Protein–RNA interactions for Protein: Q80TM9

Nisch, Nischarin, mousemouse

Predictions only

Length 1,593 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NischQ80TM9 Ptprz1-204ENSMUST00000202102 4947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
NischQ80TM9 Ostn-201ENSMUST00000066852 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
NischQ80TM9 Prkaa1-201ENSMUST00000051186 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
NischQ80TM9 Crb1-204ENSMUST00000198445 6135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
NischQ80TM9 Abcb11-204ENSMUST00000180142 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
NischQ80TM9 Gm23465-201ENSMUST00000157134 262 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
NischQ80TM9 Gm22367-201ENSMUST00000178930 132 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
NischQ80TM9 Gm37088-201ENSMUST00000193887 406 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
NischQ80TM9 AC168881.1-201ENSMUST00000226018 430 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
NischQ80TM9 Zscan4-ps2-201ENSMUST00000091440 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
NischQ80TM9 Ttc33-202ENSMUST00000081640 1583 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
NischQ80TM9 Pm20d1-202ENSMUST00000112393 6900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
NischQ80TM9 Gm37779-201ENSMUST00000194221 3380 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
NischQ80TM9 Gm18508-201ENSMUST00000215790 1642 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
NischQ80TM9 Enox2-201ENSMUST00000033437 3170 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
NischQ80TM9 Zzz3-204ENSMUST00000106103 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
NischQ80TM9 Usp47-202ENSMUST00000210309 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
NischQ80TM9 Ktn1-209ENSMUST00000187262 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
NischQ80TM9 AC154329.1-201ENSMUST00000224408 3129 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
NischQ80TM9 Il13ra2-202ENSMUST00000112827 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
NischQ80TM9 Gm15206-201ENSMUST00000119143 454 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
NischQ80TM9 Gm16434-202ENSMUST00000177712 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
NischQ80TM9 Gm3453-202ENSMUST00000178308 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
NischQ80TM9 Gm6676-202ENSMUST00000178376 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
NischQ80TM9 Gm3127-203ENSMUST00000178386 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
NischQ80TM9 Gm3187-201ENSMUST00000178429 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
NischQ80TM9 Gm3685-202ENSMUST00000179199 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
NischQ80TM9 Gm32916-203ENSMUST00000208033 789 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
NischQ80TM9 AC158511.1-201ENSMUST00000223622 764 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
NischQ80TM9 Vmn1r171-210ENSMUST00000228484 2421 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
NischQ80TM9 Olfr986-204ENSMUST00000218134 3487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
NischQ80TM9 Kidins220-201ENSMUST00000066652 7409 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
NischQ80TM9 Spire1-202ENSMUST00000082243 4950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
NischQ80TM9 Gm31218-201ENSMUST00000221181 1498 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
NischQ80TM9 Gm21704-201ENSMUST00000169382 1573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
NischQ80TM9 Rbmy-202ENSMUST00000171534 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
NischQ80TM9 Gm21708-202ENSMUST00000188091 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
NischQ80TM9 Gm10256-203ENSMUST00000189964 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
NischQ80TM9 Tlr6-201ENSMUST00000062315 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
NischQ80TM9 AC120347.1-201ENSMUST00000223326 1639 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
NischQ80TM9 March1-204ENSMUST00000110253 2748 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
NischQ80TM9 Gm12717-201ENSMUST00000118427 983 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
NischQ80TM9 4930570N18Rik-201ENSMUST00000159273 332 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
NischQ80TM9 Gm5734-201ENSMUST00000189787 913 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
NischQ80TM9 Gm43968-201ENSMUST00000203388 389 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
NischQ80TM9 AC164087.1-201ENSMUST00000215174 733 ntTSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
NischQ80TM9 CT025617.1-201ENSMUST00000216487 725 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
NischQ80TM9 AC161252.2-201ENSMUST00000224978 374 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
NischQ80TM9 CT009600.2-201ENSMUST00000226638 481 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
NischQ80TM9 Gm24166-201ENSMUST00000082724 135 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
