Protein–RNA interactions for Protein: E9PZP8

Herc1, HECT and RLD domain-containing E3 ubiquitin protein ligase family member 1, mousemouse

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Length 4,859 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Herc1E9PZP8 Gm11110-201ENSMUST00000112915 1013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Herc1E9PZP8 Gm12231-201ENSMUST00000119447 695 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Herc1E9PZP8 Gm22536-201ENSMUST00000158171 134 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Herc1E9PZP8 Gm24939-201ENSMUST00000158325 137 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Herc1E9PZP8 Gm26944-201ENSMUST00000182265 633 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Herc1E9PZP8 Gm29532-201ENSMUST00000185593 622 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Herc1E9PZP8 Gm29504-201ENSMUST00000185605 537 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Herc1E9PZP8 Gm29360-201ENSMUST00000185625 537 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Herc1E9PZP8 Gm28296-202ENSMUST00000186151 622 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Herc1E9PZP8 Gm29498-201ENSMUST00000186449 537 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Herc1E9PZP8 Gm28565-202ENSMUST00000186615 537 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Herc1E9PZP8 Gm28297-201ENSMUST00000186679 537 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Herc1E9PZP8 Gm28326-201ENSMUST00000187043 622 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Herc1E9PZP8 Gm28301-201ENSMUST00000187582 537 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Herc1E9PZP8 Gm28464-201ENSMUST00000187726 622 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Herc1E9PZP8 Gm29286-202ENSMUST00000187736 537 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Herc1E9PZP8 Gm28295-201ENSMUST00000188322 622 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
Herc1E9PZP8 Gm29578-201ENSMUST00000188809 537 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Herc1E9PZP8 Gm29166-202ENSMUST00000189600 537 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Herc1E9PZP8 Gm28765-201ENSMUST00000189752 537 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Herc1E9PZP8 Gm28617-202ENSMUST00000190129 537 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Herc1E9PZP8 Gm28522-202ENSMUST00000190561 537 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Herc1E9PZP8 Gm28834-202ENSMUST00000190714 537 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Herc1E9PZP8 Gm28987-201ENSMUST00000191071 537 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Herc1E9PZP8 Gm29132-202ENSMUST00000191588 622 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Herc1E9PZP8 Gm30174-201ENSMUST00000191682 537 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Herc1E9PZP8 Gm36261-201ENSMUST00000191807 537 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Herc1E9PZP8 Gm34550-202ENSMUST00000195186 537 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Herc1E9PZP8 Gm18427-201ENSMUST00000195422 515 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Herc1E9PZP8 AC121898.1-201ENSMUST00000227599 288 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Herc1E9PZP8 Olfr996-201ENSMUST00000077075 1068 ntAPPRIS P1 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Herc1E9PZP8 Trps1-201ENSMUST00000077935 4436 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
Herc1E9PZP8 Depdc5-202ENSMUST00000087897 8216 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
Herc1E9PZP8 Olfr45-202ENSMUST00000214637 6157 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Herc1E9PZP8 Trpm8-202ENSMUST00000113114 4112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
Herc1E9PZP8 Zfp101-201ENSMUST00000167107 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
Herc1E9PZP8 Ncor2-201ENSMUST00000055256 7780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Herc1E9PZP8 Gm39327-201ENSMUST00000213594 1982 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Herc1E9PZP8 Cyp2c55-201ENSMUST00000025966 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
Herc1E9PZP8 Ampd3-201ENSMUST00000005829 4094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
Herc1E9PZP8 Olfr372-202ENSMUST00000215324 3542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Herc1E9PZP8 Gm45838-201ENSMUST00000207355 2447 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Herc1E9PZP8 Lrrn3-201ENSMUST00000043884 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
Herc1E9PZP8 Gm3239-201ENSMUST00000163525 1751 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Herc1E9PZP8 Gm3629-201ENSMUST00000171706 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Herc1E9PZP8 Gm42600-201ENSMUST00000202081 3588 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Herc1E9PZP8 Olfr1386-202ENSMUST00000204518 2553 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Herc1E9PZP8 Fmo5-203ENSMUST00000107050 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
Herc1E9PZP8 Prr11-201ENSMUST00000051395 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
