Protein–RNA interactions for Protein: P48281

Vdr, Vitamin D3 receptor, mousemouse

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Length 422 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VdrP48281 Gm30517-201ENSMUST00000197350 772 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
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VdrP48281 AC131654.1-201ENSMUST00000219675 745 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
VdrP48281 CT033781.1-201ENSMUST00000223128 454 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
VdrP48281 Prl3d3-202ENSMUST00000223958 675 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.71□□□□□ -1.34
VdrP48281 AC131117.2-202ENSMUST00000224539 547 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
VdrP48281 AC154834.1-201ENSMUST00000224697 358 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
VdrP48281 AC131033.1-201ENSMUST00000228223 279 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
VdrP48281 Dppa3-201ENSMUST00000049644 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
VdrP48281 Olfr748-201ENSMUST00000073561 924 ntAPPRIS P1 BASIC6.71□□□□□ -1.34
VdrP48281 Mir465c-1-201ENSMUST00000093560 81 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
VdrP48281 Olfr195-202ENSMUST00000216957 2077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.34
VdrP48281 Mfap3-201ENSMUST00000020830 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
VdrP48281 Olfr1087-202ENSMUST00000214141 3861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
VdrP48281 Top2a-201ENSMUST00000068031 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
VdrP48281 Cntn5-201ENSMUST00000074133 3297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
VdrP48281 Fbxw25-201ENSMUST00000163839 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
VdrP48281 Gm3510-201ENSMUST00000180447 1455 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
VdrP48281 Olfr530-202ENSMUST00000216727 1958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
VdrP48281 Dnah17-202ENSMUST00000084803 14889 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
VdrP48281 2610044O15Rik8-202ENSMUST00000186619 2337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.34
VdrP48281 BC055402-201ENSMUST00000190488 3301 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
VdrP48281 Sspo-202ENSMUST00000169350 15571 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
VdrP48281 Fam227b-202ENSMUST00000110448 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
VdrP48281 Epyc-202ENSMUST00000105285 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
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VdrP48281 Psd3-201ENSMUST00000038959 11319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
VdrP48281 Gm28965-201ENSMUST00000186015 1500 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
VdrP48281 Cwf19l1-201ENSMUST00000026218 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
VdrP48281 C87977-204ENSMUST00000105757 1885 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
VdrP48281 Gm7709-201ENSMUST00000199391 1858 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
VdrP48281 D630023O14Rik-201ENSMUST00000191913 3099 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
VdrP48281 Gm42541-201ENSMUST00000199871 2249 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
VdrP48281 Acsm3-203ENSMUST00000106527 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
VdrP48281 Slamf7-202ENSMUST00000192024 1361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
VdrP48281 Rbmy-201ENSMUST00000100360 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
VdrP48281 Gm10256-202ENSMUST00000188114 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
VdrP48281 Gm21708-203ENSMUST00000190283 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
VdrP48281 Olfr965-202ENSMUST00000213335 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
VdrP48281 Pole2-202ENSMUST00000221411 1641 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
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VdrP48281 Stk36-203ENSMUST00000113694 629 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
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VdrP48281 Gm14228-201ENSMUST00000131908 798 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
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VdrP48281 Rpain-213ENSMUST00000178822 566 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
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VdrP48281 4930598F16Rik-201ENSMUST00000187352 761 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
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VdrP48281 Olfr617-203ENSMUST00000216516 3083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
VdrP48281 Lrrc49-201ENSMUST00000053171 3086 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
VdrP48281 Gm16503-201ENSMUST00000104964 3283 ntAPPRIS P1 BASIC6.7□□□□□ -1.34
VdrP48281 Fam35a-206ENSMUST00000228626 3100 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
VdrP48281 Taf7-201ENSMUST00000066272 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
VdrP48281 Ermard-201ENSMUST00000040594 1571 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
VdrP48281 Gm20559-202ENSMUST00000201831 2993 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
VdrP48281 Kdm4c-202ENSMUST00000077851 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
VdrP48281 Clcn5-201ENSMUST00000004428 8390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
VdrP48281 Oxr1-201ENSMUST00000022918 4232 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
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