Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEG8

Usp27, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 27, mousemouse

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp27Q8CEG8 Gm29536-201ENSMUST00000189296 3283 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
Usp27Q8CEG8 Gm8141-201ENSMUST00000190856 1723 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
Usp27Q8CEG8 Msr1-202ENSMUST00000170091 3636 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
Usp27Q8CEG8 Vmn2r43-201ENSMUST00000066317 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
Usp27Q8CEG8 Gm37964-201ENSMUST00000192459 4905 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
Usp27Q8CEG8 Trac-201ENSMUST00000103740 413 ntAPPRIS P1 BASIC5.32□□□□□ -1.56
Usp27Q8CEG8 Gm15531-201ENSMUST00000118062 252 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
Usp27Q8CEG8 Gm15012-201ENSMUST00000119176 106 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
Usp27Q8CEG8 Gm16200-201ENSMUST00000120385 331 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
Usp27Q8CEG8 Gm21990-201ENSMUST00000124692 383 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
Usp27Q8CEG8 Gm14027-201ENSMUST00000135186 622 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
Usp27Q8CEG8 Gm15819-201ENSMUST00000153089 481 ntTSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
Usp27Q8CEG8 Gm12602-202ENSMUST00000154352 707 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
Usp27Q8CEG8 Gm25906-201ENSMUST00000158489 126 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
Usp27Q8CEG8 Gm17102-201ENSMUST00000170929 906 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
Usp27Q8CEG8 Rpl9-ps9-201ENSMUST00000173020 573 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
Usp27Q8CEG8 Gm20519-201ENSMUST00000173684 359 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
Usp27Q8CEG8 Vmn1r60-201ENSMUST00000173782 1007 ntAPPRIS P1 BASIC5.32□□□□□ -1.56
Usp27Q8CEG8 Gm18348-201ENSMUST00000191227 820 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
Usp27Q8CEG8 Gm43724-201ENSMUST00000197516 226 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
Usp27Q8CEG8 Gm19708-201ENSMUST00000199386 543 ntTSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
Usp27Q8CEG8 Gm42579-201ENSMUST00000200512 734 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
Usp27Q8CEG8 Gm43036-201ENSMUST00000200594 373 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
Usp27Q8CEG8 Gm34096-201ENSMUST00000211296 530 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
Usp27Q8CEG8 Gm45733-201ENSMUST00000212988 437 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
Usp27Q8CEG8 Gm19169-201ENSMUST00000220109 1246 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
Usp27Q8CEG8 CT009754.4-201ENSMUST00000221430 565 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
Usp27Q8CEG8 Gm40653-202ENSMUST00000222122 1155 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
Usp27Q8CEG8 AC102291.1-201ENSMUST00000227164 529 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
Usp27Q8CEG8 Rnase2a-201ENSMUST00000061936 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
Usp27Q8CEG8 Gm23511-201ENSMUST00000083084 164 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
Usp27Q8CEG8 Mir188-201ENSMUST00000083464 68 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
Usp27Q8CEG8 Mir338-201ENSMUST00000083666 98 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
Usp27Q8CEG8 Gm30211-201ENSMUST00000197227 3078 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
Usp27Q8CEG8 Mndal-201ENSMUST00000111210 1907 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
Usp27Q8CEG8 Gm13590-201ENSMUST00000120183 1588 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
Usp27Q8CEG8 Gm18186-201ENSMUST00000192239 1580 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
Usp27Q8CEG8 Zfp874b-201ENSMUST00000019572 3744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
Usp27Q8CEG8 Gm3115-201ENSMUST00000166928 1797 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
Usp27Q8CEG8 Gm26753-201ENSMUST00000181938 2731 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
Usp27Q8CEG8 Enpp3-201ENSMUST00000020169 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
Usp27Q8CEG8 Vmn1r71-202ENSMUST00000226874 5194 ntAPPRIS P2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
Usp27Q8CEG8 Cyp2c70-201ENSMUST00000051846 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
Usp27Q8CEG8 Nop58-215ENSMUST00000191142 9507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
Usp27Q8CEG8 Gm42559-201ENSMUST00000201811 3532 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
Usp27Q8CEG8 Gm45066-201ENSMUST00000207528 2551 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
Usp27Q8CEG8 Sdr16c6-202ENSMUST00000108383 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
Usp27Q8CEG8 Trav5-1-201ENSMUST00000103570 343 ntAPPRIS P1 BASIC5.31□□□□□ -1.56
Usp27Q8CEG8 Trav12n-1-201ENSMUST00000103587 344 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
