Protein–RNA interactions for Protein: Q149C2

Traf3ip1, TRAF3-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 625 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3ip1Q149C2 Gm7825-201ENSMUST00000204046 416 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Traf3ip1Q149C2 AC153532.2-201ENSMUST00000219753 3844 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Traf3ip1Q149C2 AC241593.2-201ENSMUST00000225099 510 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Traf3ip1Q149C2 Mir31-201ENSMUST00000083474 106 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Traf3ip1Q149C2 Cntn4-201ENSMUST00000079416 2844 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Traf3ip1Q149C2 Gm5890-201ENSMUST00000190145 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Traf3ip1Q149C2 Cnga1-205ENSMUST00000201463 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Traf3ip1Q149C2 Gm44250-201ENSMUST00000203092 4229 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Traf3ip1Q149C2 Matr3-ps2-201ENSMUST00000160839 1996 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Traf3ip1Q149C2 Gm37606-201ENSMUST00000191816 3116 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Traf3ip1Q149C2 Gm16513-201ENSMUST00000101023 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Traf3ip1Q149C2 Armc4-201ENSMUST00000081275 3477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Traf3ip1Q149C2 Vmn1r175-202ENSMUST00000228383 2878 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Traf3ip1Q149C2 Xrn1-209ENSMUST00000190665 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Traf3ip1Q149C2 Epha7-203ENSMUST00000108191 6615 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Traf3ip1Q149C2 Gm19084-201ENSMUST00000222939 1762 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Traf3ip1Q149C2 Gm37833-201ENSMUST00000194342 3256 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Traf3ip1Q149C2 Gm42686-201ENSMUST00000199172 4108 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Traf3ip1Q149C2 Olfr1383-202ENSMUST00000204706 4168 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Traf3ip1Q149C2 Gm14399-204ENSMUST00000109060 1911 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Traf3ip1Q149C2 Trbv12-1-201ENSMUST00000103267 389 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Traf3ip1Q149C2 Igkv6-15-201ENSMUST00000103393 347 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Traf3ip1Q149C2 Gnrh1-201ENSMUST00000111095 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Traf3ip1Q149C2 Gm14125-202ENSMUST00000120921 756 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Traf3ip1Q149C2 Gm7973-201ENSMUST00000122107 488 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Traf3ip1Q149C2 Xaf1-202ENSMUST00000140842 651 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Traf3ip1Q149C2 Vmn1r-ps22-201ENSMUST00000176017 900 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Traf3ip1Q149C2 Gm26877-201ENSMUST00000180728 633 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Traf3ip1Q149C2 Gm29664-201ENSMUST00000191125 463 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Traf3ip1Q149C2 2310002D06Rik-201ENSMUST00000218103 508 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Traf3ip1Q149C2 Tpbpb-202ENSMUST00000223698 746 ntAPPRIS P2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Traf3ip1Q149C2 Tpbpa-202ENSMUST00000225275 642 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Traf3ip1Q149C2 mt-Nd6-201ENSMUST00000082419 519 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Traf3ip1Q149C2 Lrrn3-201ENSMUST00000043884 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Traf3ip1Q149C2 Olfr1217-204ENSMUST00000216592 3992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Traf3ip1Q149C2 Gm43154-208ENSMUST00000209658 1442 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Traf3ip1Q149C2 Gm28242-201ENSMUST00000187274 1492 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Traf3ip1Q149C2 AI838599-201ENSMUST00000133960 2953 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Traf3ip1Q149C2 4921529L05Rik-201ENSMUST00000203047 1997 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Traf3ip1Q149C2 5430403G16Rik-201ENSMUST00000092720 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Traf3ip1Q149C2 Spam1-201ENSMUST00000031693 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Traf3ip1Q149C2 Vmn1r31-205ENSMUST00000228586 2115 ntAPPRIS P2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Traf3ip1Q149C2 Gria4-204ENSMUST00000212533 5207 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Traf3ip1Q149C2 Ubqlnl-201ENSMUST00000059121 2298 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Traf3ip1Q149C2 Gm36963-201ENSMUST00000193506 2324 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Traf3ip1Q149C2 Olfr341-202ENSMUST00000213300 6634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Traf3ip1Q149C2 AC152944.1-201ENSMUST00000220160 3101 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Traf3ip1Q149C2 Gm45324-201ENSMUST00000211193 5638 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Traf3ip1Q149C2 Trav2-201ENSMUST00000103568 325 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Traf3ip1Q149C2 