Protein–RNA interactions for Protein: Q07409

Cntn3, Contactin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,028 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn3Q07409 1810053B23Rik-202ENSMUST00000185364 590 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
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Cntn3Q07409 Csn1s2b-204ENSMUST00000197301 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
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Cntn3Q07409 4930567K12Rik-201ENSMUST00000207593 1281 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
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Cntn3Q07409 4930549C15Rik-201ENSMUST00000221235 1260 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
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Cntn3Q07409 Cep112it-201ENSMUST00000143781 4813 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
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Cntn3Q07409 Fcf1-202ENSMUST00000171040 731 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
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Cntn3Q07409 Olfr758-ps1-201ENSMUST00000173901 841 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
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Cntn3Q07409 Gm29086-201ENSMUST00000186774 222 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Cntn3Q07409 Gm29085-201ENSMUST00000187108 225 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Cntn3Q07409 Gm28610-201ENSMUST00000187716 406 ntTSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Cntn3Q07409 Gm28502-201ENSMUST00000189781 476 ntTSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Cntn3Q07409 Gm28492-201ENSMUST00000190899 1019 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Cntn3Q07409 1700015C17Rik-201ENSMUST00000197297 239 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Cntn3Q07409 Gm9173-201ENSMUST00000198054 400 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Cntn3Q07409 BC049739-201ENSMUST00000202626 660 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
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