Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Olfr472-203ENSMUST00000216937 5392 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
Col5a3Q9JLI2 Gprc6a-202ENSMUST00000218684 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
Col5a3Q9JLI2 Nek7-203ENSMUST00000187407 4336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
Col5a3Q9JLI2 Mocs2-213ENSMUST00000184245 4559 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
Col5a3Q9JLI2 Gm8402-201ENSMUST00000118183 1770 ntBASIC5.4□□□□□ -1.55
Col5a3Q9JLI2 Gm8383-201ENSMUST00000121179 1770 ntBASIC5.4□□□□□ -1.55
Col5a3Q9JLI2 Fbxw25-201ENSMUST00000163839 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
Col5a3Q9JLI2 Tmem56-201ENSMUST00000029777 6248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
Col5a3Q9JLI2 Arhgef12-201ENSMUST00000072767 10059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
Col5a3Q9JLI2 Nckap5-201ENSMUST00000057846 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.55
Col5a3Q9JLI2 Olfr726-203ENSMUST00000213345 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.55
Col5a3Q9JLI2 AC126439.1-201ENSMUST00000226772 2104 ntBASIC5.4□□□□□ -1.55
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r39-206ENSMUST00000228651 2144 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.4□□□□□ -1.55
Col5a3Q9JLI2 Gabrg2-202ENSMUST00000070735 2234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
Col5a3Q9JLI2 Robo2-202ENSMUST00000117200 5988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.55
Col5a3Q9JLI2 Olfr337-ps1-201ENSMUST00000120380 456 ntBASIC5.4□□□□□ -1.55
Col5a3Q9JLI2 Tex50-201ENSMUST00000135643 1192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.55
Col5a3Q9JLI2 Scml1-201ENSMUST00000136860 576 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.55
Col5a3Q9JLI2 Gm7271-201ENSMUST00000172369 519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r-ps77-201ENSMUST00000174184 921 ntBASIC5.4□□□□□ -1.55
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r-ps75-201ENSMUST00000174316 920 ntBASIC5.4□□□□□ -1.55
Col5a3Q9JLI2 Gm16456-201ENSMUST00000174431 920 ntBASIC5.4□□□□□ -1.55
Col5a3Q9JLI2 Mir3473f-201ENSMUST00000183743 136 ntBASIC5.4□□□□□ -1.55
Col5a3Q9JLI2 1700027H10Rik-201ENSMUST00000186818 584 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
Col5a3Q9JLI2 Gm37097-201ENSMUST00000193676 336 ntBASIC5.4□□□□□ -1.55
Col5a3Q9JLI2 Gm38163-201ENSMUST00000194112 482 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.55
Col5a3Q9JLI2 Gm44796-201ENSMUST00000205272 626 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.55
Col5a3Q9JLI2 Gm45910-201ENSMUST00000212493 1003 ntBASIC5.4□□□□□ -1.55
Col5a3Q9JLI2 4930567H12Rik-202ENSMUST00000212512 766 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
Col5a3Q9JLI2 AC154627.3-201ENSMUST00000228441 334 ntBASIC5.4□□□□□ -1.55
Col5a3Q9JLI2 Cypt3-201ENSMUST00000056754 666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
Col5a3Q9JLI2 Olfr345-201ENSMUST00000076850 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.4□□□□□ -1.55
Col5a3Q9JLI2 Olfr1407-ps1-201ENSMUST00000085885 797 ntBASIC5.4□□□□□ -1.55
Col5a3Q9JLI2 Hivep3-202ENSMUST00000106307 11838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Col5a3Q9JLI2 Anapc10-201ENSMUST00000048147 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Col5a3Q9JLI2 Jchain-201ENSMUST00000087033 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Col5a3Q9JLI2 Gm26648-201ENSMUST00000181925 5831 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Col5a3Q9JLI2 Zzz3-204ENSMUST00000106103 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Col5a3Q9JLI2 Olfr877-202ENSMUST00000213956 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Col5a3Q9JLI2 Csrnp3-204ENSMUST00000122912 10672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Col5a3Q9JLI2 Lrrc4c-202ENSMUST00000135431 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Col5a3Q9JLI2 Gm45129-201ENSMUST00000208444 2224 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Col5a3Q9JLI2 Gm7240-204ENSMUST00000222847 2239 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Col5a3Q9JLI2 Lrrn3-201ENSMUST00000043884 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Col5a3Q9JLI2 Dnah17-204ENSMUST00000132685 13612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Col5a3Q9JLI2 Ankfy1-206ENSMUST00000155998 8030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Col5a3Q9JLI2 Gm37114-201ENSMUST00000195065 1804 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Col5a3Q9JLI2 Olfr402-202ENSMUST00000216722 3566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Col5a3Q9JLI2 Olfr1217-203ENSMUST00000214022 3947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Col5a3Q9JLI2 Gsdme-202ENSMUST00000101405 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Col5a3Q9JLI2 Stap1-206ENSMUST00000198435 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Col5a3Q9JLI2 4930533N22Rik-202ENSMUST00000206684 