Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

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Length 1,455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Pramel3-201ENSMUST00000113176 3673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Ccdc18Q640L5 Emcn-201ENSMUST00000119475 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Ccdc18Q640L5 C87977-203ENSMUST00000105755 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.3□□□□□ -1.08
Ccdc18Q640L5 Gabrg2-203ENSMUST00000109290 2868 ntTSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Ccdc18Q640L5 Zfp763-201ENSMUST00000087654 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Ccdc18Q640L5 Trim23-202ENSMUST00000069174 4258 ntTSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Ccdc18Q640L5 Gm42496-201ENSMUST00000197976 3241 ntBASIC8.3□□□□□ -1.08
Ccdc18Q640L5 Lrrc4c-202ENSMUST00000135431 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Ccdc18Q640L5 Gramd1c-203ENSMUST00000179565 3159 ntTSL 5 BASIC8.3□□□□□ -1.08
Ccdc18Q640L5 Gm45644-201ENSMUST00000210255 2740 ntBASIC8.3□□□□□ -1.08
Ccdc18Q640L5 Gm6288-201ENSMUST00000100778 1590 ntTSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Ccdc18Q640L5 Serpinb9b-201ENSMUST00000006392 3253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Ccdc18Q640L5 Malat1-201ENSMUST00000172812 6983 ntBASIC8.3□□□□□ -1.08
Ccdc18Q640L5 Prl-202ENSMUST00000110369 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Ccdc18Q640L5 Gm14628-201ENSMUST00000117508 635 ntBASIC8.3□□□□□ -1.08
Ccdc18Q640L5 Gm9308-201ENSMUST00000119073 448 ntBASIC8.3□□□□□ -1.08
Ccdc18Q640L5 Gm7363-201ENSMUST00000119883 399 ntBASIC8.3□□□□□ -1.08
Ccdc18Q640L5 Defa-ps14-201ENSMUST00000121373 418 ntBASIC8.3□□□□□ -1.08
Ccdc18Q640L5 Gm40263-201ENSMUST00000197468 580 ntTSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Ccdc18Q640L5 Olfr915-201ENSMUST00000215191 933 ntAPPRIS P1 BASIC8.3□□□□□ -1.08
Ccdc18Q640L5 Ikzf2-201ENSMUST00000027146 9278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Ccdc18Q640L5 Gm42615-201ENSMUST00000197704 1820 ntBASIC8.3□□□□□ -1.08
Ccdc18Q640L5 Gm13977-201ENSMUST00000133648 4049 ntTSL 5 BASIC8.3□□□□□ -1.08
Ccdc18Q640L5 Psd3-206ENSMUST00000120071 9203 ntTSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Ccdc18Q640L5 Gm7269-201ENSMUST00000210819 1373 ntBASIC8.3□□□□□ -1.08
Ccdc18Q640L5 Naip2-203ENSMUST00000167986 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.3□□□□□ -1.08
Ccdc18Q640L5 Dnajc13-203ENSMUST00000186788 6747 ntTSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Ccdc18Q640L5 Gm37049-201ENSMUST00000194356 1983 ntBASIC8.29□□□□□ -1.08
Ccdc18Q640L5 Slc22a27-202ENSMUST00000182102 1801 ntTSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Ccdc18Q640L5 Gm16513-201ENSMUST00000101023 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Ccdc18Q640L5 Gm2366-201ENSMUST00000180753 3982 ntTSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Ccdc18Q640L5 Gm25726-201ENSMUST00000104529 129 ntBASIC8.29□□□□□ -1.08
Ccdc18Q640L5 Gm14878-201ENSMUST00000118167 293 ntBASIC8.29□□□□□ -1.08
Ccdc18Q640L5 Gm13737-201ENSMUST00000119793 232 ntBASIC8.29□□□□□ -1.08
Ccdc18Q640L5 Olfr336-ps1-201ENSMUST00000120897 940 ntBASIC8.29□□□□□ -1.08
Ccdc18Q640L5 Gm23354-201ENSMUST00000158426 104 ntBASIC8.29□□□□□ -1.08
Ccdc18Q640L5 Obox1-205ENSMUST00000173443 835 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.29□□□□□ -1.08
Ccdc18Q640L5 Gm6155-201ENSMUST00000173735 341 ntBASIC8.29□□□□□ -1.08
Ccdc18Q640L5 Vmn1r-ps77-201ENSMUST00000174184 921 ntBASIC8.29□□□□□ -1.08
Ccdc18Q640L5 Obox2-204ENSMUST00000174305 834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.29□□□□□ -1.08
