Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEG8

Usp27, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 27, mousemouse

Predictions only

Length 438 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp27Q8CEG8 Gm25758-201ENSMUST00000103987 129 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Usp27Q8CEG8 Gm11011-201ENSMUST00000109160 258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
Usp27Q8CEG8 Rag2-202ENSMUST00000111227 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
Usp27Q8CEG8 Gm15166-201ENSMUST00000120790 385 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Usp27Q8CEG8 Gm14302-201ENSMUST00000122806 382 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
Usp27Q8CEG8 Gm16220-201ENSMUST00000131874 405 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
Usp27Q8CEG8 Gm23774-201ENSMUST00000158990 131 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Usp27Q8CEG8 Gm17142-201ENSMUST00000164933 645 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Usp27Q8CEG8 Gm17160-201ENSMUST00000170645 260 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
Usp27Q8CEG8 Gm4617-201ENSMUST00000178993 331 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Usp27Q8CEG8 Gm16617-201ENSMUST00000181008 675 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
Usp27Q8CEG8 Mir6417-201ENSMUST00000183815 116 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Usp27Q8CEG8 Gm6260-202ENSMUST00000197170 921 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
Usp27Q8CEG8 Gm43522-202ENSMUST00000200185 442 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
Usp27Q8CEG8 Gm43262-201ENSMUST00000202970 1219 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
Usp27Q8CEG8 Gm45343-201ENSMUST00000210452 828 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Usp27Q8CEG8 AC166323.1-201ENSMUST00000217756 367 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Usp27Q8CEG8 Gm5750-201ENSMUST00000218711 801 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Usp27Q8CEG8 AC153548.2-201ENSMUST00000219770 885 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Usp27Q8CEG8 AC121569.1-201ENSMUST00000221043 3666 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
Usp27Q8CEG8 AC154806.3-201ENSMUST00000227376 439 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Usp27Q8CEG8 Glod5-201ENSMUST00000033503 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
Usp27Q8CEG8 Olfr577-201ENSMUST00000051505 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.27□□□□□ -1.57
Usp27Q8CEG8 Gm24525-201ENSMUST00000082917 151 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Usp27Q8CEG8 Olfr598-201ENSMUST00000098202 960 ntAPPRIS P1 BASIC5.27□□□□□ -1.57
Usp27Q8CEG8 Vmn1r6-205ENSMUST00000227631 7805 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
Usp27Q8CEG8 Olfr1487-205ENSMUST00000217061 4080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
Usp27Q8CEG8 Spef2-206ENSMUST00000208854 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
Usp27Q8CEG8 Stxbp4-207ENSMUST00000143203 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
Usp27Q8CEG8 Vmn2r3-201ENSMUST00000170244 2670 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
Usp27Q8CEG8 Gm37890-201ENSMUST00000195610 3992 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Usp27Q8CEG8 4930579C12Rik-202ENSMUST00000187015 3676 ntTSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
Usp27Q8CEG8 AI481877-201ENSMUST00000107547 4664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
Usp27Q8CEG8 Vmn1r189-202ENSMUST00000227357 3245 ntAPPRIS P1 BASIC5.27□□□□□ -1.57
Usp27Q8CEG8 Vmn1r189-203ENSMUST00000228428 3231 ntAPPRIS P1 BASIC5.27□□□□□ -1.57
Usp27Q8CEG8 4932411K12Rik-201ENSMUST00000190493 3156 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
Usp27Q8CEG8 Vmn1r214-202ENSMUST00000227236 3892 ntAPPRIS P1 BASIC5.26□□□□□ -1.57
Usp27Q8CEG8 Cnot1-202ENSMUST00000098473 8390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
Usp27Q8CEG8 Gm42440-201ENSMUST00000197906 2284 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Usp27Q8CEG8 Gm38243-201ENSMUST00000194737 1567 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Usp27Q8CEG8 4930539J05Rik-201ENSMUST00000181619 1406 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Usp27Q8CEG8 Gm5662-201ENSMUST00000101168 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Usp27Q8CEG8 Gm23593-201ENSMUST00000104309 120 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Usp27Q8CEG8 Olfr359-ps1-201ENSMUST00000115977 926 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Usp27Q8CEG8 Cnep1r1-202ENSMUST00000117775 728 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
