Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 2310079G19Rik-201ENSMUST00000052337 881 ntAPPRIS P1 BASIC6.14□□□□□ -1.43
Ccdc47Q9D024 Olfr371-201ENSMUST00000070849 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.14□□□□□ -1.43
Ccdc47Q9D024 Olfr801-201ENSMUST00000072063 957 ntAPPRIS P1 BASIC6.14□□□□□ -1.43
Ccdc47Q9D024 Pirb-201ENSMUST00000078451 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
Ccdc47Q9D024 Mir129-1-201ENSMUST00000083535 73 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
Ccdc47Q9D024 Vmn1r171-211ENSMUST00000228559 2637 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
Ccdc47Q9D024 Vmn1r171-213ENSMUST00000228681 2633 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
Ccdc47Q9D024 Lipm-201ENSMUST00000025685 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
Ccdc47Q9D024 4933404K08Rik-201ENSMUST00000156977 1434 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
Ccdc47Q9D024 Olfr906-202ENSMUST00000214344 3775 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.43
Ccdc47Q9D024 AC153532.2-201ENSMUST00000219753 3844 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
Ccdc47Q9D024 Gm37781-201ENSMUST00000194773 3218 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
Ccdc47Q9D024 Zfp955b-201ENSMUST00000099414 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
Ccdc47Q9D024 Abcb11-201ENSMUST00000102709 5025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
Ccdc47Q9D024 Gm43283-201ENSMUST00000199138 2548 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
Ccdc47Q9D024 Cnot4-203ENSMUST00000114993 3473 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
Ccdc47Q9D024 Zbed4-ps1-201ENSMUST00000186734 3466 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
Ccdc47Q9D024 Agps-203ENSMUST00000175646 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
Ccdc47Q9D024 Ints12-201ENSMUST00000029650 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
Ccdc47Q9D024 Spef2-201ENSMUST00000041840 4247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
Ccdc47Q9D024 Gm43000-201ENSMUST00000198482 3343 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
Ccdc47Q9D024 Vmn1r6-205ENSMUST00000227631 7805 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
Ccdc47Q9D024 Olfr78-201ENSMUST00000060187 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
Ccdc47Q9D024 Vmn1r171-210ENSMUST00000228484 2421 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
Ccdc47Q9D024 Vmn1r71-204ENSMUST00000227702 5034 ntAPPRIS P2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
Ccdc47Q9D024 Gm15073-201ENSMUST00000117432 634 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
Ccdc47Q9D024 Gm15493-201ENSMUST00000119461 528 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
Ccdc47Q9D024 Gm13533-201ENSMUST00000121104 177 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
Ccdc47Q9D024 Gm5383-201ENSMUST00000121177 617 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
Ccdc47Q9D024 Gm25176-201ENSMUST00000122640 125 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
Ccdc47Q9D024 Gm12569-202ENSMUST00000126189 796 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
Ccdc47Q9D024 Gm12753-201ENSMUST00000152086 653 ntTSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
Ccdc47Q9D024 Gm15600-201ENSMUST00000153522 856 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
Ccdc47Q9D024 Gm24065-201ENSMUST00000157487 264 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
Ccdc47Q9D024 Gm27234-201ENSMUST00000183362 581 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
Ccdc47Q9D024 Gm27820-201ENSMUST00000183628 175 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
Ccdc47Q9D024 Gm27985-201ENSMUST00000185112 378 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
Ccdc47Q9D024 Gm43215-201ENSMUST00000199108 252 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
Ccdc47Q9D024 Gm43554-201ENSMUST00000199987 186 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
Ccdc47Q9D024 Gm44281-201ENSMUST00000203090 166 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
Ccdc47Q9D024 Gm45215-201ENSMUST00000206407 395 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
Ccdc47Q9D024 Gm5418-201ENSMUST00000206932 528 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
Ccdc47Q9D024 Lrrc72-201ENSMUST00000020853 660 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
Ccdc47Q9D024 4930558N11Rik-203ENSMUST00000211456 1180 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
Ccdc47Q9D024 Gm17999-201ENSMUST00000211568 542 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
Ccdc47Q9D024 Prl3d1-202ENSMUST00000225330 866 ntAPPRIS P2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
Ccdc47Q9D024 Vmn1r43-201ENSMUST00000089418 1069 ntAPPRIS P1 BASIC6.13□□□□□ -1.43
Ccdc47Q9D024 Stxbp3-ps-201ENSMUST00000090527 758 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
Ccdc47Q9D024 Adgrv1-201ENSMUST00000095585 19338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
Ccdc47Q9D024 Gm11264-201ENSMUST00000143755 2969 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
