Protein–RNA interactions for Protein: A0A0N4SWI3

D6Ertd527e, DNA segment, Chr 6, ERATO Doi 527,-expressed, mousemouse

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Length 464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zbtb20-204ENSMUST00000114694 26901 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pls3-202ENSMUST00000114057 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Vmn1r71-206ENSMUST00000228098 7165 ntAPPRIS P2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm6558-201ENSMUST00000191934 1973 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dach2-204ENSMUST00000113380 2894 ntTSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Prg4-206ENSMUST00000161611 3821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lcp2-201ENSMUST00000052413 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Scml2-203ENSMUST00000077375 3550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mdm4-210ENSMUST00000188090 7105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Vmn2r57-201ENSMUST00000165029 2592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Spef2-201ENSMUST00000041840 4247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lpp-203ENSMUST00000115314 14854 ntTSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ceacam5-201ENSMUST00000081907 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Clk4-203ENSMUST00000109113 1627 ntTSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr895-202ENSMUST00000212156 1558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zfp143-201ENSMUST00000084727 3003 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 4930525G20Rik-201ENSMUST00000181912 2987 ntTSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Trpc5os-201ENSMUST00000155206 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zfp607a-203ENSMUST00000205715 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr1252-202ENSMUST00000213196 3331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rev3l-207ENSMUST00000164763 10399 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Vmn2r24-201ENSMUST00000075095 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm11844-201ENSMUST00000129207 459 ntTSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm29094-201ENSMUST00000138109 664 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.04□□□□□ -1.92
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm16125-201ENSMUST00000159003 339 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm8374-201ENSMUST00000163826 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 2310020H05Rik-201ENSMUST00000189489 720 ntTSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm37982-201ENSMUST00000193076 561 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AW551984-202ENSMUST00000119722 4224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Acsl4-204ENSMUST00000112907 5137 ntTSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nt5c3-202ENSMUST00000101367 1519 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Chrna6-201ENSMUST00000033882 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sirpb1a-201ENSMUST00000099201 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.92
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Epha3-201ENSMUST00000064405 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Wdr17-206ENSMUST00000144711 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fat1-201ENSMUST00000098796 14627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.92
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rtl9-201ENSMUST00000165829 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zscan4c-201ENSMUST00000131379 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Bclaf1-201ENSMUST00000043881 5437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm32592-201ENSMUST00000205146 3124 ntTSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 A830019P07Rik-201ENSMUST00000178904 1777 ntTSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ktn1-207ENSMUST00000186761 3902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.92
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Scgb2b3-201ENSMUST00000108090 339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Vmn1r-ps99-201ENSMUST00000120067 766 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm12854-201ENSMUST00000128518 297 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm15787-203ENSMUST00000130892 1250 ntTSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 1700123O12Rik-204ENSMUST00000146783 577 ntTSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 5730412P04Rik-201ENSMUST00000147100 1149 ntTSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.92
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm13617-201ENSMUST00000155350 675 ntTSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm6647-201ENSMUST00000170514 641 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rian-217ENSMUST00000183266 687 ntTSL 3 BASIC3.03□□□□□ -1.92
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