Usp27Q8CEG8 Gm12267-201ENSMUST00000121609 761 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Usp27Q8CEG8 Gm7973-201ENSMUST00000122107 488 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Usp27Q8CEG8 Gm26490-201ENSMUST00000157879 140 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Usp27Q8CEG8 Gm3216-201ENSMUST00000166927 486 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Usp27Q8CEG8 Gm3141-201ENSMUST00000168726 499 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Usp27Q8CEG8 Gm26693-201ENSMUST00000181318 1021 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Usp27Q8CEG8 Mir6903-201ENSMUST00000183597 88 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Usp27Q8CEG8 Gm28429-201ENSMUST00000188521 363 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Usp27Q8CEG8 Gm37932-201ENSMUST00000192258 1167 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Usp27Q8CEG8 Gm37184-201ENSMUST00000194720 650 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
Usp27Q8CEG8 Gm43712-201ENSMUST00000198020 291 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Usp27Q8CEG8 Gm43100-201ENSMUST00000202985 674 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
Usp27Q8CEG8 Gm19174-201ENSMUST00000216944 956 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Usp27Q8CEG8 Gm19168-201ENSMUST00000218804 1091 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Usp27Q8CEG8 5033424D13Rik-201ENSMUST00000221779 648 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Usp27Q8CEG8 3830408C21Rik-203ENSMUST00000224293 822 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Usp27Q8CEG8 Defa34-201ENSMUST00000075268 375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
Usp27Q8CEG8 Defa5-201ENSMUST00000098892 376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Usp27Q8CEG8 Zfp975-201ENSMUST00000107992 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Usp27Q8CEG8 Gm13575-201ENSMUST00000142353 1520 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Usp27Q8CEG8 Abca12-201ENSMUST00000087268 9137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Usp27Q8CEG8 Olfr459-202ENSMUST00000214752 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
Usp27Q8CEG8 Adam5-205ENSMUST00000209935 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Usp27Q8CEG8 Gm34885-201ENSMUST00000217440 4070 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Usp27Q8CEG8 Mageb16-202ENSMUST00000114016 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Usp27Q8CEG8 Olfr126-202ENSMUST00000213844 1958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Usp27Q8CEG8 Ogt-202ENSMUST00000119299 3840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Usp27Q8CEG8 AC127371.2-201ENSMUST00000228108 1933 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Usp27Q8CEG8 Rbm44-201ENSMUST00000094698 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Usp27Q8CEG8 Scn1a-204ENSMUST00000112371 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Usp27Q8CEG8 Olfr1260-202ENSMUST00000111512 4226 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Usp27Q8CEG8 Tfec-201ENSMUST00000031533 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Usp27Q8CEG8 Rbm41-204ENSMUST00000113011 3728 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Usp27Q8CEG8 Gm1720-201ENSMUST00000135086 1503 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Usp27Q8CEG8 Gm22273-201ENSMUST00000104040 132 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Usp27Q8CEG8 Zfp965-202ENSMUST00000109042 1271 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Usp27Q8CEG8 Gm13681-201ENSMUST00000117925 210 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Usp27Q8CEG8 Gm12189-201ENSMUST00000119779 912 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Usp27Q8CEG8 Gm11677-201ENSMUST00000121349 977 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Usp27Q8CEG8 Gm11894-201ENSMUST00000121579 328 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Usp27Q8CEG8 Zfp973-202ENSMUST00000121956 1271 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Usp27Q8CEG8 Tnfaip8-203ENSMUST00000126666 906 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Usp27Q8CEG8 Gm15600-201ENSMUST00000153522 856 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Usp27Q8CEG8 Gm25824-201ENSMUST00000157092 121 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Usp27Q8CEG8 Scarna13-201ENSMUST00000158164 275 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Usp27Q8CEG8 Scarna6-201ENSMUST00000158656 265 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Usp27Q8CEG8 Gm16112-201ENSMUST00000159075 382 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Usp27Q8CEG8 Kcne1-202ENSMUST00000166707 601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Usp27Q8CEG8 Trav6-5-202ENSMUST00000183488 335 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Usp27Q8CEG8 Mir7006-201ENSMUST00000183624 69 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Usp27Q8CEG8 Gm27855-201ENSMUST00000184122 128 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Usp27Q8CEG8 Gm28319-201ENSMUST00000189560 226 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Usp27Q8CEG8 Gm18036-201ENSMUST00000195256 272 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Usp27Q8CEG8 Gm9332-201ENSMUST00000198431 730 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Usp27Q8CEG8 Gm44969-201ENSMUST00000207829 549 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.1 ms