Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0C4

Ccser1, Serine-rich coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 895 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccser1Q8C0C4 Fxyd3-201ENSMUST00000072331 439 ntTSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Ccser1Q8C0C4 Olfr488-201ENSMUST00000072968 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Ccser1Q8C0C4 Vmn1r216-201ENSMUST00000080253 1059 ntAPPRIS P1 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Ccser1Q8C0C4 Gm23102-201ENSMUST00000083724 116 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Ccser1Q8C0C4 Gm26163-201ENSMUST00000083792 178 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Ccser1Q8C0C4 n-R5s46-201ENSMUST00000083960 116 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Ccser1Q8C0C4 Ccl8-201ENSMUST00000009329 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
Ccser1Q8C0C4 Enpp3-201ENSMUST00000020169 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
Ccser1Q8C0C4 Dnhd1-203ENSMUST00000145988 14536 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Ccser1Q8C0C4 Naip2-201ENSMUST00000067975 4709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
Ccser1Q8C0C4 Ryr3-201ENSMUST00000080673 15422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Ccser1Q8C0C4 Agps-203ENSMUST00000175646 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Ccser1Q8C0C4 Slfn4-201ENSMUST00000000208 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
Ccser1Q8C0C4 Olfr461-202ENSMUST00000215009 4292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Ccser1Q8C0C4 Dtna-206ENSMUST00000221880 4490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Ccser1Q8C0C4 AC112972.2-201ENSMUST00000228702 2210 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Ccser1Q8C0C4 Gm26514-201ENSMUST00000181087 4231 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
Ccser1Q8C0C4 Impact-201ENSMUST00000025290 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Ccser1Q8C0C4 2700099C18Rik-204ENSMUST00000183133 1333 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Ccser1Q8C0C4 1700019D03Rik-203ENSMUST00000114493 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Ccser1Q8C0C4 Gm43154-208ENSMUST00000209658 1442 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Ccser1Q8C0C4 Cd44-203ENSMUST00000099673 2848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Ccser1Q8C0C4 Tmem209-204ENSMUST00000115160 3485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Ccser1Q8C0C4 Pcdh15-222ENSMUST00000147189 6806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Ccser1Q8C0C4 Rlf-203ENSMUST00000168615 6585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Ccser1Q8C0C4 Gm23692-201ENSMUST00000101881 160 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Ccser1Q8C0C4 Traj16-201ENSMUST00000103725 61 ntAPPRIS P1 BASIC6□□□□□ -1.45
Ccser1Q8C0C4 Gm25422-201ENSMUST00000104219 129 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Ccser1Q8C0C4 Cetn2-202ENSMUST00000114550 1124 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
Ccser1Q8C0C4 Ssxb9-201ENSMUST00000115584 879 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Ccser1Q8C0C4 Gm12901-201ENSMUST00000118690 532 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Ccser1Q8C0C4 Gm8430-201ENSMUST00000119780 471 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Ccser1Q8C0C4 Gm5401-201ENSMUST00000122444 365 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Ccser1Q8C0C4 Hsd11b1-203ENSMUST00000160929 1256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Ccser1Q8C0C4 Vmn1r-ps11-201ENSMUST00000176097 853 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Ccser1Q8C0C4 Gm21882-201ENSMUST00000178332 1083 ntAPPRIS P1 BASIC6□□□□□ -1.45
Ccser1Q8C0C4 5730522E02Rik-208ENSMUST00000179180 450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Ccser1Q8C0C4 1700101I11Rik-201ENSMUST00000181594 896 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Ccser1Q8C0C4 Gm26970-201ENSMUST00000182990 964 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Ccser1Q8C0C4 Gm27754-201ENSMUST00000183340 126 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Ccser1Q8C0C4 Gm4322-201ENSMUST00000191094 336 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Ccser1Q8C0C4 Gm2367-201ENSMUST00000192374 472 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Ccser1Q8C0C4 6430511E19Rik-201ENSMUST00000192772 3835 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Ccser1Q8C0C4 Gm37982-201ENSMUST00000193076 561 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Ccser1Q8C0C4 Gm44954-201ENSMUST00000208513 227 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Ccser1Q8C0C4 Gm2961-201ENSMUST00000211074 772 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Ccser1Q8C0C4 AC164164.2-201ENSMUST00000221809 785 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Ccser1Q8C0C4 9530014B07Rik-201ENSMUST00000221882 744 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Ccser1Q8C0C4 AC105407.3-201ENSMUST00000224161 648 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Ccser1Q8C0C4 AC157572.4-201ENSMUST00000228203 549 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Ccser1Q8C0C4 Prl2a1-201ENSMUST00000023602 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Ccser1Q8C0C4 Cetn2-201ENSMUST00000033713 1026 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Ccser1Q8C0C4 Rps11-ps4-201ENSMUST00000062226 474 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Ccser1Q8C0C4 Rps27a-ps2-201ENSMUST00000078766 467 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Ccser1Q8C0C4 Gm25682-201ENSMUST00000083942 164 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Ccser1Q8C0C4 Olfr552-201ENSMUST00000098223 954 ntAPPRIS P1 BASIC6□□□□□ -1.45
