Protein–RNA interactions for Protein: B9EKI3

Tmf1, TATA element modulatory factor, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmf1B9EKI3 Nlrp4a-201ENSMUST00000068767 4259 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Tmf1B9EKI3 Iqch-203ENSMUST00000163624 3339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Tmf1B9EKI3 Gm37087-201ENSMUST00000192966 3309 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Tmf1B9EKI3 Gm37752-201ENSMUST00000193494 3309 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Tmf1B9EKI3 Olfr473-202ENSMUST00000217618 2319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Tmf1B9EKI3 Olfr183-205ENSMUST00000214916 2249 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Tmf1B9EKI3 Cnot4-202ENSMUST00000114989 3279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Tmf1B9EKI3 Gm38257-201ENSMUST00000195881 2761 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Tmf1B9EKI3 AC162936.1-201ENSMUST00000223676 2368 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Tmf1B9EKI3 Gm16523-202ENSMUST00000203640 4750 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Tmf1B9EKI3 1700019J19Rik-202ENSMUST00000213583 1856 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Tmf1B9EKI3 Kcnmb2-202ENSMUST00000119970 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Tmf1B9EKI3 Vmn2r2-202ENSMUST00000177151 2727 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Tmf1B9EKI3 Gm42600-201ENSMUST00000202081 3588 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Tmf1B9EKI3 n-R5s82-201ENSMUST00000104213 109 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Tmf1B9EKI3 Mrpl24-203ENSMUST00000121048 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Tmf1B9EKI3 Gm15780-201ENSMUST00000121283 935 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Tmf1B9EKI3 Gm12110-201ENSMUST00000121601 579 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Tmf1B9EKI3 Myhas-202ENSMUST00000145021 950 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Tmf1B9EKI3 Gm23513-201ENSMUST00000158181 133 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Tmf1B9EKI3 4933417A18Rik-201ENSMUST00000160279 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Tmf1B9EKI3 Gm7271-201ENSMUST00000172369 519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Tmf1B9EKI3 Gm4831-201ENSMUST00000174626 594 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Tmf1B9EKI3 Gm20674-201ENSMUST00000177452 369 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Tmf1B9EKI3 Mrgprc3-ps-201ENSMUST00000189876 955 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Tmf1B9EKI3 Ighv1-3-201ENSMUST00000192764 302 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Tmf1B9EKI3 Gm37421-201ENSMUST00000193088 132 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Tmf1B9EKI3 4930478M09Rik-201ENSMUST00000201366 1113 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Tmf1B9EKI3 4930487D11Rik-201ENSMUST00000201983 295 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Tmf1B9EKI3 Gm44048-201ENSMUST00000204531 361 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Tmf1B9EKI3 Gm18537-201ENSMUST00000205709 989 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Tmf1B9EKI3 Gm18468-201ENSMUST00000207321 369 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Tmf1B9EKI3 Gm18470-201ENSMUST00000207467 420 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Tmf1B9EKI3 Gm18465-201ENSMUST00000207468 369 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Tmf1B9EKI3 Gm18464-201ENSMUST00000207803 420 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Tmf1B9EKI3 Gm18458-201ENSMUST00000207908 369 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Tmf1B9EKI3 Gm44623-201ENSMUST00000207934 434 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Tmf1B9EKI3 Gm18461-201ENSMUST00000208421 420 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Tmf1B9EKI3 Gm44516-201ENSMUST00000208794 833 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Tmf1B9EKI3 Cox6b2-201ENSMUST00000063324 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Tmf1B9EKI3 Ube2d4-201ENSMUST00000075109 406 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Tmf1B9EKI3 Gm5546-201ENSMUST00000056145 2777 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Tmf1B9EKI3 Agps-203ENSMUST00000175646 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Tmf1B9EKI3 Olfr1499-202ENSMUST00000216659 1834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Tmf1B9EKI3 Gm13928-201ENSMUST00000120326 1732 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Tmf1B9EKI3 A730020M07Rik-202ENSMUST00000196621 2370 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Tmf1B9EKI3 Gab3-203ENSMUST00000114109 2093 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Tmf1B9EKI3 Rd3l-203ENSMUST00000189759 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Tmf1B9EKI3 Olfr1065-202ENSMUST00000216162 2148 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Tmf1B9EKI3 