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Ccdc18Q640L5 AC157515.1-201ENSMUST00000220953 450 ntBASIC8.29□□□□□ -1.08
Ccdc18Q640L5 AC137961.1-201ENSMUST00000227924 734 ntBASIC8.29□□□□□ -1.08
Ccdc18Q640L5 CT573086.3-201ENSMUST00000228762 594 ntBASIC8.29□□□□□ -1.08
Ccdc18Q640L5 BC028528-201ENSMUST00000036360 752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Ccdc18Q640L5 Fgb-201ENSMUST00000048246 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
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Ccdc18Q640L5 Gm15457-201ENSMUST00000129513 3990 ntTSL 2 BASIC8.29□□□□□ -1.08
Ccdc18Q640L5 Ncl-201ENSMUST00000027438 8202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
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Ccdc18Q640L5 Arrdc3-205ENSMUST00000161441 1908 ntTSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
Ccdc18Q640L5 Gprc6a-202ENSMUST00000218684 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
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Ccdc18Q640L5 Vsig4-201ENSMUST00000050707 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
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Ccdc18Q640L5 Cnot4-207ENSMUST00000202417 3296 ntTSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
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Ccdc18Q640L5 Phf11b-201ENSMUST00000166121 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
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Ccdc18Q640L5 Defa26-201ENSMUST00000074343 372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
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Ccdc18Q640L5 Zfhx3-204ENSMUST00000220518 17152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.28□□□□□ -1.08
Ccdc18Q640L5 CT009696.3-201ENSMUST00000215342 2184 ntTSL 3 BASIC8.28□□□□□ -1.08
Ccdc18Q640L5 Lrrtm4-203ENSMUST00000126399 3050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.28□□□□□ -1.08
Ccdc18Q640L5 Gm43437-201ENSMUST00000198535 3955 ntBASIC8.28□□□□□ -1.08
Ccdc18Q640L5 Gm31218-201ENSMUST00000221181 1498 ntTSL 5 BASIC8.28□□□□□ -1.08
Ccdc18Q640L5 Gm37769-201ENSMUST00000193753 2369 ntBASIC8.28□□□□□ -1.08
Ccdc18Q640L5 Kcnj2-201ENSMUST00000042970 5444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
Ccdc18Q640L5 Gm11251-201ENSMUST00000119593 2800 ntBASIC8.28□□□□□ -1.08
Ccdc18Q640L5 Gm45311-201ENSMUST00000211086 1330 ntBASIC8.28□□□□□ -1.08
Ccdc18Q640L5 Rbm46-202ENSMUST00000182637 2058 ntTSL 5 BASIC8.28□□□□□ -1.08
Ccdc18Q640L5 Ube2v2-203ENSMUST00000115777 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.08
Ccdc18Q640L5 Olfr1493-ps1-202ENSMUST00000208667 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.27□□□□□ -1.08
Ccdc18Q640L5 Gm42725-201ENSMUST00000199296 4193 ntBASIC8.27□□□□□ -1.09
Ccdc18Q640L5 Olfr510-202ENSMUST00000213979 2898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.27□□□□□ -1.09
Ccdc18Q640L5 Igkv1-99-201ENSMUST00000103326 359 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.27□□□□□ -1.09
Ccdc18Q640L5 n-R5s61-201ENSMUST00000122711 118 ntBASIC8.27□□□□□ -1.09
Ccdc18Q640L5 Gm15517-201ENSMUST00000124863 251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
Ccdc18Q640L5 Gm22160-201ENSMUST00000158405 328 ntBASIC8.27□□□□□ -1.09
Ccdc18Q640L5 Gm24175-201ENSMUST00000158931 129 ntBASIC8.27□□□□□ -1.09
Ccdc18Q640L5 9330118I20Rik-201ENSMUST00000203390 1066 ntTSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
Ccdc18Q640L5 Gm45070-201ENSMUST00000208100 246 ntBASIC8.27□□□□□ -1.09
Ccdc18Q640L5 CT009765.2-201ENSMUST00000221331 392 ntBASIC8.27□□□□□ -1.09
Ccdc18Q640L5 AC132112.1-201ENSMUST00000226354 505 ntBASIC8.27□□□□□ -1.09
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