Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 680 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Gm28763-201ENSMUST00000188870 166 ntTSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
Sh3bp1P55194 Gm8419-201ENSMUST00000189886 412 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
Sh3bp1P55194 Gm29579-201ENSMUST00000190820 166 ntTSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
Sh3bp1P55194 Gm28639-201ENSMUST00000191519 481 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
Sh3bp1P55194 Gm43779-201ENSMUST00000196691 829 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
Sh3bp1P55194 Vmn1r-ps6-201ENSMUST00000201079 934 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
Sh3bp1P55194 Gm19900-201ENSMUST00000207285 576 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
Sh3bp1P55194 Gm17988-201ENSMUST00000208796 535 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
Sh3bp1P55194 Gm15839-202ENSMUST00000211219 664 ntTSL 3 BASIC6.11□□□□□ -1.43
Sh3bp1P55194 Ifitm6-203ENSMUST00000211330 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
Sh3bp1P55194 AC140409.4-201ENSMUST00000215757 538 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
Sh3bp1P55194 1700025K04Rik-201ENSMUST00000218075 1174 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
Sh3bp1P55194 AC132384.3-201ENSMUST00000219709 472 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
Sh3bp1P55194 4930549C15Rik-201ENSMUST00000221235 1260 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
Sh3bp1P55194 5033424D13Rik-201ENSMUST00000221779 648 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
Sh3bp1P55194 Gm6068-201ENSMUST00000222270 387 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
Sh3bp1P55194 AC137117.1-201ENSMUST00000226912 441 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
Sh3bp1P55194 AC154627.3-201ENSMUST00000228441 334 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
Sh3bp1P55194 Tas2r108-201ENSMUST00000038750 1013 ntAPPRIS P1 BASIC6.11□□□□□ -1.43
Sh3bp1P55194 Olfr816-201ENSMUST00000071605 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.11□□□□□ -1.43
Sh3bp1P55194 Dph3b-ps-201ENSMUST00000076359 246 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
Sh3bp1P55194 n-R5s69-201ENSMUST00000083872 119 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
Sh3bp1P55194 Defa-ps18-201ENSMUST00000098889 371 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
Sh3bp1P55194 Olfr1250-203ENSMUST00000215730 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
Sh3bp1P55194 Gm19136-201ENSMUST00000190706 2067 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
Sh3bp1P55194 Zfp799-201ENSMUST00000179695 5833 ntTSL 3 BASIC6.11□□□□□ -1.43
Sh3bp1P55194 AC115034.1-201ENSMUST00000215393 3846 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
Sh3bp1P55194 AC156632.1-201ENSMUST00000220626 3845 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
Sh3bp1P55194 Usp46-202ENSMUST00000119154 4738 ntTSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
Sh3bp1P55194 Phc3-209ENSMUST00000168645 10976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
Sh3bp1P55194 Olfr145-201ENSMUST00000086062 6796 ntAPPRIS P1 BASIC6.1□□□□□ -1.43
Sh3bp1P55194 Slco1b2-201ENSMUST00000042812 3307 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
Sh3bp1P55194 Gm38248-201ENSMUST00000193744 5783 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
Sh3bp1P55194 Gm17473-201ENSMUST00000180585 2216 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
Sh3bp1P55194 Olfr826-203ENSMUST00000216661 2858 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.1□□□□□ -1.43
Sh3bp1P55194 AC133076.2-201ENSMUST00000227678 3532 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
Sh3bp1P55194 Gm19125-201ENSMUST00000188408 1383 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
Sh3bp1P55194 Olfr870-202ENSMUST00000215984 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
Sh3bp1P55194 Gm38387-201ENSMUST00000191945 2577 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
Sh3bp1P55194 Gm12768-201ENSMUST00000120055 759 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
Sh3bp1P55194 Rpl27-ps2-201ENSMUST00000120378 399 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
Sh3bp1P55194 Mup-ps28-201ENSMUST00000120686 289 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
Sh3bp1P55194 Gm11369-201ENSMUST00000120812 318 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
Sh3bp1P55194 Gm14679-201ENSMUST00000121536 722 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
Sh3bp1P55194 Gm14695-201ENSMUST00000121721 282 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
Sh3bp1P55194 Gm12293-201ENSMUST00000121898 590 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
Sh3bp1P55194 Astx4d-201ENSMUST00000123136 1149 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
Sh3bp1P55194 Astx3-201ENSMUST00000123508 1150 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
Sh3bp1P55194 2210408F21Rik-203ENSMUST00000133510 429 ntTSL 3 BASIC6.1□□□□□ -1.43
Sh3bp1P55194 Olfr377-ps1-201ENSMUST00000134011 1136 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.1□□□□□ -1.43
