Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Zscan4f-202ENSMUST00000145237 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
Col5a3Q9JLI2 Itpr2-201ENSMUST00000053273 8331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
Col5a3Q9JLI2 Lair1-203ENSMUST00000086401 2496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
Col5a3Q9JLI2 AC125095.1-201ENSMUST00000228387 2020 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Col5a3Q9JLI2 Heph-203ENSMUST00000113838 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
Col5a3Q9JLI2 Mug-ps1-201ENSMUST00000186891 4386 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Col5a3Q9JLI2 Gm37779-201ENSMUST00000194221 3380 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Col5a3Q9JLI2 Tcf4-202ENSMUST00000078486 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
Col5a3Q9JLI2 Gm43281-201ENSMUST00000202522 2704 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Col5a3Q9JLI2 Olfr270-204ENSMUST00000215127 3145 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
Col5a3Q9JLI2 Slco1a1-202ENSMUST00000168119 3904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
Col5a3Q9JLI2 Pcdh15-234ENSMUST00000191854 9104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
Col5a3Q9JLI2 Naip2-201ENSMUST00000067975 4709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
Col5a3Q9JLI2 Olfr270-203ENSMUST00000215010 2502 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
Col5a3Q9JLI2 Gm45644-201ENSMUST00000210255 2740 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
Col5a3Q9JLI2 Mdm4-ps-201ENSMUST00000121299 6514 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
Col5a3Q9JLI2 Exph5-201ENSMUST00000051014 5957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
Col5a3Q9JLI2 Ceacam13-202ENSMUST00000108488 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
Col5a3Q9JLI2 Gm23837-201ENSMUST00000122656 286 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
Col5a3Q9JLI2 Gm15288-201ENSMUST00000126640 653 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
Col5a3Q9JLI2 Gm24363-201ENSMUST00000158440 311 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
Col5a3Q9JLI2 Gm28129-201ENSMUST00000186273 537 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
Col5a3Q9JLI2 AC139758.1-201ENSMUST00000226573 930 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
Col5a3Q9JLI2 Olfr480-201ENSMUST00000071658 1029 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
Col5a3Q9JLI2 Olfr1537-201ENSMUST00000073248 945 ntAPPRIS P2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
Col5a3Q9JLI2 Olfr881-201ENSMUST00000074611 948 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
Col5a3Q9JLI2 Gm4922-201ENSMUST00000055107 1950 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
Col5a3Q9JLI2 Cfap54-211ENSMUST00000212902 9516 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
Col5a3Q9JLI2 Vmn2r2-202ENSMUST00000177151 2727 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
Col5a3Q9JLI2 Olfr1188-202ENSMUST00000217131 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
Col5a3Q9JLI2 Gm37137-201ENSMUST00000195138 2684 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
Col5a3Q9JLI2 Cntn4-206ENSMUST00000113264 5262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
Col5a3Q9JLI2 Ppip5k2-205ENSMUST00000171129 3425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
Col5a3Q9JLI2 Ccar1-211ENSMUST00000219527 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
Col5a3Q9JLI2 AC160028.2-201ENSMUST00000218937 2519 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
Col5a3Q9JLI2 Eya4-201ENSMUST00000074366 3488 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
Col5a3Q9JLI2 Scn3a-202ENSMUST00000100069 8550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
Col5a3Q9JLI2 AC121870.1-201ENSMUST00000216279 4879 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
Col5a3Q9JLI2 Gm12717-201ENSMUST00000118427 983 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
Col5a3Q9JLI2 Gm12237-201ENSMUST00000120158 470 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
Col5a3Q9JLI2 Gm13000-201ENSMUST00000120937 496 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
Col5a3Q9JLI2 Gm12752-201ENSMUST00000121657 811 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
Col5a3Q9JLI2 Gm16107-201ENSMUST00000162523 862 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
Col5a3Q9JLI2 Cox6b2-202ENSMUST00000182048 465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
Col5a3Q9JLI2 Rps27a-ps1-201ENSMUST00000191424 463 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
Col5a3Q9JLI2 Gm37581-201ENSMUST00000192371 988 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
Col5a3Q9JLI2 Gm37220-201ENSMUST00000195179 415 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
Col5a3Q9JLI2 Gm38825-201ENSMUST00000204022 648 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
Col5a3Q9JLI2 1700054O05Rik-201ENSMUST00000214107 555 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
