Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Gm38574-201ENSMUST00000211855 640 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
Ccl20O89093 Gm21041-201ENSMUST00000214829 823 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
Ccl20O89093 Olfr628-202ENSMUST00000218266 951 ntAPPRIS P1 BASIC4.33□□□□□ -1.72
Ccl20O89093 AC131720.3-201ENSMUST00000219113 275 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
Ccl20O89093 4930452L12Rik-201ENSMUST00000220158 785 ntTSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
Ccl20O89093 CT010575.2-201ENSMUST00000222876 496 ntTSL 2 BASIC4.33□□□□□ -1.72
Ccl20O89093 CT025579.3-201ENSMUST00000224543 451 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
Ccl20O89093 AC154305.3-201ENSMUST00000224661 552 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
Ccl20O89093 C130073F10Rik-201ENSMUST00000051043 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
Ccl20O89093 Defb42-201ENSMUST00000067990 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
Ccl20O89093 Olfr1406-201ENSMUST00000072395 1063 ntAPPRIS P1 BASIC4.33□□□□□ -1.72
Ccl20O89093 Vmn1r216-201ENSMUST00000080253 1059 ntAPPRIS P1 BASIC4.33□□□□□ -1.72
Ccl20O89093 n-R5s170-201ENSMUST00000083726 113 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
Ccl20O89093 n-R5s3-201ENSMUST00000083879 112 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
Ccl20O89093 n-R5-8s1-201ENSMUST00000083988 148 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
Ccl20O89093 Olfr243-201ENSMUST00000098194 951 ntAPPRIS P1 BASIC4.33□□□□□ -1.72
Ccl20O89093 Smgc-201ENSMUST00000088555 2977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
Ccl20O89093 BC003331-204ENSMUST00000097547 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
Ccl20O89093 Ptprd-203ENSMUST00000098005 4542 ntTSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
Ccl20O89093 Zfyve9-203ENSMUST00000106658 5987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
Ccl20O89093 Ubqlnl-201ENSMUST00000059121 2298 ntAPPRIS P1 BASIC4.33□□□□□ -1.72
Ccl20O89093 Olfr1300-ps1-201ENSMUST00000208175 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
Ccl20O89093 Cd44-202ENSMUST00000060516 3495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
Ccl20O89093 Gm37677-201ENSMUST00000194520 7634 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
Ccl20O89093 Serpinb9b-201ENSMUST00000006392 3253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
Ccl20O89093 Bmp15-201ENSMUST00000024049 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
Ccl20O89093 Slc15a2-201ENSMUST00000023616 3993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
Ccl20O89093 Olfr610-203ENSMUST00000217627 1643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.32□□□□□ -1.72
Ccl20O89093 Gm1720-201ENSMUST00000135086 1503 ntTSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
Ccl20O89093 AC107232.1-201ENSMUST00000227785 1503 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
Ccl20O89093 Gm15624-203ENSMUST00000204811 3402 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
Ccl20O89093 Iqch-203ENSMUST00000163624 3339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
Ccl20O89093 Smarca2-220ENSMUST00000207054 2333 ntTSL 5 BASIC4.32□□□□□ -1.72
Ccl20O89093 Serpinb6c-202ENSMUST00000172184 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
Ccl20O89093 Ssmem1-201ENSMUST00000031797 1340 ntTSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
Ccl20O89093 Traj17-201ENSMUST00000103724 63 ntAPPRIS P1 BASIC4.32□□□□□ -1.72
Ccl20O89093 Klra7-204ENSMUST00000112013 1104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.32□□□□□ -1.72
Ccl20O89093 Gm12189-201ENSMUST00000119779 912 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
Ccl20O89093 Gm9428-201ENSMUST00000127214 769 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
Ccl20O89093 Tnfsf13os-202ENSMUST00000144033 578 ntTSL 5 BASIC4.32□□□□□ -1.72
Ccl20O89093 Gm7609-204ENSMUST00000161424 461 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
Ccl20O89093 Gm16094-201ENSMUST00000162784 427 ntTSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
Ccl20O89093 Gm21917-201ENSMUST00000177831 666 ntTSL 2 BASIC4.32□□□□□ -1.72
