Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 AC153959.1-201ENSMUST00000213617 1694 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
Sft2d1Q5SSN7 Gm26650-204ENSMUST00000181881 2078 ntTSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
Sft2d1Q5SSN7 Nufip2-201ENSMUST00000100802 5158 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
Sft2d1Q5SSN7 Gm19744-204ENSMUST00000188936 4533 ntTSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
Sft2d1Q5SSN7 Olfr823-202ENSMUST00000213145 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
Sft2d1Q5SSN7 Vmn1r219-203ENSMUST00000227388 7948 ntAPPRIS P1 BASIC4.02□□□□□ -1.77
Sft2d1Q5SSN7 6720489N17Rik-202ENSMUST00000201563 2640 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
Sft2d1Q5SSN7 Gm29325-201ENSMUST00000190705 2528 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1012-203ENSMUST00000214958 3076 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.01□□□□□ -1.77
Sft2d1Q5SSN7 Gm37747-201ENSMUST00000193717 4003 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
Sft2d1Q5SSN7 AC156560.3-201ENSMUST00000222978 3841 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
Sft2d1Q5SSN7 Gm43062-201ENSMUST00000196302 1319 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
Sft2d1Q5SSN7 F13a1-201ENSMUST00000037491 3952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
Sft2d1Q5SSN7 Gm42842-201ENSMUST00000197736 3004 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
Sft2d1Q5SSN7 Gm44567-201ENSMUST00000205645 2631 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
Sft2d1Q5SSN7 Olfr111-202ENSMUST00000214259 2620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
Sft2d1Q5SSN7 Vmn1r43-203ENSMUST00000226741 12542 ntAPPRIS P1 BASIC4.01□□□□□ -1.77
Sft2d1Q5SSN7 Olfr588-ps1-201ENSMUST00000118682 4607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
Sft2d1Q5SSN7 Lipo5-201ENSMUST00000156818 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
Sft2d1Q5SSN7 Zfp950-207ENSMUST00000180544 2568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.01□□□□□ -1.77
Sft2d1Q5SSN7 Vmn1r52-202ENSMUST00000226520 3125 ntAPPRIS P1 BASIC4.01□□□□□ -1.77
Sft2d1Q5SSN7 Rps6ka3-204ENSMUST00000112493 3671 ntTSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
Sft2d1Q5SSN7 Mir700-201ENSMUST00000102169 79 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
Sft2d1Q5SSN7 Trav6n-6-201ENSMUST00000103613 287 ntAPPRIS P1 BASIC4.01□□□□□ -1.77
Sft2d1Q5SSN7 Gm12193-201ENSMUST00000117250 379 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
Sft2d1Q5SSN7 Gm14909-201ENSMUST00000117853 351 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
Sft2d1Q5SSN7 Gm13013-201ENSMUST00000119087 523 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
Sft2d1Q5SSN7 Gm15044-201ENSMUST00000120703 598 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
Sft2d1Q5SSN7 Gm12007-201ENSMUST00000120978 597 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
Sft2d1Q5SSN7 Gm22959-201ENSMUST00000122514 303 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
Sft2d1Q5SSN7 1700007M16Rik-201ENSMUST00000129075 435 ntTSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
Sft2d1Q5SSN7 Gm22601-201ENSMUST00000157595 250 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
Sft2d1Q5SSN7 Gm15795-201ENSMUST00000160969 553 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
Sft2d1Q5SSN7 Gm6434-201ENSMUST00000163316 372 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
Sft2d1Q5SSN7 Olfr92-201ENSMUST00000168659 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.01□□□□□ -1.77
Sft2d1Q5SSN7 Vmn1r-ps66-201ENSMUST00000173436 612 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
Sft2d1Q5SSN7 Gm29610-201ENSMUST00000187749 453 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
Sft2d1Q5SSN7 Gm3351-201ENSMUST00000193454 505 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
Sft2d1Q5SSN7 A730094K22Rik-201ENSMUST00000193867 740 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
Sft2d1Q5SSN7 Pvrig-ps-201ENSMUST00000199472 204 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
Sft2d1Q5SSN7 Gstm2-ps1-201ENSMUST00000201478 657 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
Sft2d1Q5SSN7 4933424M12Rik-202ENSMUST00000203451 1100 ntTSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
Sft2d1Q5SSN7 1300002E11Rik-206ENSMUST00000209728 701 ntTSL 2 BASIC4.01□□□□□ -1.77
Sft2d1Q5SSN7 Gm7351-201ENSMUST00000210745 580 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
Sft2d1Q5SSN7 Gm45646-201ENSMUST00000210983 441 ntTSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
Sft2d1Q5SSN7 Gm45820-201ENSMUST00000212068 362 ntTSL 3 BASIC4.01□□□□□ -1.77