NischQ80TM9 Usp46-202ENSMUST00000119154 4738 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
NischQ80TM9 Tyr-201ENSMUST00000004770 6042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
NischQ80TM9 Mdc1-201ENSMUST00000082337 7335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
NischQ80TM9 Cped1-202ENSMUST00000115383 5690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
NischQ80TM9 Cetn2-202ENSMUST00000114550 1124 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
NischQ80TM9 Phf11b-201ENSMUST00000166121 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
NischQ80TM9 Prl8a2-201ENSMUST00000018403 939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
NischQ80TM9 1700015G11Rik-204ENSMUST00000190307 255 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
NischQ80TM9 Ighv10-4-201ENSMUST00000193702 299 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
NischQ80TM9 BC028528-201ENSMUST00000036360 752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
NischQ80TM9 Olfr33-201ENSMUST00000084817 957 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
NischQ80TM9 Olfr270-203ENSMUST00000215010 2502 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
NischQ80TM9 Nlrp4a-201ENSMUST00000068767 4259 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
NischQ80TM9 Pcdh15-202ENSMUST00000092420 6917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
NischQ80TM9 Srgap1-201ENSMUST00000020322 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
NischQ80TM9 AC102847.2-201ENSMUST00000227799 2906 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
NischQ80TM9 Pkd1l3-202ENSMUST00000109242 6606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
NischQ80TM9 Prrg1-201ENSMUST00000114024 3900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
NischQ80TM9 Gm15737-201ENSMUST00000113434 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
NischQ80TM9 Ceacam13-202ENSMUST00000108488 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
NischQ80TM9 Gm15779-201ENSMUST00000117470 412 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
NischQ80TM9 Olfr1149-ps1-201ENSMUST00000118232 691 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
NischQ80TM9 Gm12231-201ENSMUST00000119447 695 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
NischQ80TM9 Gm15517-201ENSMUST00000124863 251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
NischQ80TM9 Gm24363-201ENSMUST00000158440 311 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
NischQ80TM9 Vmn1r-ps28-201ENSMUST00000174767 942 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
NischQ80TM9 Gm20614-201ENSMUST00000177106 632 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
NischQ80TM9 CT025552.2-201ENSMUST00000225497 317 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
NischQ80TM9 Smc5-206ENSMUST00000226111 3265 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
NischQ80TM9 Gm45183-201ENSMUST00000207937 1497 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
NischQ80TM9 AC168056.3-201ENSMUST00000225395 2540 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
NischQ80TM9 Gm42615-201ENSMUST00000197704 1820 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
NischQ80TM9 C87977-204ENSMUST00000105757 1885 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
NischQ80TM9 Gm6503-201ENSMUST00000210829 2225 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
NischQ80TM9 Pomp-202ENSMUST00000201120 3850 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
NischQ80TM9 Vmn2r102-201ENSMUST00000171741 2574 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
NischQ80TM9 Iqca-207ENSMUST00000212394 2574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
NischQ80TM9 Vmn2r2-202ENSMUST00000177151 2727 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
NischQ80TM9 Olfr510-204ENSMUST00000217170 2997 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
NischQ80TM9 Olfr1340-203ENSMUST00000216242 3341 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
NischQ80TM9 Gm12112-201ENSMUST00000117772 231 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
NischQ80TM9 Gm9308-201ENSMUST00000119073 448 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
NischQ80TM9 Gm22343-201ENSMUST00000122648 286 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
NischQ80TM9 Skint2-204ENSMUST00000186969 1258 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
NischQ80TM9 Gm37972-201ENSMUST00000193497 379 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
NischQ80TM9 Gm42564-201ENSMUST00000196013 582 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
NischQ80TM9 Gm43441-201ENSMUST00000201458 205 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
NischQ80TM9 Gm44796-201ENSMUST00000205272 626 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
NischQ80TM9 Gm31931-201ENSMUST00000219666 222 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
NischQ80TM9 Tgif1-202ENSMUST00000118283 1388 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
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