Ccser1Q8C0C4 Fap-208ENSMUST00000174234 2211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Ccser1Q8C0C4 Vmn1r6-202ENSMUST00000226689 8453 ntAPPRIS P2 BASIC6□□□□□ -1.45
Ccser1Q8C0C4 AC166344.3-203ENSMUST00000228117 1466 ntAPPRIS P1 BASIC6□□□□□ -1.45
Ccser1Q8C0C4 Rsrc2-210ENSMUST00000182489 1665 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Ccser1Q8C0C4 9230019H11Rik-201ENSMUST00000095874 2801 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Ccser1Q8C0C4 Cdc27-201ENSMUST00000093923 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Ccser1Q8C0C4 4930529C04Rik-201ENSMUST00000131367 3534 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Ccser1Q8C0C4 Olfr266-202ENSMUST00000213616 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Ccser1Q8C0C4 Sorbs2-231ENSMUST00000171337 5651 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Ccser1Q8C0C4 Clec4a2-202ENSMUST00000041779 2481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Ccser1Q8C0C4 Polk-201ENSMUST00000022172 4225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Ccser1Q8C0C4 Usp29-203ENSMUST00000198068 4420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Ccser1Q8C0C4 Trp53bp1-202ENSMUST00000110648 9621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Ccser1Q8C0C4 Armc4-201ENSMUST00000081275 3477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Ccser1Q8C0C4 Gm8853-201ENSMUST00000198366 1344 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Ccser1Q8C0C4 Zfhx4-203ENSMUST00000175866 11287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Ccser1Q8C0C4 Fcrl5-205ENSMUST00000194102 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Ccser1Q8C0C4 Olfr698-202ENSMUST00000214306 4006 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Ccser1Q8C0C4 Elavl4-201ENSMUST00000102722 4107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Ccser1Q8C0C4 Elavl4-203ENSMUST00000106597 4149 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Ccser1Q8C0C4 Gm37488-201ENSMUST00000195434 3374 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Ccser1Q8C0C4 Grin2b-201ENSMUST00000053880 24060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Ccser1Q8C0C4 Gm6545-201ENSMUST00000217186 1786 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Ccser1Q8C0C4 Fbxw13-201ENSMUST00000061456 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Ccser1Q8C0C4 Ascc3-206ENSMUST00000219226 1357 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Ccser1Q8C0C4 Gm24230-201ENSMUST00000104313 129 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Ccser1Q8C0C4 Casp8ap2-202ENSMUST00000108178 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Ccser1Q8C0C4 Zfp965-201ENSMUST00000109002 957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Ccser1Q8C0C4 1700006E09Rik-201ENSMUST00000010985 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Ccser1Q8C0C4 Gm16200-201ENSMUST00000120385 331 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Ccser1Q8C0C4 Astx4d-201ENSMUST00000123136 1149 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Ccser1Q8C0C4 Astx3-201ENSMUST00000123508 1150 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Ccser1Q8C0C4 Gm16725-201ENSMUST00000138744 1253 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Ccser1Q8C0C4 Astx4a-201ENSMUST00000177683 1149 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Ccser1Q8C0C4 Astx1c-201ENSMUST00000177724 1150 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Ccser1Q8C0C4 Astx4c-201ENSMUST00000178390 1149 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Ccser1Q8C0C4 Astx1b-201ENSMUST00000178608 1150 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Ccser1Q8C0C4 Astx2-201ENSMUST00000179135 1150 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Ccser1Q8C0C4 Astx4b-201ENSMUST00000179359 1149 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Ccser1Q8C0C4 Astx1a-201ENSMUST00000179529 1150 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Ccser1Q8C0C4 Astx5-201ENSMUST00000179723 1150 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Ccser1Q8C0C4 Astx6-201ENSMUST00000180281 1150 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Ccser1Q8C0C4 Mir6417-201ENSMUST00000183815 116 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Ccser1Q8C0C4 Gm28709-201ENSMUST00000186967 456 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
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