Gm37311-201ENSMUST00000195541 2024 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Tmf1B9EKI3 Eps8-202ENSMUST00000100841 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Tmf1B9EKI3 Scn2a-201ENSMUST00000028377 8935 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Tmf1B9EKI3 6330410L21Rik-201ENSMUST00000199846 3871 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Tmf1B9EKI3 Lrp2bp-203ENSMUST00000110381 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Tmf1B9EKI3 AW551984-202ENSMUST00000119722 4224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Tmf1B9EKI3 Gm37181-201ENSMUST00000192513 1727 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Tmf1B9EKI3 Gm17017-201ENSMUST00000161540 2405 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Tmf1B9EKI3 Gm24429-201ENSMUST00000104076 132 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Tmf1B9EKI3 Gm7350-201ENSMUST00000120964 636 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Tmf1B9EKI3 Gm17907-201ENSMUST00000173150 710 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Tmf1B9EKI3 Ssxb8-202ENSMUST00000185125 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Tmf1B9EKI3 Gm28614-201ENSMUST00000186483 458 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Tmf1B9EKI3 Gm22897-202ENSMUST00000197782 127 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Tmf1B9EKI3 AC159379.1-201ENSMUST00000218192 620 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Tmf1B9EKI3 AC153522.1-201ENSMUST00000220047 1090 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Tmf1B9EKI3 AC123534.1-201ENSMUST00000224060 656 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Tmf1B9EKI3 Prl2a1-201ENSMUST00000023602 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Tmf1B9EKI3 Olfr1497-201ENSMUST00000061993 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Tmf1B9EKI3 Olfr1054-201ENSMUST00000099895 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Tmf1B9EKI3 Olfr725-202ENSMUST00000206920 1519 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Tmf1B9EKI3 Ccar1-211ENSMUST00000219527 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Tmf1B9EKI3 Smc2-202ENSMUST00000117280 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Tmf1B9EKI3 Nusap1-202ENSMUST00000068225 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Tmf1B9EKI3 Zfp27-205ENSMUST00000162592 3845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Tmf1B9EKI3 Olfr1357-202ENSMUST00000203305 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Tmf1B9EKI3 Gm9077-201ENSMUST00000210657 2298 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Tmf1B9EKI3 Gm16041-201ENSMUST00000144339 3725 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Tmf1B9EKI3 Gm5844-201ENSMUST00000119417 2191 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Tmf1B9EKI3 Gnal-202ENSMUST00000076605 5223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Tmf1B9EKI3 Mmp12-203ENSMUST00000120655 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Tmf1B9EKI3 A730004F24Rik-202ENSMUST00000195454 1704 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Tmf1B9EKI3 Olfr976-204ENSMUST00000217630 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Tmf1B9EKI3 Gm42860-201ENSMUST00000196492 3991 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Tmf1B9EKI3 Vmn1r11-203ENSMUST00000228235 2376 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Tmf1B9EKI3 Nlgn1-201ENSMUST00000075054 4359 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Tmf1B9EKI3 Ube2n-201ENSMUST00000099329 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Tmf1B9EKI3 Usp25-201ENSMUST00000023580 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Tmf1B9EKI3 Phyhipl-206ENSMUST00000162251 1540 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Tmf1B9EKI3 Gm37911-201ENSMUST00000193099 1545 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Tmf1B9EKI3 Olfr612-201ENSMUST00000104879 972 ntAPPRIS P1 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Tmf1B9EKI3 Tmco2-201ENSMUST00000106268 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Tmf1B9EKI3 Olfr75-ps1-201ENSMUST00000135477 938 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Tmf1B9EKI3 Gm26371-201ENSMUST00000157829 104 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Tmf1B9EKI3 Gm24186-201ENSMUST00000157983 127 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Tmf1B9EKI3 Gm27781-201ENSMUST00000185185 92 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Tmf1B9EKI3 1700111N16Rik-201ENSMUST00000188663 1133 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Tmf1B9EKI3 Gm2053-201ENSMUST00000195671 631 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Tmf1B9EKI3 Igkv12-47-201ENSMUST00000196961 356 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Tmf1B9EKI3 Gm42663-201ENSMUST00000199883 351 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Tmf1B9EKI3 Olfr563-ps1-201ENSMUST00000210909 873 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.9 ms