Protein–RNA interactions for Protein: P0C1T1

Hoxb2, Homeobox protein Hox-B2, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb2P0C1T1 Gm12065-201ENSMUST00000149592 656 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Hoxb2P0C1T1 Gm23276-201ENSMUST00000157913 138 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Hoxb2P0C1T1 Gm16101-201ENSMUST00000160695 430 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Hoxb2P0C1T1 Skint1-203ENSMUST00000161389 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Hoxb2P0C1T1 Tmem258-204ENSMUST00000166412 447 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Hoxb2P0C1T1 Gm4202-201ENSMUST00000169025 733 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Hoxb2P0C1T1 Gm20701-201ENSMUST00000176082 347 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Hoxb2P0C1T1 Pid1-206ENSMUST00000176822 1119 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Hoxb2P0C1T1 Ap3m1-ps-201ENSMUST00000177652 1258 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Hoxb2P0C1T1 Gm21828-201ENSMUST00000178050 543 ntAPPRIS P1 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Hoxb2P0C1T1 Gm21866-201ENSMUST00000178428 543 ntAPPRIS P1 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Hoxb2P0C1T1 Gm21725-201ENSMUST00000178519 543 ntAPPRIS P1 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Hoxb2P0C1T1 Gm21800-201ENSMUST00000178559 543 ntAPPRIS P1 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Hoxb2P0C1T1 Gm24897-201ENSMUST00000179033 107 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Hoxb2P0C1T1 Gm21852-201ENSMUST00000179125 543 ntAPPRIS P1 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Hoxb2P0C1T1 Gm21764-201ENSMUST00000179219 543 ntAPPRIS P1 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Hoxb2P0C1T1 Gm21891-201ENSMUST00000179284 543 ntAPPRIS P1 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Hoxb2P0C1T1 Gm21904-201ENSMUST00000179522 543 ntAPPRIS P1 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Hoxb2P0C1T1 Gm26898-201ENSMUST00000181678 384 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Hoxb2P0C1T1 Ikzf2-209ENSMUST00000191262 1146 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Hoxb2P0C1T1 Ighv8-3-201ENSMUST00000194985 295 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Hoxb2P0C1T1 AC122844.1-201ENSMUST00000195971 107 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Hoxb2P0C1T1 Mir142-201ENSMUST00000198092 64 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Hoxb2P0C1T1 Gm43459-201ENSMUST00000202093 331 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Hoxb2P0C1T1 Gm5324-201ENSMUST00000208115 476 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Hoxb2P0C1T1 Gm19140-201ENSMUST00000209790 421 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Hoxb2P0C1T1 Gm45868-201ENSMUST00000210247 473 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Hoxb2P0C1T1 Gm45899-201ENSMUST00000212196 1276 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Hoxb2P0C1T1 Olfr1035-ps1-202ENSMUST00000213364 288 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Hoxb2P0C1T1 AC154296.2-201ENSMUST00000214696 545 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Hoxb2P0C1T1 Gm46203-201ENSMUST00000218130 478 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Hoxb2P0C1T1 CT009711.2-201ENSMUST00000225352 934 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Hoxb2P0C1T1 Gm4792-201ENSMUST00000065826 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Hoxb2P0C1T1 Ccr1l1-201ENSMUST00000071404 1166 ntAPPRIS P1 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Hoxb2P0C1T1 Olfr251-201ENSMUST00000072731 951 ntAPPRIS P2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Hoxb2P0C1T1 1700019M22Rik-201ENSMUST00000073560 354 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Hoxb2P0C1T1 Olfr960-201ENSMUST00000077060 1067 ntAPPRIS P2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Hoxb2P0C1T1 Gm25587-201ENSMUST00000082498 166 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Hoxb2P0C1T1 Gm24621-201ENSMUST00000082679 140 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Hoxb2P0C1T1 Mir425-201ENSMUST00000083645 85 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Hoxb2P0C1T1 Olfr599-201ENSMUST00000098201 1050 ntAPPRIS P1 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Hoxb2P0C1T1 Tial1-211ENSMUST00000165023 2003 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 AC153912.2-201ENSMUST00000215840 2015 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 Olfr134-202ENSMUST00000215900 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 Slco1c1-201ENSMUST00000032362 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 Hbp1-204ENSMUST00000175686 1315 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 Pomk-201ENSMUST00000061850 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 Olfr259-203ENSMUST00000215828 4095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 Gm28201-201ENSMUST00000189989 2166 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 Tnfsf4-201ENSMUST00000028024 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 Gm42661-201ENSMUST00000202364 1442 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 Gm42561-201ENSMUST00000202563 1442 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 BC067074-201ENSMUST00000078163 3546 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 Ralgapa2-205ENSMUST00000131824 5624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 Dsg1b-201ENSMUST00000076737 3965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 Tcp1-ps1-201ENSMUST00000120941 1466 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 Slc22a6-201ENSMUST00000010250 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 Nt5c3-202ENSMUST00000101367 1519 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 Cyp2j7-201ENSMUST00000162514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 Mef2c-228ENSMUST00000199450 2862 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 Gm43953-201ENSMUST00000203709 2867 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 Nif3l1-201ENSMUST00000087521 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 Gm38243-201ENSMUST00000194737 1567 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 Ndnf-201ENSMUST00000054351 10101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 Gm13040-201ENSMUST00000094521 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 Tm9sf4-201ENSMUST00000089027 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 Cldn12-202ENSMUST00000115445 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 Rapgef4os3-201ENSMUST00000132792 3485 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 Cyp2c66-201ENSMUST00000087234 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 Ubtfl1-201ENSMUST00000098973 1649 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 Clca4a-201ENSMUST00000029923 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 Pde1c-208ENSMUST00000170774 2132 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 Alg6-201ENSMUST00000097961 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 AC158988.1-201ENSMUST00000226731 2624 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 Dnah10-203ENSMUST00000141137 13862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 Htr2a-201ENSMUST00000036653 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 Gm14082-201ENSMUST00000118582 801 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 Gm7421-201ENSMUST00000119298 639 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 Gm7365-201ENSMUST00000120877 639 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 Gm15750-201ENSMUST00000120970 616 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 Gm7494-201ENSMUST00000121248 441 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 Gm11321-201ENSMUST00000121257 902 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 Gm14613-201ENSMUST00000122239 752 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 Gm15551-201ENSMUST00000132762 535 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 Gm12519-201ENSMUST00000134099 693 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 1700095A21Rik-201ENSMUST00000145269 1069 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 Gm12160-201ENSMUST00000146372 342 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 Gm23068-201ENSMUST00000158239 293 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 Vmn2r-ps111-201ENSMUST00000161565 241 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 Vmn2r-ps35-201ENSMUST00000169206 831 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 Gm5456-201ENSMUST00000170706 844 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 Gm17045-201ENSMUST00000178600 844 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 Gm21304-201ENSMUST00000180568 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 Gm21293-202ENSMUST00000180664 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 Gm21312-203ENSMUST00000181239 1185 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 Gm20765-203ENSMUST00000181707 1185 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 Gm28730-201ENSMUST00000185939 702 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 Gm29105-201ENSMUST00000187256 450 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 1700027A15Rik-202ENSMUST00000188349 617 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 Gm28078-201ENSMUST00000190381 874 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
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