Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF1

Dsg1b, Desmoglein-1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1bQ7TSF1 Pramef8-201ENSMUST00000037356 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Dsg1bQ7TSF1 BC046251-201ENSMUST00000154632 3653 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Dsg1bQ7TSF1 Yae1d1-201ENSMUST00000099735 8744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Dsg1bQ7TSF1 Zranb3-203ENSMUST00000112538 4741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Dsg1bQ7TSF1 Ogdh-201ENSMUST00000003461 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Dsg1bQ7TSF1 Olfr703-202ENSMUST00000216254 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Dsg1bQ7TSF1 AC113031.7-201ENSMUST00000228609 1928 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Dsg1bQ7TSF1 Gm7982-202ENSMUST00000136313 1536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Dsg1bQ7TSF1 Gm29461-201ENSMUST00000189232 4176 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Dsg1bQ7TSF1 Serpinb5-201ENSMUST00000086701 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Dsg1bQ7TSF1 Vmn1r52-204ENSMUST00000227578 2370 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Dsg1bQ7TSF1 Igsf10-203ENSMUST00000194546 8393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Dsg1bQ7TSF1 Vangl1-202ENSMUST00000159388 3207 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Dsg1bQ7TSF1 AC167192.3-201ENSMUST00000224096 1567 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Dsg1bQ7TSF1 Dmtf1-202ENSMUST00000095017 3498 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Dsg1bQ7TSF1 Add3-201ENSMUST00000025999 4334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Dsg1bQ7TSF1 Anks4b-201ENSMUST00000033201 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Dsg1bQ7TSF1 Trrap-201ENSMUST00000038980 12344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Dsg1bQ7TSF1 4930430A15Rik-201ENSMUST00000028577 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Dsg1bQ7TSF1 Gm10727-201ENSMUST00000197107 1602 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Dsg1bQ7TSF1 AC131747.2-201ENSMUST00000226121 1895 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Dsg1bQ7TSF1 Asap1-208ENSMUST00000176014 3435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Dsg1bQ7TSF1 Celf2-226ENSMUST00000183209 3852 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Dsg1bQ7TSF1 Gm37541-201ENSMUST00000192464 2315 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Dsg1bQ7TSF1 Vmn2r58-201ENSMUST00000171671 2589 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Dsg1bQ7TSF1 Errfi1-202ENSMUST00000073600 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Dsg1bQ7TSF1 Mdm4-202ENSMUST00000067429 3490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Dsg1bQ7TSF1 AC098728.1-202ENSMUST00000226656 2198 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Dsg1bQ7TSF1 Zscan4e-201ENSMUST00000166753 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Dsg1bQ7TSF1 Cfap221-202ENSMUST00000174370 2871 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Dsg1bQ7TSF1 Spire1-202ENSMUST00000082243 4950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Dsg1bQ7TSF1 Gm25876-201ENSMUST00000104329 119 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Dsg1bQ7TSF1 Gm12937-201ENSMUST00000118333 448 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Dsg1bQ7TSF1 Gm14018-201ENSMUST00000119042 455 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Dsg1bQ7TSF1 Gm13604-201ENSMUST00000119332 482 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Dsg1bQ7TSF1 1700026D11Rik-203ENSMUST00000144501 535 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Dsg1bQ7TSF1 Gm23894-201ENSMUST00000158107 313 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Dsg1bQ7TSF1 Gm25374-201ENSMUST00000158158 101 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Dsg1bQ7TSF1 Gm23852-201ENSMUST00000158376 77 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Dsg1bQ7TSF1 Gm10074-201ENSMUST00000174543 249 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Dsg1bQ7TSF1 Gm22548-201ENSMUST00000174899 78 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Dsg1bQ7TSF1 Gm498-203ENSMUST00000179036 990 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Dsg1bQ7TSF1 Mir6367-201ENSMUST00000183385 102 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Dsg1bQ7TSF1 Gm17847-201ENSMUST00000188261 1127 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Dsg1bQ7TSF1 Lax1-202ENSMUST00000189524 628 ntTSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Dsg1bQ7TSF1 Gm18291-201ENSMUST00000190791 301 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Dsg1bQ7TSF1 Gm37203-201ENSMUST00000191618 385 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Dsg1bQ7TSF1 Gm37974-201ENSMUST00000193668 220 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Dsg1bQ7TSF1 Gm31415-201ENSMUST00000194963 344 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Dsg1bQ7TSF1 Gm18867-201ENSMUST00000198022 1179 