Col5a3Q9JLI2 Olfr765-201ENSMUST00000071559 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.37□□□□□ -1.55
Col5a3Q9JLI2 Sytl2-202ENSMUST00000107210 3718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
Col5a3Q9JLI2 Mapk10-203ENSMUST00000112847 7196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
Col5a3Q9JLI2 6330410L21Rik-201ENSMUST00000199846 3871 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Col5a3Q9JLI2 Pramef8-202ENSMUST00000059790 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Col5a3Q9JLI2 Ostn-201ENSMUST00000066852 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Col5a3Q9JLI2 Pole-201ENSMUST00000007296 7163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Col5a3Q9JLI2 Zfp760-201ENSMUST00000073312 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Col5a3Q9JLI2 Gm43870-201ENSMUST00000205102 4369 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Col5a3Q9JLI2 Olfr190-203ENSMUST00000216495 8240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Col5a3Q9JLI2 Kat6a-202ENSMUST00000110696 9041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Col5a3Q9JLI2 1500005C15Rik-201ENSMUST00000199867 2394 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Col5a3Q9JLI2 Arrdc3-205ENSMUST00000161441 1908 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Col5a3Q9JLI2 Msr1-202ENSMUST00000170091 3636 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Col5a3Q9JLI2 Gm37509-201ENSMUST00000194867 3169 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Col5a3Q9JLI2 Pclo-201ENSMUST00000030691 20084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
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Col5a3Q9JLI2 Vmn1r171-213ENSMUST00000228681 2633 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Col5a3Q9JLI2 Fras1-201ENSMUST00000036019 15848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Col5a3Q9JLI2 Kcnma1-204ENSMUST00000112423 3664 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Col5a3Q9JLI2 Fabp12-202ENSMUST00000117917 648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Col5a3Q9JLI2 Gm12807-201ENSMUST00000121546 962 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Col5a3Q9JLI2 Gm15591-201ENSMUST00000138539 627 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Col5a3Q9JLI2 4930547E08Rik-201ENSMUST00000143559 541 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Col5a3Q9JLI2 Skint1-205ENSMUST00000162885 603 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
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Col5a3Q9JLI2 Gm9134-201ENSMUST00000193186 551 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Col5a3Q9JLI2 Gm43678-201ENSMUST00000197774 328 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Col5a3Q9JLI2 Gm33050-201ENSMUST00000198132 501 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Col5a3Q9JLI2 Gm42640-201ENSMUST00000199792 1195 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Col5a3Q9JLI2 Gm44738-201ENSMUST00000206393 371 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Col5a3Q9JLI2 Olfr858-ps1-201ENSMUST00000212591 930 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Col5a3Q9JLI2 AC164087.1-201ENSMUST00000215174 733 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Col5a3Q9JLI2 AC132384.6-201ENSMUST00000218976 1206 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Col5a3Q9JLI2 Olfr904-201ENSMUST00000058153 933 ntAPPRIS P1 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Col5a3Q9JLI2 Olfr738-201ENSMUST00000058972 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Col5a3Q9JLI2 Fam183b-201ENSMUST00000060581 493 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Col5a3Q9JLI2 Gm23928-201ENSMUST00000082469 145 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Col5a3Q9JLI2 Olfr1275-201ENSMUST00000099620 1020 ntAPPRIS P1 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Col5a3Q9JLI2 Ugt2b1-201ENSMUST00000031183 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Col5a3Q9JLI2 Gm6503-201ENSMUST00000210829 2225 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Col5a3Q9JLI2 Spag9-203ENSMUST00000075695 6910 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Col5a3Q9JLI2 Gm43654-201ENSMUST00000200664 3417 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Col5a3Q9JLI2 Mef2c-223ENSMUST00000199105 4361 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Col5a3Q9JLI2 Mmp1a-201ENSMUST00000034492 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Col5a3Q9JLI2 Gm38368-201ENSMUST00000193181 1335 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Col5a3Q9JLI2 Gm45311-201ENSMUST00000211086 1330 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Col5a3Q9JLI2 Slc22a27-202ENSMUST00000182102 1801 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Col5a3Q9JLI2 Tenm4-203ENSMUST00000107166 13172 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Col5a3Q9JLI2 Obox4-ps27-201ENSMUST00000179203 1362 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 101.1 ms