Sh3bp1P55194 2210408F21Rik-206ENSMUST00000138653 417 ntTSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
Sh3bp1P55194 Il2ra-202ENSMUST00000150890 1013 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
Sh3bp1P55194 Gm22867-201ENSMUST00000157499 109 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
Sh3bp1P55194 Gm5795-202ENSMUST00000166275 612 ntTSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
Sh3bp1P55194 Gm8279-203ENSMUST00000170040 612 ntTSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
Sh3bp1P55194 Obox3-ps6-201ENSMUST00000176273 1005 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
Sh3bp1P55194 Astx4a-201ENSMUST00000177683 1149 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
Sh3bp1P55194 Astx1c-201ENSMUST00000177724 1150 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
Sh3bp1P55194 Gm10413-202ENSMUST00000177913 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.1□□□□□ -1.43
Sh3bp1P55194 Astx4c-201ENSMUST00000178390 1149 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
Sh3bp1P55194 Astx1b-201ENSMUST00000178608 1150 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
Sh3bp1P55194 Gm10338-202ENSMUST00000178623 612 ntTSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
Sh3bp1P55194 Astx2-201ENSMUST00000179135 1150 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
Sh3bp1P55194 Astx4b-201ENSMUST00000179359 1149 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
Sh3bp1P55194 Gm3012-202ENSMUST00000179486 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.1□□□□□ -1.43
Sh3bp1P55194 Astx1a-201ENSMUST00000179529 1150 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
Sh3bp1P55194 Astx5-201ENSMUST00000179723 1150 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
Sh3bp1P55194 Astx6-201ENSMUST00000180281 1150 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
Sh3bp1P55194 Gm7745-201ENSMUST00000182235 973 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
Sh3bp1P55194 Gm27024-201ENSMUST00000182561 755 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
Sh3bp1P55194 Gm26916-201ENSMUST00000183304 352 ntTSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
Sh3bp1P55194 1700121L03Rik-201ENSMUST00000187796 704 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
Sh3bp1P55194 Gm29409-202ENSMUST00000189623 901 ntTSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
Sh3bp1P55194 Ighv3-2-201ENSMUST00000191842 349 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
Sh3bp1P55194 Gm37187-201ENSMUST00000193425 341 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
Sh3bp1P55194 Ighv1-27-201ENSMUST00000194473 340 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
Sh3bp1P55194 Gm37830-201ENSMUST00000195282 837 ntTSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
Sh3bp1P55194 Tgif1-ps-201ENSMUST00000201864 736 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
Sh3bp1P55194 Gm42961-201ENSMUST00000202023 181 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
Sh3bp1P55194 Gm34149-201ENSMUST00000203547 304 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
Sh3bp1P55194 Gm4756-203ENSMUST00000208307 798 ntTSL 3 BASIC6.1□□□□□ -1.43
Sh3bp1P55194 Gm45710-201ENSMUST00000212847 215 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
Sh3bp1P55194 Glipr1l3-201ENSMUST00000220085 892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
Sh3bp1P55194 CU024892.1-201ENSMUST00000224869 515 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
Sh3bp1P55194 AC133203.2-201ENSMUST00000226709 464 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
Sh3bp1P55194 Olfr356-201ENSMUST00000095021 948 ntAPPRIS P1 BASIC6.1□□□□□ -1.43
Sh3bp1P55194 Gm35940-201ENSMUST00000213355 4797 ntTSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
Sh3bp1P55194 Senp8-202ENSMUST00000163586 3570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
Sh3bp1P55194 Gm43009-201ENSMUST00000199979 3566 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
Sh3bp1P55194 Klrb1f-201ENSMUST00000032257 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
Sh3bp1P55194 Clk4-203ENSMUST00000109113 1627 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
Sh3bp1P55194 Vmn2r-ps82-201ENSMUST00000174222 1641 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
Sh3bp1P55194 Gm9700-201ENSMUST00000193786 1617 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
Sh3bp1P55194 Gm16270-201ENSMUST00000160327 3238 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
Sh3bp1P55194 Olfr1348-207ENSMUST00000209029 2696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
Sh3bp1P55194 Gm8744-201ENSMUST00000204475 3581 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
Sh3bp1P55194 1700017N19Rik-203ENSMUST00000187119 1524 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
Sh3bp1P55194 Gm43648-201ENSMUST00000197775 2485 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
Sh3bp1P55194 Gm28322-201ENSMUST00000185627 1475 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
Sh3bp1P55194 Fbxw27-208ENSMUST00000212725 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.5 ms