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Dsg1bQ7TSF1 Olrf445-ps1-201ENSMUST00000204960 314 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Dsg1bQ7TSF1 Gm7039-201ENSMUST00000205138 346 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Dsg1bQ7TSF1 Lair1-209ENSMUST00000205296 412 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Dsg1bQ7TSF1 Med7-201ENSMUST00000020665 1193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Dsg1bQ7TSF1 Gm35453-201ENSMUST00000210304 331 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Dsg1bQ7TSF1 Gm18103-201ENSMUST00000216621 779 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Dsg1bQ7TSF1 Gm19599-201ENSMUST00000218898 358 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Dsg1bQ7TSF1 CT025598.1-201ENSMUST00000225140 427 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Dsg1bQ7TSF1 AC140451.2-202ENSMUST00000226156 574 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Dsg1bQ7TSF1 CT009556.1-201ENSMUST00000227282 449 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Dsg1bQ7TSF1 Olfr670-201ENSMUST00000050482 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Dsg1bQ7TSF1 Akr1c19-201ENSMUST00000081326 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Dsg1bQ7TSF1 Mup8-201ENSMUST00000095058 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Dsg1bQ7TSF1 Gm10540-201ENSMUST00000097581 276 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Dsg1bQ7TSF1 Stk4-202ENSMUST00000088291 4098 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Dsg1bQ7TSF1 Plekhg1-201ENSMUST00000042438 7190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Dsg1bQ7TSF1 4930568G15Rik-201ENSMUST00000193317 3218 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Dsg1bQ7TSF1 Gm20707-201ENSMUST00000176201 2516 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Dsg1bQ7TSF1 AC154406.1-201ENSMUST00000215220 2529 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Dsg1bQ7TSF1 Sox6-204ENSMUST00000166877 8079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Dsg1bQ7TSF1 AC154511.1-201ENSMUST00000222578 1587 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Dsg1bQ7TSF1 Sytl2-207ENSMUST00000190837 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Dsg1bQ7TSF1 Clec2i-203ENSMUST00000159866 2330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Dsg1bQ7TSF1 Gm38124-201ENSMUST00000191710 2581 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Dsg1bQ7TSF1 Mnd1-ps-202ENSMUST00000224435 2574 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Dsg1bQ7TSF1 AC165080.3-201ENSMUST00000217162 3116 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Dsg1bQ7TSF1 Vmn1r5-202ENSMUST00000226130 3393 ntAPPRIS P1 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Dsg1bQ7TSF1 Tsga10-201ENSMUST00000041815 3400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Dsg1bQ7TSF1 March1-208ENSMUST00000110259 3181 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Dsg1bQ7TSF1 Xrn1-201ENSMUST00000034981 5499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Dsg1bQ7TSF1 2700078F05Rik-201ENSMUST00000194331 3244 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
Dsg1bQ7TSF1 Olfr308-202ENSMUST00000214977 4991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
Dsg1bQ7TSF1 Unc13c-201ENSMUST00000075245 6633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
Dsg1bQ7TSF1 Vmn2r-ps133-201ENSMUST00000176979 2569 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
Dsg1bQ7TSF1 1810064F22Rik-203ENSMUST00000188595 2307 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
Dsg1bQ7TSF1 Nt5c3-202ENSMUST00000101367 1519 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
Dsg1bQ7TSF1 Gm37911-201ENSMUST00000193099 1545 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
Dsg1bQ7TSF1 Olfr119-201ENSMUST00000080483 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
Dsg1bQ7TSF1 A930004J17Rik-201ENSMUST00000192689 4610 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
Dsg1bQ7TSF1 Mef2c-223ENSMUST00000199105 4361 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
Dsg1bQ7TSF1 Gm24069-201ENSMUST00000104512 127 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
Dsg1bQ7TSF1 Gm6096-201ENSMUST00000105172 456 ntAPPRIS P1 BASIC6.42□□□□□ -1.38
Dsg1bQ7TSF1 BC080695-201ENSMUST00000105765 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
Dsg1bQ7TSF1 Gm14322-201ENSMUST00000108942 1074 ntTSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
Dsg1bQ7TSF1 Gm12169-201ENSMUST00000109228 1065 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
Dsg1bQ7TSF1 Gm7146-201ENSMUST00000116079 739 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
Dsg1bQ7TSF1 Gm22103-201ENSMUST00000116733 121 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
Dsg1bQ7TSF1 Gm26475-201ENSMUST00000116769 121 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
Dsg1bQ7TSF1 Gm23620-201ENSMUST00000116812 121 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
Dsg1bQ7TSF1 Gm25042-201ENSMUST00000116856 121 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.6 ms