Usp27Q8CEG8 Gm23750-201ENSMUST00000104222 132 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
Usp27Q8CEG8 Gnrh1-201ENSMUST00000111095 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
Usp27Q8CEG8 Gm22194-201ENSMUST00000116869 95 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
Usp27Q8CEG8 Gm12717-201ENSMUST00000118427 983 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
Usp27Q8CEG8 Hbb-bh3-201ENSMUST00000118954 266 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
Usp27Q8CEG8 Gm15741-201ENSMUST00000119401 754 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
Usp27Q8CEG8 Gm12704-201ENSMUST00000119789 464 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
Usp27Q8CEG8 Gm14716-201ENSMUST00000120138 718 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
Usp27Q8CEG8 Gm12332-201ENSMUST00000121397 922 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
Usp27Q8CEG8 Gm11804-201ENSMUST00000121663 468 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
Usp27Q8CEG8 n-R5s61-201ENSMUST00000122711 118 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
Usp27Q8CEG8 Sspnos-201ENSMUST00000139089 826 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
Usp27Q8CEG8 Gm14697-201ENSMUST00000147144 648 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
Usp27Q8CEG8 Gm13839-201ENSMUST00000151639 506 ntTSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
Usp27Q8CEG8 Ear-ps5-201ENSMUST00000164700 463 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
Usp27Q8CEG8 Gm4134-201ENSMUST00000173244 563 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
Usp27Q8CEG8 Vmn1r10-201ENSMUST00000176073 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.31□□□□□ -1.56
Usp27Q8CEG8 Rps12-ps24-201ENSMUST00000182321 381 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
Usp27Q8CEG8 Trav12d-1-202ENSMUST00000183652 344 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
Usp27Q8CEG8 Gm29161-201ENSMUST00000188250 699 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
Usp27Q8CEG8 Rrh-208ENSMUST00000200079 1106 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
Usp27Q8CEG8 Nts-201ENSMUST00000020040 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
Usp27Q8CEG8 Gm43973-201ENSMUST00000203562 210 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
Usp27Q8CEG8 Gm5581-202ENSMUST00000204992 714 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
Usp27Q8CEG8 Gm39090-202ENSMUST00000205992 508 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
Usp27Q8CEG8 Gm45249-201ENSMUST00000211021 348 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
Usp27Q8CEG8 AC153532.3-201ENSMUST00000218660 3848 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
Usp27Q8CEG8 Gm3086-202ENSMUST00000221248 310 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
Usp27Q8CEG8 CT033778.1-201ENSMUST00000224767 767 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
Usp27Q8CEG8 Trappc1-201ENSMUST00000060956 628 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
Usp27Q8CEG8 Bcl2l15-201ENSMUST00000062945 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
Usp27Q8CEG8 Olfr685-202ENSMUST00000209409 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
Usp27Q8CEG8 Gm5141-201ENSMUST00000167516 1743 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
Usp27Q8CEG8 AC133076.2-201ENSMUST00000227678 3532 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
Usp27Q8CEG8 Zfand6-201ENSMUST00000069537 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
Usp27Q8CEG8 Olfr364-ps1-202ENSMUST00000214905 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
Usp27Q8CEG8 Olfr181-201ENSMUST00000075361 1391 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
Usp27Q8CEG8 Zfp935-201ENSMUST00000076195 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
Usp27Q8CEG8 Nfia-205ENSMUST00000107062 9239 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
Usp27Q8CEG8 Cd33-203ENSMUST00000205503 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
Usp27Q8CEG8 Spata1-206ENSMUST00000197980 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
Usp27Q8CEG8 D7Ertd443e-202ENSMUST00000106129 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
Usp27Q8CEG8 Slc15a2-201ENSMUST00000023616 3993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
Usp27Q8CEG8 Vmn1r185-203ENSMUST00000227264 5589 ntAPPRIS P1 BASIC5.3□□□□□ -1.56
Usp27Q8CEG8 Gm37205-201ENSMUST00000194820 2736 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Usp27Q8CEG8 Gm3636-201ENSMUST00000100904 519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
Usp27Q8CEG8 Gm3173-201ENSMUST00000112776 519 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
Usp27Q8CEG8 Gm14086-201ENSMUST00000117152 173 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Usp27Q8CEG8 Olfr1146-ps1-201ENSMUST00000117180 943 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Usp27Q8CEG8 Psmb6-ps-201ENSMUST00000117520 713 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Usp27Q8CEG8 Gm13679-201ENSMUST00000118678 484 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.8 ms