Protein–RNA interactions for Protein: A0A0N4SWI3

D6Ertd527e, DNA segment, Chr 6, ERATO Doi 527,-expressed, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Slc22a29-205ENSMUST00000222533 1473 ntTSL 5 BASIC3.08□□□□□ -1.92
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Casp1-201ENSMUST00000027015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Slc22a29-201ENSMUST00000113298 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 4933403O08Rik-203ENSMUST00000164272 1517 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Amd2-201ENSMUST00000080898 3218 ntAPPRIS P1 BASIC3.08□□□□□ -1.92
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pkhd1-201ENSMUST00000088448 12935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pot1a-201ENSMUST00000115327 2447 ntTSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nme7-202ENSMUST00000191947 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cnot4-202ENSMUST00000114989 3279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Vmn2r6-201ENSMUST00000165012 2484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.08□□□□□ -1.92
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Vmn2r7-203ENSMUST00000168072 2484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.08□□□□□ -1.92
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Txlng-202ENSMUST00000112314 3348 ntTSL 2 BASIC3.08□□□□□ -1.92
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ugt2b35-201ENSMUST00000031186 3359 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.08□□□□□ -1.92
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Vmn2r116-201ENSMUST00000164856 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Agps-203ENSMUST00000175646 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.07□□□□□ -1.92
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm44424-201ENSMUST00000203438 1826 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm43211-201ENSMUST00000196901 1899 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr328-204ENSMUST00000216725 2904 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.07□□□□□ -1.92
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fndc3c1-201ENSMUST00000039447 4859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm37049-201ENSMUST00000194356 1983 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr535-203ENSMUST00000213715 5033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.07□□□□□ -1.92
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fmo2-201ENSMUST00000045902 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dnah8-201ENSMUST00000170651 14583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr1383-202ENSMUST00000204706 4168 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.07□□□□□ -1.92
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr1115-204ENSMUST00000217196 2109 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.07□□□□□ -1.92
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pfkfb2-202ENSMUST00000066863 4425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm43872-201ENSMUST00000203218 2213 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Trpc5os-202ENSMUST00000178233 3515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.07□□□□□ -1.92
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AW046200-203ENSMUST00000211787 2479 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Iglv2-201ENSMUST00000103752 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC3.07□□□□□ -1.92
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm15297-201ENSMUST00000117795 290 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm13491-201ENSMUST00000118267 235 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Xlr3e-ps-201ENSMUST00000119644 682 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mup-ps18-201ENSMUST00000120145 531 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm11369-201ENSMUST00000120812 318 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Xlr3d-ps-201ENSMUST00000121687 658 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Crls1-204ENSMUST00000124836 1267 ntTSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm11714-201ENSMUST00000136927 876 ntTSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm15589-201ENSMUST00000144193 271 ntTSL 3 BASIC3.07□□□□□ -1.92
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Vmn1r101-201ENSMUST00000164245 924 ntAPPRIS P1 BASIC3.07□□□□□ -1.92
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Vmn1r119-201ENSMUST00000164683 924 ntAPPRIS P1 BASIC3.07□□□□□ -1.92
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm6872-201ENSMUST00000165001 700 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Vmn1r149-201ENSMUST00000165916 924 ntAPPRIS P1 BASIC3.07□□□□□ -1.92
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm4187-201ENSMUST00000172551 924 ntAPPRIS P1 BASIC3.07□□□□□ -1.92
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm4133-201ENSMUST00000172989 924 ntAPPRIS P1 BASIC3.07□□□□□ -1.92
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm21860-201ENSMUST00000177893 309 ntAPPRIS P1 BASIC3.07□□□□□ -1.92
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm21748-201ENSMUST00000179623 309 ntAPPRIS P1 BASIC3.07□□□□□ -1.92
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm27875-201ENSMUST00000184425 123 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Scgb3a2-202ENSMUST00000187157 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm28426-201ENSMUST00000187385 620 ntTSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm28468-201ENSMUST00000188536 615 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm29332-201ENSMUST00000190829 227 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm36986-201ENSMUST00000195320 353 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm43309-201ENSMUST00000200837 458 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm43418-201ENSMUST00000201334 428 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm43629-201ENSMUST00000201782 704 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm18205-201ENSMUST00000209215 841 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm9655-201ENSMUST00000211321 1284 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm18924-201ENSMUST00000211929 316 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC154295.1-201ENSMUST00000217210 621 ntTSL 3 BASIC3.07□□□□□ -1.92
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm6906-201ENSMUST00000218014 569 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC158803.3-201ENSMUST00000220024 211 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC134439.1-201ENSMUST00000220923 600 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC192616.2-201ENSMUST00000221482 3841 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Prl2c2-203ENSMUST00000221612 596 ntTSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC131178.1-201ENSMUST00000228649 492 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 n-R5s88-201ENSMUST00000083173 118 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm24763-201ENSMUST00000083688 190 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm10521-201ENSMUST00000097466 2574 ntAPPRIS P1 BASIC3.07□□□□□ -1.92
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm14569-204ENSMUST00000169499 5181 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.07□□□□□ -1.92
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Capn13-201ENSMUST00000095208 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.07□□□□□ -1.92
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gbp7-201ENSMUST00000045097 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cd33-203ENSMUST00000205503 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm7416-201ENSMUST00000117448 1487 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rfx6-201ENSMUST00000050455 3088 ntTSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sult1c1-201ENSMUST00000024738 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Muc15-202ENSMUST00000111016 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC151734.1-201ENSMUST00000227023 1740 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm43466-201ENSMUST00000197836 5214 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gnal-202ENSMUST00000076605 5223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lgi1-204ENSMUST00000196090 1789 ntTSL 5 BASIC3.07□□□□□ -1.92
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mrgprb2-201ENSMUST00000052730 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm2539-201ENSMUST00000180720 2411 ntTSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 A830019L24Rik-202ENSMUST00000198056 3165 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr684-202ENSMUST00000215552 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr684-204ENSMUST00000217136 3182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm44822-201ENSMUST00000208559 6389 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Siae-201ENSMUST00000002007 3339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Med13-201ENSMUST00000043624 10546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.06□□□□□ -1.92
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Vmn1r219-203ENSMUST00000227388 7948 ntAPPRIS P1 BASIC3.06□□□□□ -1.92
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dhrs9-201ENSMUST00000063690 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ash1l-201ENSMUST00000090933 11268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm26300-201ENSMUST00000102282 94 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Trbv26-201ENSMUST00000103280 344 ntAPPRIS ALT2 BASIC3.06□□□□□ -1.92
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm22657-201ENSMUST00000104197 132 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm14139-202ENSMUST00000109929 1485 ntTSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm22488-201ENSMUST00000116811 127 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm14857-201ENSMUST00000117862 3185 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hspe1-ps5-201ENSMUST00000118080 297 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm12281-201ENSMUST00000119536 298 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80 ms