Sft2d1Q5SSN7 AC137127.3-201ENSMUST00000213340 349 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
Sft2d1Q5SSN7 Fam228b-208ENSMUST00000219898 288 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.01□□□□□ -1.77
Sft2d1Q5SSN7 Gm18620-201ENSMUST00000222295 324 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
Sft2d1Q5SSN7 AC123534.1-201ENSMUST00000224060 656 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
Sft2d1Q5SSN7 Prl3d1-202ENSMUST00000225330 866 ntAPPRIS P2 BASIC4.01□□□□□ -1.77
Sft2d1Q5SSN7 AC131710.2-201ENSMUST00000226773 683 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1367-201ENSMUST00000059216 1055 ntAPPRIS P1 BASIC4.01□□□□□ -1.77
Sft2d1Q5SSN7 Oosp3-201ENSMUST00000069760 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
Sft2d1Q5SSN7 Olfr871-201ENSMUST00000073122 1147 ntAPPRIS P1 BASIC4.01□□□□□ -1.77
Sft2d1Q5SSN7 Gm25515-201ENSMUST00000083858 157 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
Sft2d1Q5SSN7 Olfr552-201ENSMUST00000098223 954 ntAPPRIS P1 BASIC4.01□□□□□ -1.77
Sft2d1Q5SSN7 Olfr994-201ENSMUST00000099925 945 ntAPPRIS P1 BASIC4.01□□□□□ -1.77
Sft2d1Q5SSN7 Elavl4-206ENSMUST00000106601 3775 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
Sft2d1Q5SSN7 Tenm1-203ENSMUST00000115059 12879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
Sft2d1Q5SSN7 Gm42661-201ENSMUST00000202364 1442 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
Sft2d1Q5SSN7 Gm42561-201ENSMUST00000202563 1442 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
Sft2d1Q5SSN7 Gm20756-202ENSMUST00000201324 1565 ntTSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
Sft2d1Q5SSN7 Dnah6-203ENSMUST00000114040 12513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
Sft2d1Q5SSN7 Zfp300-201ENSMUST00000040667 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1300-ps1-201ENSMUST00000208175 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
Sft2d1Q5SSN7 Gm42494-201ENSMUST00000196515 3051 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
Sft2d1Q5SSN7 Vmn2r7-202ENSMUST00000161972 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
Sft2d1Q5SSN7 B930086L07Rik-201ENSMUST00000209529 3738 ntBASIC4□□□□□ -1.77
Sft2d1Q5SSN7 Tlr6-201ENSMUST00000062315 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
Sft2d1Q5SSN7 Gm17131-201ENSMUST00000164420 3846 ntBASIC4□□□□□ -1.77
Sft2d1Q5SSN7 AC155921.1-201ENSMUST00000216568 3841 ntBASIC4□□□□□ -1.77
Sft2d1Q5SSN7 Olfr388-ps1-201ENSMUST00000118336 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
Sft2d1Q5SSN7 Vmn1r80-204ENSMUST00000227471 6368 ntBASIC4□□□□□ -1.77
Sft2d1Q5SSN7 Cdh10-201ENSMUST00000040562 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
Sft2d1Q5SSN7 Gm7834-201ENSMUST00000117560 437 ntBASIC4□□□□□ -1.77
Sft2d1Q5SSN7 Gm11517-201ENSMUST00000119491 387 ntBASIC4□□□□□ -1.77
Sft2d1Q5SSN7 Defa-ps14-201ENSMUST00000121373 418 ntBASIC4□□□□□ -1.77
Sft2d1Q5SSN7 Gm12267-201ENSMUST00000121609 761 ntBASIC4□□□□□ -1.77
Sft2d1Q5SSN7 Llph-ps2-201ENSMUST00000122000 393 ntBASIC4□□□□□ -1.77
Sft2d1Q5SSN7 Gm13174-201ENSMUST00000126141 220 ntTSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
Sft2d1Q5SSN7 4933416E14Rik-201ENSMUST00000130841 491 ntBASIC4□□□□□ -1.77
Sft2d1Q5SSN7 Snhg3-202ENSMUST00000141090 581 ntTSL 2 BASIC4□□□□□ -1.77
Sft2d1Q5SSN7 Gm11861-201ENSMUST00000141571 382 ntTSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
Sft2d1Q5SSN7 Sox5os3-202ENSMUST00000154167 765 ntTSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
Sft2d1Q5SSN7 Gm25389-201ENSMUST00000157340 286 ntBASIC4□□□□□ -1.77
Sft2d1Q5SSN7 Gm25430-201ENSMUST00000157614 289 ntBASIC4□□□□□ -1.77
Sft2d1Q5SSN7 Gm16298-201ENSMUST00000161107 420 ntBASIC4□□□□□ -1.77
Sft2d1Q5SSN7 B230216N24Rik-204ENSMUST00000161661 719 ntTSL 2 BASIC4□□□□□ -1.77
Sft2d1Q5SSN7 Gng2-206ENSMUST00000162425 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
Sft2d1Q5SSN7 Nedd8-202ENSMUST00000163750 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
Sft2d1Q5SSN7 Gm6673-201ENSMUST00000166114 700 ntBASIC4□□□□□ -1.77
Sft2d1Q5SSN7 Gm20530-201ENSMUST00000174261 254 ntBASIC4□□□□□ -1.77
Sft2d1Q5SSN7 Gm16378-201ENSMUST00000179168 342 ntBASIC4□□□□□ -1.77
Sft2d1Q5SSN7 S100a2-201ENSMUST00000179550 315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
Sft2d1Q5SSN7 Gm28614-201ENSMUST00000186483 458 ntBASIC4□□□□□ -1.77
Sft2d1Q5SSN7 Gm28962-201ENSMUST00000187993 621 ntTSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
Sft2d1Q5SSN7 Gm28692-202ENSMUST00000189645 621 ntTSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
Sft2d1Q5SSN7 Gm29282-201ENSMUST00000190720 473 ntTSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
Sft2d1Q5SSN7 Gm36983-201ENSMUST00000192280 1102 ntBASIC4□□□□□ -1.77
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