Ccl20O89093 Gm6055-201ENSMUST00000180532 378 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
Ccl20O89093 Gm26907-201ENSMUST00000181794 729 ntTSL 5 BASIC4.32□□□□□ -1.72
Ccl20O89093 Gm21803-201ENSMUST00000188897 693 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
Ccl20O89093 Gm18426-201ENSMUST00000191874 973 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
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Ccl20O89093 Trav7n-5-201ENSMUST00000199753 340 ntAPPRIS P1 BASIC4.32□□□□□ -1.72
Ccl20O89093 Gm43794-201ENSMUST00000200971 692 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
Ccl20O89093 Gm42761-201ENSMUST00000201899 738 ntTSL 3 BASIC4.32□□□□□ -1.72
Ccl20O89093 Gm43968-201ENSMUST00000203388 389 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
Ccl20O89093 Gm44571-201ENSMUST00000208092 533 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
Ccl20O89093 Olfr858-ps1-201ENSMUST00000212591 930 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
Ccl20O89093 Gm39384-201ENSMUST00000213703 743 ntTSL 5 BASIC4.32□□□□□ -1.72
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Ccl20O89093 AC153816.1-201ENSMUST00000217870 764 ntTSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
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Ccl20O89093 9530014B07Rik-201ENSMUST00000221882 744 ntTSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
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Ccl20O89093 Ssxb3-201ENSMUST00000089374 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
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Ccl20O89093 Adgrg2-204ENSMUST00000112402 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
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Ccl20O89093 Il5ra-202ENSMUST00000204659 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
Ccl20O89093 Trim30a-201ENSMUST00000076922 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
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Ccl20O89093 1700001G01Rik-201ENSMUST00000125117 1562 ntTSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
Ccl20O89093 Chek1-205ENSMUST00000173963 1509 ntTSL 5 BASIC4.31□□□□□ -1.72
Ccl20O89093 Arrdc3-205ENSMUST00000161441 1908 ntTSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
Ccl20O89093 Olfr745-202ENSMUST00000213127 1930 ntTSL 5 BASIC4.31□□□□□ -1.72
Ccl20O89093 Olfr495-202ENSMUST00000215215 2460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.31□□□□□ -1.72
Ccl20O89093 Gm40909-202ENSMUST00000223275 5564 ntTSL 5 BASIC4.31□□□□□ -1.72
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Ccl20O89093 Stxbp4-207ENSMUST00000143203 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
Ccl20O89093 Ighv1-39-201ENSMUST00000103515 351 ntAPPRIS P1 BASIC4.31□□□□□ -1.72
Ccl20O89093 Csn1s2b-203ENSMUST00000113279 745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
Ccl20O89093 Gm14659-201ENSMUST00000117667 843 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
Ccl20O89093 Gm15357-201ENSMUST00000119160 285 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
Ccl20O89093 Gm14330-201ENSMUST00000155455 455 ntTSL 5 BASIC4.31□□□□□ -1.72
Ccl20O89093 Cox6b2-202ENSMUST00000182048 465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
Ccl20O89093 Gm38217-201ENSMUST00000194358 910 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
Ccl20O89093 9430092D12Rik-201ENSMUST00000194937 1274 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
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Ccl20O89093 AL645522.1-201ENSMUST00000197692 104 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
Ccl20O89093 Gm2762-204ENSMUST00000201815 537 ntTSL 3 BASIC4.31□□□□□ -1.72
Ccl20O89093 Gm44992-209ENSMUST00000209680 1083 ntTSL 5 BASIC4.31□□□□□ -1.72
Ccl20O89093 AC132232.1-201ENSMUST00000214667 1019 ntTSL 3 BASIC4.31□□□□□ -1.72
Ccl20O89093 AC154634.3-201ENSMUST00000224589 736 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
Ccl20O89093 AC154576.2-203ENSMUST00000224736 253 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
Ccl20O89093 AC165106.3-201ENSMUST00000228191 3843 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
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