Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Lgals1-ps1-201ENSMUST00000173500 368 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Col5a3Q9JLI2 Mir3471-2-201ENSMUST00000174896 102 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Col5a3Q9JLI2 Gm8993-201ENSMUST00000182182 983 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Col5a3Q9JLI2 Olr1-204ENSMUST00000183258 468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
Col5a3Q9JLI2 Gm27883-201ENSMUST00000183941 102 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Col5a3Q9JLI2 Gm27387-201ENSMUST00000184583 116 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Col5a3Q9JLI2 Olfr1391-201ENSMUST00000187509 938 ntAPPRIS P1 BASIC5.43□□□□□ -1.54
Col5a3Q9JLI2 Gm5252-201ENSMUST00000189030 909 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Col5a3Q9JLI2 C4bp-ps1-201ENSMUST00000189393 706 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Col5a3Q9JLI2 Gm37480-201ENSMUST00000194795 550 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
Col5a3Q9JLI2 Gm8458-201ENSMUST00000196658 819 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Col5a3Q9JLI2 Gm33962-202ENSMUST00000205195 630 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
Col5a3Q9JLI2 Gm9655-201ENSMUST00000211321 1284 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Col5a3Q9JLI2 AC159821.1-201ENSMUST00000214934 248 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
Col5a3Q9JLI2 Gm34165-201ENSMUST00000222012 1174 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Col5a3Q9JLI2 CT025552.2-201ENSMUST00000225497 317 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Col5a3Q9JLI2 n-R5s168-201ENSMUST00000083948 104 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Col5a3Q9JLI2 Olfr553-202ENSMUST00000216776 3972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
Col5a3Q9JLI2 AC158779.2-201ENSMUST00000227902 1947 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
Col5a3Q9JLI2 Gm17435-201ENSMUST00000181452 2994 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
Col5a3Q9JLI2 Zfp758-202ENSMUST00000088765 2973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
Col5a3Q9JLI2 Gm2381-201ENSMUST00000174558 4073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
Col5a3Q9JLI2 Erc2-208ENSMUST00000210924 4871 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
Col5a3Q9JLI2 Sestd1-202ENSMUST00000102660 8990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
Col5a3Q9JLI2 Npy2r-202ENSMUST00000098997 3325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
Col5a3Q9JLI2 Gm5746-201ENSMUST00000183550 2200 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
Col5a3Q9JLI2 Gm18422-202ENSMUST00000203798 2214 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
Col5a3Q9JLI2 Sult1c1-201ENSMUST00000024738 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
Col5a3Q9JLI2 Gm34004-201ENSMUST00000215460 2837 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
Col5a3Q9JLI2 BB019430-202ENSMUST00000218015 1320 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
Col5a3Q9JLI2 AC154354.1-201ENSMUST00000224585 2109 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
Col5a3Q9JLI2 Amot-202ENSMUST00000112836 6957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
Col5a3Q9JLI2 Gm31218-201ENSMUST00000221181 1498 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
Col5a3Q9JLI2 Spata17-202ENSMUST00000110945 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
Col5a3Q9JLI2 Gm14878-201ENSMUST00000118167 293 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
Col5a3Q9JLI2 Gm16259-201ENSMUST00000145241 553 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
Col5a3Q9JLI2 Gm22160-201ENSMUST00000158405 328 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
Col5a3Q9JLI2 Gm29540-201ENSMUST00000188207 337 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
Col5a3Q9JLI2 Gm37209-201ENSMUST00000194109 1276 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
Col5a3Q9JLI2 Gm45651-201ENSMUST00000210857 335 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
Col5a3Q9JLI2 4930442G10Rik-202ENSMUST00000221968 1096 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
Col5a3Q9JLI2 CT030195.1-201ENSMUST00000223887 378 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
Col5a3Q9JLI2 Meig1-201ENSMUST00000064685 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
Col5a3Q9JLI2 Olfr1200-201ENSMUST00000099811 1011 ntAPPRIS P1 BASIC5.42□□□□□ -1.54
Col5a3Q9JLI2 Gm43363-201ENSMUST00000201590 2647 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
Col5a3Q9JLI2 Capn6-201ENSMUST00000087316 3561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
Col5a3Q9JLI2 Gm37767-201ENSMUST00000193239 1834 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
Col5a3Q9JLI2 Olfr510-204ENSMUST00000217170 2997 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
Col5a3Q9JLI2 Grik2-207ENSMUST00000218823 9427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
Col5a3Q9JLI2 Ndnf-201ENSMUST00000054351 10101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