Gm9733-201ENSMUST00000108361 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Traf3ip1Q149C2 Csn1s2b-203ENSMUST00000113279 745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Traf3ip1Q149C2 Gm14711-201ENSMUST00000117056 217 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Traf3ip1Q149C2 Gm16149-201ENSMUST00000117631 309 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Traf3ip1Q149C2 Gm15357-201ENSMUST00000119160 285 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Traf3ip1Q149C2 Gm14175-201ENSMUST00000119835 241 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Traf3ip1Q149C2 Gm14434-201ENSMUST00000120521 559 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Traf3ip1Q149C2 Mageb6-ps-201ENSMUST00000126612 1032 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Traf3ip1Q149C2 Gm12519-201ENSMUST00000134099 693 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Traf3ip1Q149C2 4930551O13Rik-201ENSMUST00000145585 1065 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Traf3ip1Q149C2 Gm11680-201ENSMUST00000146550 439 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Traf3ip1Q149C2 Gm16549-201ENSMUST00000160445 503 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Traf3ip1Q149C2 1700116B05Rik-201ENSMUST00000173461 414 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Traf3ip1Q149C2 4930445N18Rik-201ENSMUST00000180631 886 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Traf3ip1Q149C2 Gm27528-201ENSMUST00000183544 205 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Traf3ip1Q149C2 Gm28061-201ENSMUST00000189085 807 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Traf3ip1Q149C2 4930535G08Rik-201ENSMUST00000192017 425 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Traf3ip1Q149C2 Ighv3-4-201ENSMUST00000193408 353 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Traf3ip1Q149C2 Gm9442-201ENSMUST00000194242 319 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Traf3ip1Q149C2 Gm6145-201ENSMUST00000209522 710 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Traf3ip1Q149C2 1700011L03Rik-201ENSMUST00000210613 608 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Traf3ip1Q149C2 AC137127.3-201ENSMUST00000213340 349 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Traf3ip1Q149C2 AC131745.2-201ENSMUST00000225736 565 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Traf3ip1Q149C2 Gm11808-201ENSMUST00000089430 504 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Traf3ip1Q149C2 Abca12-201ENSMUST00000087268 9137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Traf3ip1Q149C2 Scaper-205ENSMUST00000217647 4370 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Traf3ip1Q149C2 Far2-202ENSMUST00000111607 3395 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Traf3ip1Q149C2 Gm38253-201ENSMUST00000194058 4678 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Traf3ip1Q149C2 Olfr586-204ENSMUST00000215304 6169 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Traf3ip1Q149C2 Vmn1r185-205ENSMUST00000227461 5318 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Traf3ip1Q149C2 Stk38l-201ENSMUST00000001675 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Traf3ip1Q149C2 Fam26d-201ENSMUST00000048052 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Traf3ip1Q149C2 9630028B13Rik-201ENSMUST00000143787 3406 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Traf3ip1Q149C2 Olfr685-202ENSMUST00000209409 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Traf3ip1Q149C2 Gm4922-201ENSMUST00000055107 1950 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Traf3ip1Q149C2 Gm43025-201ENSMUST00000201764 1886 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Traf3ip1Q149C2 Zscan4e-202ENSMUST00000210521 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Traf3ip1Q149C2 Cdh7-208ENSMUST00000146282 4776 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Traf3ip1Q149C2 Zfp65-201ENSMUST00000073157 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Traf3ip1Q149C2 Trav15n-1-201ENSMUST00000103590 349 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Traf3ip1Q149C2 Mir292-201ENSMUST00000104847 82 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Traf3ip1Q149C2 Gm13503-201ENSMUST00000119017 446 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Traf3ip1Q149C2 Gm15034-201ENSMUST00000120043 349 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Traf3ip1Q149C2 Gm12808-201ENSMUST00000120597 404 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Traf3ip1Q149C2 Gtsf1-205ENSMUST00000141364 700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Traf3ip1Q149C2 Gm11376-201ENSMUST00000144541 231 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Traf3ip1Q149C2 5730412P04Rik-201ENSMUST00000147100 1149 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Traf3ip1Q149C2 Gm3594-201ENSMUST00000169152 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Traf3ip1Q149C2 Trav15d-1-dv6d-1-202ENSMUST00000186370 349 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Traf3ip1Q149C2 Gm2497-201ENSMUST00000189539 601 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Traf3ip1Q149C2 Gm19124-201ENSMUST00000191041 832 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76 ms