Herc1E9PZP8 Hcfc1-201ENSMUST00000033761 8138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
Herc1E9PZP8 Rprd2-202ENSMUST00000197449 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
Herc1E9PZP8 Slc22a30-202ENSMUST00000096269 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
Herc1E9PZP8 AC107453.4-201ENSMUST00000227068 1817 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Herc1E9PZP8 Gm28379-202ENSMUST00000187676 2896 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Herc1E9PZP8 Zfp850-202ENSMUST00000180024 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Herc1E9PZP8 Gm12252-201ENSMUST00000119517 219 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Herc1E9PZP8 Gm27695-201ENSMUST00000184301 91 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Herc1E9PZP8 C4bp-ps1-201ENSMUST00000189393 706 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Herc1E9PZP8 Gm5829-201ENSMUST00000191383 351 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Herc1E9PZP8 Gm38201-201ENSMUST00000192143 387 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Herc1E9PZP8 Gm8197-201ENSMUST00000192906 363 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Herc1E9PZP8 Tas2r142-ps5-201ENSMUST00000204651 929 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Herc1E9PZP8 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
Herc1E9PZP8 4921515E04Rik-203ENSMUST00000227364 2309 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Herc1E9PZP8 Sbno1-216ENSMUST00000199808 10161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
Herc1E9PZP8 Vps41-201ENSMUST00000072961 3199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
Herc1E9PZP8 Ccdc144b-203ENSMUST00000200469 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
Herc1E9PZP8 Pde1a-201ENSMUST00000090756 1661 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
Herc1E9PZP8 AC163731.1-201ENSMUST00000225696 3118 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Herc1E9PZP8 Dnase1l3-201ENSMUST00000026315 4747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
Herc1E9PZP8 Gm15583-201ENSMUST00000116191 3510 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Herc1E9PZP8 5031410I06Rik-201ENSMUST00000063524 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
Herc1E9PZP8 Pcm1-204ENSMUST00000211247 6484 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Herc1E9PZP8 CT573016.1-201ENSMUST00000224814 2103 ntAPPRIS P5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Herc1E9PZP8 Ereg-201ENSMUST00000031324 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
Herc1E9PZP8 BC051142-201ENSMUST00000078615 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
Herc1E9PZP8 Frrs1-202ENSMUST00000195905 6823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Herc1E9PZP8 Gm37509-201ENSMUST00000194867 3169 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Herc1E9PZP8 Helz2-201ENSMUST00000094203 9162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Herc1E9PZP8 Gm24831-201ENSMUST00000116778 126 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Herc1E9PZP8 1700041M05Rik-201ENSMUST00000130055 306 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
Herc1E9PZP8 Gm23954-201ENSMUST00000157213 353 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Herc1E9PZP8 Gm25977-201ENSMUST00000158697 85 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Herc1E9PZP8 1700129C05Rik-204ENSMUST00000162674 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Herc1E9PZP8 1700016L21Rik-201ENSMUST00000187497 394 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
Herc1E9PZP8 Gm37381-202ENSMUST00000194643 657 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Herc1E9PZP8 Gm32772-201ENSMUST00000205898 594 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Herc1E9PZP8 AC158633.1-201ENSMUST00000219892 649 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Herc1E9PZP8 AC154623.1-201ENSMUST00000224348 805 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Herc1E9PZP8 AC098742.1-201ENSMUST00000227945 373 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Herc1E9PZP8 Defb19-201ENSMUST00000053180 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
Herc1E9PZP8 Gm10061-201ENSMUST00000073111 465 ntAPPRIS P1 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Herc1E9PZP8 Gm10237-201ENSMUST00000078393 273 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Herc1E9PZP8 Gm43197-201ENSMUST00000201493 2583 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Herc1E9PZP8 Zfp871-201ENSMUST00000057501 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
Herc1E9PZP8 A530053G22Rik-205ENSMUST00000205153 1448 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
Herc1E9PZP8 Akap13-205ENSMUST00000207750 12597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Herc1E9PZP8 3110067C02Rik-201ENSMUST00000120793 2117 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Herc1E9PZP8 Olfr127-202ENSMUST00000217223 3733 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Herc1E9PZP8 Spag9-203ENSMUST00000075695 6910 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
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