Col5a3Q9JLI2 Platr25-202ENSMUST00000220733 2859 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
Col5a3Q9JLI2 Olfr1443-203ENSMUST00000215134 3995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
Col5a3Q9JLI2 Gm10415-201ENSMUST00000204181 2825 ntTSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
Col5a3Q9JLI2 Apbb2-210ENSMUST00000160870 6526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
Col5a3Q9JLI2 Zdhhc17-201ENSMUST00000041723 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
Col5a3Q9JLI2 Cyld-202ENSMUST00000098519 7954 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
Col5a3Q9JLI2 Vps41-201ENSMUST00000072961 3199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
Col5a3Q9JLI2 G930045G22Rik-201ENSMUST00000101402 480 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
Col5a3Q9JLI2 Trav10-201ENSMUST00000103583 406 ntAPPRIS P1 BASIC5.41□□□□□ -1.54
Col5a3Q9JLI2 Gm14909-201ENSMUST00000117853 351 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
Col5a3Q9JLI2 Gm15600-201ENSMUST00000153522 856 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
Col5a3Q9JLI2 Rab26os-202ENSMUST00000176921 298 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
Col5a3Q9JLI2 Mir1957b-201ENSMUST00000184608 123 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
Col5a3Q9JLI2 Gm19585-201ENSMUST00000186007 587 ntTSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
Col5a3Q9JLI2 Gm28685-201ENSMUST00000187545 1101 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
Col5a3Q9JLI2 Gm18177-201ENSMUST00000188373 404 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
Col5a3Q9JLI2 Gm8861-201ENSMUST00000196346 832 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
Col5a3Q9JLI2 Obox4-ps32-201ENSMUST00000196512 537 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
Col5a3Q9JLI2 Gm8891-201ENSMUST00000198546 832 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
Col5a3Q9JLI2 Gm42982-201ENSMUST00000198574 687 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
Col5a3Q9JLI2 Rprd2-202ENSMUST00000197449 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
Col5a3Q9JLI2 Plch1-203ENSMUST00000084105 6245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
Col5a3Q9JLI2 Ikzf2-201ENSMUST00000027146 9278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
Col5a3Q9JLI2 CT025710.1-201ENSMUST00000222949 2533 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
Col5a3Q9JLI2 Inpp4b-202ENSMUST00000109851 3906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
Col5a3Q9JLI2 Sbf2-208ENSMUST00000166020 5481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
Col5a3Q9JLI2 Gm42725-201ENSMUST00000199296 4193 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
Col5a3Q9JLI2 Olfr859-202ENSMUST00000212540 9532 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
Col5a3Q9JLI2 AC123705.3-201ENSMUST00000223531 2069 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Col5a3Q9JLI2 Map9-201ENSMUST00000091014 6218 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
Col5a3Q9JLI2 Gm20707-201ENSMUST00000176201 2516 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
Col5a3Q9JLI2 Scgb2b3-201ENSMUST00000108090 339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
Col5a3Q9JLI2 Rps15a-ps4-201ENSMUST00000119415 392 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Col5a3Q9JLI2 n-R5s21-201ENSMUST00000122692 117 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Col5a3Q9JLI2 4930548K13Rik-201ENSMUST00000154459 561 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
Col5a3Q9JLI2 Gm23501-201ENSMUST00000157744 256 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Col5a3Q9JLI2 Gm6619-201ENSMUST00000159229 608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
Col5a3Q9JLI2 Gm18128-201ENSMUST00000172625 511 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Col5a3Q9JLI2 Gm20673-201ENSMUST00000177167 430 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Col5a3Q9JLI2 Gm19131-201ENSMUST00000203408 789 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Col5a3Q9JLI2 Gm44739-201ENSMUST00000205294 1426 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Col5a3Q9JLI2 4930402F11Rik-204ENSMUST00000208612 1405 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
Col5a3Q9JLI2 Gm5339-201ENSMUST00000210551 1102 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Col5a3Q9JLI2 Gm40392-201ENSMUST00000220656 562 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
Col5a3Q9JLI2 Gm18601-201ENSMUST00000220831 634 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Col5a3Q9JLI2 Pglyrp3-201ENSMUST00000047660 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
Col5a3Q9JLI2 Otc-201ENSMUST00000049910 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
Col5a3Q9JLI2 Olfr739-201ENSMUST00000075261 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.4□□□□□ -1.54
Col5a3Q9JLI2 Amer1-201ENSMUST00000084535 8496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
Col5a3Q9JLI2 Heatr1-201ENSMUST00000059270 6780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.2 ms