Protein–RNA interactions for Protein: P28357

Hoxd9, Homeobox protein Hox-D9, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd9P28357 Gm22810-201ENSMUST00000082741 158 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 Mir106b-201ENSMUST00000083580 82 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 Arhgef12-201ENSMUST00000072767 10059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 Gm14615-201ENSMUST00000117575 1816 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 Gdap10-201ENSMUST00000180613 5003 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
Hoxd9P28357 Fam135a-208ENSMUST00000187752 5194 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.39
Hoxd9P28357 Pde1c-206ENSMUST00000166890 4728 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
Hoxd9P28357 AC114585.1-201ENSMUST00000228080 3680 ntBASIC6.4□□□□□ -1.39
Hoxd9P28357 Adamts12-201ENSMUST00000061318 8579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
Hoxd9P28357 Gm42930-201ENSMUST00000200872 3260 ntBASIC6.4□□□□□ -1.39
Hoxd9P28357 Zdhhc17-201ENSMUST00000041723 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
Hoxd9P28357 Shprh-202ENSMUST00000054814 7225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
Hoxd9P28357 1700024B05Rik-202ENSMUST00000168972 1573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.39
Hoxd9P28357 Ttk-201ENSMUST00000070326 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
Hoxd9P28357 St18-212ENSMUST00000151281 3533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
Hoxd9P28357 Celf2-206ENSMUST00000114934 5470 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
Hoxd9P28357 Gsdme-202ENSMUST00000101405 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
Hoxd9P28357 Ablim1-201ENSMUST00000079360 7152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
Hoxd9P28357 Skap2-205ENSMUST00000204778 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
Hoxd9P28357 Iqch-202ENSMUST00000080527 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
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Hoxd9P28357 Gm3608-201ENSMUST00000086725 2858 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
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Hoxd9P28357 4930522H14Rik-202ENSMUST00000102725 854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
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Hoxd9P28357 Olfr26-201ENSMUST00000104874 931 ntAPPRIS P1 BASIC6.39□□□□□ -1.39
Hoxd9P28357 Gm24275-201ENSMUST00000116780 146 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
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Hoxd9P28357 Gm12778-201ENSMUST00000122341 333 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
Hoxd9P28357 Gm22073-201ENSMUST00000122668 189 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
Hoxd9P28357 4930583P06Rik-201ENSMUST00000136658 706 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
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Hoxd9P28357 AI662270-203ENSMUST00000145461 592 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
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Hoxd9P28357 Enpp6-201ENSMUST00000039840 4970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
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Hoxd9P28357 Sytl4-203ENSMUST00000113297 3306 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
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Hoxd9P28357 Vmn1r39-201ENSMUST00000226217 2258 ntAPPRIS P2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
Hoxd9P28357 Vmn1r39-204ENSMUST00000227555 2297 ntAPPRIS P2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
Hoxd9P28357 Vmn1r39-205ENSMUST00000228008 2283 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
Hoxd9P28357 Poln-201ENSMUST00000042954 2897 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
Hoxd9P28357 AC167013.5-201ENSMUST00000227597 2947 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
Hoxd9P28357 Tlr11-201ENSMUST00000063570 2993 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
Hoxd9P28357 Gm10840-201ENSMUST00000100326 309 ntAPPRIS P1 BASIC6.38□□□□□ -1.39
Hoxd9P28357 Gm25760-201ENSMUST00000103989 132 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
Hoxd9P28357 Gm24473-201ENSMUST00000104483 131 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
Hoxd9P28357 Snord88a-201ENSMUST00000116723 90 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
Hoxd9P28357 Gm13870-201ENSMUST00000117214 1023 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
Hoxd9P28357 Gm14987-201ENSMUST00000117820 676 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
Hoxd9P28357 Gm14867-201ENSMUST00000120156 866 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
Hoxd9P28357 Gm4886-201ENSMUST00000121874 1176 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
Hoxd9P28357 Rhox11-ps1-201ENSMUST00000121945 387 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
Hoxd9P28357 Gm12175-201ENSMUST00000122081 345 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
Hoxd9P28357 Mir1907-201ENSMUST00000122509 90 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
Hoxd9P28357 Gm12092-201ENSMUST00000125194 600 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
Hoxd9P28357 Gm15123-201ENSMUST00000138988 339 ntTSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
Hoxd9P28357 Gm13322-201ENSMUST00000152803 246 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
Hoxd9P28357 Gm16321-201ENSMUST00000155184 574 ntTSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
Hoxd9P28357 C030037F17Rik-201ENSMUST00000155211 406 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
Hoxd9P28357 Gm11418-201ENSMUST00000156193 626 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
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