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
Ccdc18Q640L5 4930558K02Rik-202ENSMUST00000162676 983 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.26□□□□□ -1.09
Ccdc18Q640L5 Lgals1-ps1-201ENSMUST00000173500 368 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
Ccdc18Q640L5 Gm21070-201ENSMUST00000182425 985 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
Ccdc18Q640L5 Gm1000-201ENSMUST00000220520 801 ntTSL 3 BASIC8.26□□□□□ -1.09
Ccdc18Q640L5 AC158511.1-201ENSMUST00000223622 764 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
Ccdc18Q640L5 Vmn1r33-201ENSMUST00000079678 1036 ntAPPRIS P1 BASIC8.26□□□□□ -1.09
Ccdc18Q640L5 Snora52-201ENSMUST00000082732 137 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
Ccdc18Q640L5 1700057G04Rik-201ENSMUST00000098477 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Ccdc18Q640L5 Ccl28-201ENSMUST00000099241 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Ccdc18Q640L5 F13a1-201ENSMUST00000037491 3952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Ccdc18Q640L5 Cxcl11-202ENSMUST00000122808 3794 ntTSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Ccdc18Q640L5 Olfr338-201ENSMUST00000072114 5780 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.25□□□□□ -1.09
Ccdc18Q640L5 1500004A13Rik-203ENSMUST00000183966 3743 ntTSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Ccdc18Q640L5 AC168056.3-201ENSMUST00000225395 2540 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
Ccdc18Q640L5 Vmn1r209-203ENSMUST00000227265 6550 ntAPPRIS P1 BASIC8.25□□□□□ -1.09
Ccdc18Q640L5 Far1-202ENSMUST00000067929 4935 ntTSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Ccdc18Q640L5 Gm12633-201ENSMUST00000117742 1705 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
Ccdc18Q640L5 Olfr145-201ENSMUST00000086062 6796 ntAPPRIS P1 BASIC8.25□□□□□ -1.09
Ccdc18Q640L5 Virma-203ENSMUST00000108307 6571 ntTSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
Ccdc18Q640L5 Npy2r-202ENSMUST00000098997 3325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Ccdc18Q640L5 Gm15779-201ENSMUST00000117470 412 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
Ccdc18Q640L5 Gm23837-201ENSMUST00000122656 286 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
Ccdc18Q640L5 Gm15600-201ENSMUST00000153522 856 ntTSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Ccdc18Q640L5 Gm16321-201ENSMUST00000155184 574 ntTSL 3 BASIC8.25□□□□□ -1.09
Ccdc18Q640L5 Gm25224-201ENSMUST00000158195 68 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
Ccdc18Q640L5 Vmn1r-ps28-201ENSMUST00000174767 942 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
Ccdc18Q640L5 C4bp-ps1-201ENSMUST00000189393 706 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
Ccdc18Q640L5 Gm5734-201ENSMUST00000189787 913 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
Ccdc18Q640L5 Gm29000-207ENSMUST00000190152 1160 ntTSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
Ccdc18Q640L5 Obox4-ps32-201ENSMUST00000196512 537 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
Ccdc18Q640L5 Gm45702-201ENSMUST00000211856 644 ntTSL 2 BASIC8.25□□□□□ -1.09
Ccdc18Q640L5 Olfr1089-201ENSMUST00000214317 1118 ntAPPRIS P1 BASIC8.25□□□□□ -1.09
Ccdc18Q640L5 Ostn-201ENSMUST00000066852 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
Ccdc18Q640L5 Ttc33-202ENSMUST00000081640 1583 ntTSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
Ccdc18Q640L5 AC151904.4-201ENSMUST00000219868 1319 ntBASIC8.24□□□□□ -1.09
Ccdc18Q640L5 Olfr1062-203ENSMUST00000217481 3726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.09
Ccdc18Q640L5 Mcf2-203ENSMUST00000101531 3671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
Ccdc18Q640L5 Gm43961-201ENSMUST00000203289 1872 ntBASIC8.24□□□□□ -1.09
Ccdc18Q640L5 9230109A22Rik-202ENSMUST00000228644 1853 ntBASIC8.24□□□□□ -1.09
Ccdc18Q640L5 Trim6-201ENSMUST00000098180 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
Ccdc18Q640L5 Abi3bp-201ENSMUST00000048471 4687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
Ccdc18Q640L5 March1-205ENSMUST00000110255 4177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
Ccdc18Q640L5 Ralgapa2-202ENSMUST00000109986 11030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.09
Ccdc18Q640L5 Gm15206-201ENSMUST00000119143 454 ntBASIC8.24□□□□□ -1.09
Ccdc18Q640L5 Gm14664-201ENSMUST00000142919 437 ntTSL 3 BASIC8.24□□□□□ -1.09
Ccdc18Q640L5 Gm22804-201ENSMUST00000158052 101 ntBASIC8.24□□□□□ -1.09
Ccdc18Q640L5 Gm23046-201ENSMUST00000158369 284 ntBASIC8.24□□□□□ -1.09
Ccdc18Q640L5 Gm28859-201ENSMUST00000186650 616 ntBASIC8.24□□□□□ -1.09
Ccdc18Q640L5 Vezt-204ENSMUST00000119818 11138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
Ccdc18Q640L5 2210408I21Rik-201ENSMUST00000168779 5051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
Ccdc18Q640L5 Mier1-202ENSMUST00000097945 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
Ccdc18Q640L5 Olfr1382-203ENSMUST00000213707 4294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.09
Ccdc18Q640L5 Olfr1382-204ENSMUST00000213899 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.09
Ccdc18Q640L5 Olfr1382-205ENSMUST00000217564 4287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.09
Ccdc18Q640L5 AC139218.1-201ENSMUST00000228215 4287 ntBASIC8.24□□□□□ -1.09
Ccdc18Q640L5 Gm17101-201ENSMUST00000169520 1588 ntBASIC8.24□□□□□ -1.09
Ccdc18Q640L5 Dnah17-202ENSMUST00000084803 14889 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.09
Ccdc18Q640L5 Vmn1r200-205ENSMUST00000228726 5525 ntAPPRIS P2 BASIC8.23□□□□□ -1.09
Ccdc18Q640L5 Pum2-203ENSMUST00000111123 4984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
Ccdc18Q640L5 Tnfsf10-201ENSMUST00000046383 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
Ccdc18Q640L5 Pls3-203ENSMUST00000114058 3032 ntTSL 5 BASIC8.23□□□□□ -1.09
Ccdc18Q640L5 Gm3604-202ENSMUST00000187656 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
Ccdc18Q640L5 Zfp280c-201ENSMUST00000072292 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
Ccdc18Q640L5 AC120347.1-201ENSMUST00000223326 1639 ntBASIC8.23□□□□□ -1.09
Ccdc18Q640L5 Olfr771-202ENSMUST00000214271 2098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.23□□□□□ -1.09
Ccdc18Q640L5 Olfr465-ps1-201ENSMUST00000206324 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.23□□□□□ -1.09
Ccdc18Q640L5 Ptprz1-204ENSMUST00000202102 4947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
Ccdc18Q640L5 Gm14086-201ENSMUST00000117152 173 ntBASIC8.23□□□□□ -1.09
Ccdc18Q640L5 Gm14909-201ENSMUST00000117853 351 ntBASIC8.23□□□□□ -1.09
Ccdc18Q640L5 Gm14688-201ENSMUST00000119169 303 ntBASIC8.23□□□□□ -1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.8 ms