1503 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Col5a3Q9JLI2 Prdm9-206ENSMUST00000167994 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Col5a3Q9JLI2 Gm11584-201ENSMUST00000120636 325 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Col5a3Q9JLI2 Prdx6-ps2-201ENSMUST00000121989 694 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Col5a3Q9JLI2 Obox4-ps26-201ENSMUST00000176368 724 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Col5a3Q9JLI2 Gm16434-202ENSMUST00000177712 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Col5a3Q9JLI2 Gm3453-202ENSMUST00000178308 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Col5a3Q9JLI2 Gm6676-202ENSMUST00000178376 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Col5a3Q9JLI2 Gm3127-203ENSMUST00000178386 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Col5a3Q9JLI2 Gm3187-201ENSMUST00000178429 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Col5a3Q9JLI2 Gm3685-202ENSMUST00000179199 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Col5a3Q9JLI2 A430093F15Rik-206ENSMUST00000189565 651 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Col5a3Q9JLI2 Gm29138-201ENSMUST00000191444 348 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Col5a3Q9JLI2 AC120011.1-201ENSMUST00000202147 744 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Col5a3Q9JLI2 AC140930.4-201ENSMUST00000220750 150 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Col5a3Q9JLI2 Olfr1323-201ENSMUST00000057071 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Col5a3Q9JLI2 Gm7792-201ENSMUST00000201555 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Col5a3Q9JLI2 Kcnmb2-202ENSMUST00000119970 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Col5a3Q9JLI2 Dnah10-201ENSMUST00000058440 14038 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Col5a3Q9JLI2 Lrrtm4-208ENSMUST00000147663 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Col5a3Q9JLI2 Olfr542-ps1-202ENSMUST00000218525 4039 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Col5a3Q9JLI2 Zscan4-ps2-201ENSMUST00000091440 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Col5a3Q9JLI2 4930555F03Rik-202ENSMUST00000126285 3604 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
Col5a3Q9JLI2 Huwe1-201ENSMUST00000026292 14579 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
Col5a3Q9JLI2 Uevld-201ENSMUST00000094398 4616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
Col5a3Q9JLI2 Cd200r3-203ENSMUST00000114611 1407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r86-202ENSMUST00000226604 6378 ntAPPRIS P2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
Col5a3Q9JLI2 Zfp933-201ENSMUST00000105718 4238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
Col5a3Q9JLI2 Gm15737-201ENSMUST00000113434 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
Col5a3Q9JLI2 Gm42860-201ENSMUST00000196492 3991 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Col5a3Q9JLI2 Il7r-201ENSMUST00000003981 3540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
Col5a3Q9JLI2 0610010F05Rik-202ENSMUST00000093267 3646 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
Col5a3Q9JLI2 Gm13250-201ENSMUST00000117209 753 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Col5a3Q9JLI2 Gm7312-201ENSMUST00000118798 469 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Col5a3Q9JLI2 Gm22204-201ENSMUST00000122654 327 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Col5a3Q9JLI2 Grip1os1-202ENSMUST00000135940 1192 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
Col5a3Q9JLI2 Gm12707-201ENSMUST00000155789 489 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
Col5a3Q9JLI2 A930005H10Rik-202ENSMUST00000185424 433 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
Col5a3Q9JLI2 Gm28426-201ENSMUST00000187385 620 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
Col5a3Q9JLI2 Gm28957-201ENSMUST00000190174 373 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Col5a3Q9JLI2 Gm18426-201ENSMUST00000191874 973 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Col5a3Q9JLI2 Kcnmb2-206ENSMUST00000194796 338 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
Col5a3Q9JLI2 Gm5288-201ENSMUST00000198323 1119 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Col5a3Q9JLI2 Gm19617-201ENSMUST00000202977 308 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Col5a3Q9JLI2 Gm44077-201ENSMUST00000203453 435 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
Col5a3Q9JLI2 Gm8719-201ENSMUST00000203602 534 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Col5a3Q9JLI2 AC158803.3-201ENSMUST00000220024 211 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Col5a3Q9JLI2 AC137117.1-201ENSMUST00000226912 441 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Col5a3Q9JLI2 Ppargc1a-203ENSMUST00000132734 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
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