Ccdc47Q9D024 Clec4a1-201ENSMUST00000060484 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
Ccdc47Q9D024 A730004F24Rik-202ENSMUST00000195454 1704 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
Ccdc47Q9D024 Olfr1065-202ENSMUST00000216162 2148 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
Ccdc47Q9D024 Gm37776-201ENSMUST00000193471 2497 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
Ccdc47Q9D024 Olfr676-204ENSMUST00000219602 2802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
Ccdc47Q9D024 Olfr403-202ENSMUST00000206114 3444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
Ccdc47Q9D024 Vcam1-201ENSMUST00000029574 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
Ccdc47Q9D024 Dync2h1-201ENSMUST00000048417 13972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
Ccdc47Q9D024 Gm37400-201ENSMUST00000193148 3605 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Ccdc47Q9D024 Tlr6-201ENSMUST00000062315 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
Ccdc47Q9D024 Olfr1383-202ENSMUST00000204706 4168 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
Ccdc47Q9D024 Gm44518-201ENSMUST00000208080 4370 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Ccdc47Q9D024 Gm16513-201ENSMUST00000101023 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
Ccdc47Q9D024 Trav12n-1-201ENSMUST00000103587 344 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
Ccdc47Q9D024 Gm24350-201ENSMUST00000104163 133 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Ccdc47Q9D024 Olfr1196-201ENSMUST00000104892 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.12□□□□□ -1.43
Ccdc47Q9D024 Csnk2a1-ps-201ENSMUST00000118846 1175 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Ccdc47Q9D024 Gm13928-201ENSMUST00000120326 1732 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Ccdc47Q9D024 Gm24295-201ENSMUST00000158298 131 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Ccdc47Q9D024 Nup205-202ENSMUST00000170234 1120 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
Ccdc47Q9D024 Trav12d-1-202ENSMUST00000183652 344 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
Ccdc47Q9D024 Gm21842-202ENSMUST00000185311 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
Ccdc47Q9D024 Gm29285-201ENSMUST00000185500 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
Ccdc47Q9D024 Gm21801-202ENSMUST00000185537 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
Ccdc47Q9D024 Gm28312-201ENSMUST00000185976 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
Ccdc47Q9D024 Gm29213-201ENSMUST00000186199 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
Ccdc47Q9D024 Rhoay-ps2-201ENSMUST00000186362 581 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Ccdc47Q9D024 Gm21428-201ENSMUST00000186550 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
Ccdc47Q9D024 Gm29370-201ENSMUST00000186581 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
Ccdc47Q9D024 Gm28604-201ENSMUST00000186629 484 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Ccdc47Q9D024 Gm21633-202ENSMUST00000186630 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
Ccdc47Q9D024 Gm2325-201ENSMUST00000186637 581 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Ccdc47Q9D024 Gm28890-201ENSMUST00000186686 173 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
Ccdc47Q9D024 Gm28092-201ENSMUST00000186709 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
Ccdc47Q9D024 Gm28566-201ENSMUST00000186714 484 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Ccdc47Q9D024 Gm21572-202ENSMUST00000186850 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
Ccdc47Q9D024 Gm21916-202ENSMUST00000187044 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
Ccdc47Q9D024 Gm29839-201ENSMUST00000187045 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
Ccdc47Q9D024 Gm28442-201ENSMUST00000187052 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
Ccdc47Q9D024 Gm21780-202ENSMUST00000187110 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
Ccdc47Q9D024 Gm29656-201ENSMUST00000187236 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
Ccdc47Q9D024 Gm21821-202ENSMUST00000187288 175 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
Ccdc47Q9D024 Gm28886-201ENSMUST00000187350 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
Ccdc47Q9D024 Gm21599-202ENSMUST00000187381 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
Ccdc47Q9D024 Gm28128-201ENSMUST00000187403 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
Ccdc47Q9D024 Gm21450-201ENSMUST00000187408 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
Ccdc47Q9D024 Gm28194-201ENSMUST00000187412 484 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Ccdc47Q9D024 Gm28689-201ENSMUST00000187441 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
Ccdc47Q9D024 Gm28851-201ENSMUST00000187800 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
Ccdc47Q9D024 Gm28886-202ENSMUST00000187889 484 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
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