Protein–RNA interactions for Protein: P97350

Pkp1, Plakophilin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 728 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp1P97350 Gm16456-201ENSMUST00000174431 920 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Pkp1P97350 Prl-201ENSMUST00000018061 886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Pkp1P97350 Mir6416-201ENSMUST00000183664 117 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Pkp1P97350 Prl8a2-201ENSMUST00000018403 939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Pkp1P97350 Gm29159-201ENSMUST00000187969 379 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Pkp1P97350 Gm19154-201ENSMUST00000223330 940 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Pkp1P97350 AC241593.2-201ENSMUST00000225099 510 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Pkp1P97350 CT956049.1-201ENSMUST00000225671 763 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Pkp1P97350 AC154283.1-201ENSMUST00000228417 389 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Pkp1P97350 AC161269.1-201ENSMUST00000228426 318 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Pkp1P97350 2310061N02Rik-201ENSMUST00000050882 794 ntAPPRIS P1 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Pkp1P97350 Olfr1302-201ENSMUST00000054004 948 ntAPPRIS P2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Pkp1P97350 Olfr1257-201ENSMUST00000060795 1016 ntAPPRIS P1 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Pkp1P97350 Olfr552-201ENSMUST00000098223 954 ntAPPRIS P1 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Pkp1P97350 Gm37529-201ENSMUST00000195618 4321 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Pkp1P97350 Wdr17-209ENSMUST00000150488 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Pkp1P97350 Plcz1-201ENSMUST00000032356 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Pkp1P97350 Gm9923-201ENSMUST00000217785 1836 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Pkp1P97350 Clk4-203ENSMUST00000109113 1627 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Pkp1P97350 Gm42869-201ENSMUST00000199953 2121 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Pkp1P97350 Zfp143-202ENSMUST00000169638 2914 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Pkp1P97350 Postn-202ENSMUST00000081564 2670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Pkp1P97350 Zp3r-202ENSMUST00000128128 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Pkp1P97350 Olfr1406-202ENSMUST00000201132 2952 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Pkp1P97350 Olfr123-203ENSMUST00000216051 2716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Pkp1P97350 Lrrn3-201ENSMUST00000043884 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Pkp1P97350 Pfkfb2-202ENSMUST00000066863 4425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Pkp1P97350 Adam25-201ENSMUST00000096663 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Pkp1P97350 AC122357.1-201ENSMUST00000221652 1515 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Pkp1P97350 Olfr378-201ENSMUST00000069790 1508 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Pkp1P97350 Zfp280c-201ENSMUST00000072292 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Pkp1P97350 Phc3-209ENSMUST00000168645 10976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Pkp1P97350 Ift80-208ENSMUST00000169064 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Pkp1P97350 Gm4759-201ENSMUST00000183414 6622 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Pkp1P97350 Gm25758-201ENSMUST00000103987 129 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Pkp1P97350 Gm25419-201ENSMUST00000104215 191 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Pkp1P97350 Gm9836-201ENSMUST00000117132 216 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Pkp1P97350 Gm12901-201ENSMUST00000118690 532 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Pkp1P97350 Gm14125-202ENSMUST00000120921 756 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Pkp1P97350 Gm14302-201ENSMUST00000122806 382 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Pkp1P97350 Gm12336-201ENSMUST00000125962 322 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Pkp1P97350 Gm12519-201ENSMUST00000134099 693 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Pkp1P97350 Gm11381-201ENSMUST00000138574 420 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Pkp1P97350 1700061J23Rik-201ENSMUST00000141678 537 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Pkp1P97350 Gm24944-201ENSMUST00000158330 128 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Pkp1P97350 Gm28467-201ENSMUST00000190981 318 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Pkp1P97350 Gm38180-201ENSMUST00000192381 395 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Pkp1P97350 Ighv1-27-201ENSMUST00000194473 340 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Pkp1P97350 Gm32051-201ENSMUST00000196818 709 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Pkp1P97350 Gm9173-201ENSMUST00000198054 400 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Pkp1P97350 Gm7721-201ENSMUST00000200446 546 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Pkp1P97350 Gm10610-203ENSMUST00000208877 1206 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Pkp1P97350 Gm44683-201ENSMUST00000209088 484 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Pkp1P97350 BC024386-203ENSMUST00000209817 825 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Pkp1P97350 Gm3800-201ENSMUST00000221086 554 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Pkp1P97350 CT030242.3-201ENSMUST00000221231 581 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Pkp1P97350 Gm42772-201ENSMUST00000199945 3041 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Pkp1P97350 AC115910.1-201ENSMUST00000221188 4275 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Pkp1P97350 Gm26764-201ENSMUST00000181175 2596 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Pkp1P97350 Olfr1238-203ENSMUST00000217237 5761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Pkp1P97350 Zfp780b-204ENSMUST00000206685 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Pkp1P97350 AC139218.1-201ENSMUST00000228215 4287 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Pkp1P97350 Gm12185-202ENSMUST00000094476 5264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Pkp1P97350 Nlrp5-203ENSMUST00000108441 3375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Pkp1P97350 Gm19552-201ENSMUST00000194744 2833 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Pkp1P97350 Vmn2r109-201ENSMUST00000167093 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Pkp1P97350 Btbd35f2-201ENSMUST00000179991 1949 ntAPPRIS P1 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Pkp1P97350 Olfr1420-203ENSMUST00000217281 2998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Pkp1P97350 Gm8267-203ENSMUST00000226900 1592 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Pkp1P97350 Gm24789-201ENSMUST00000104282 131 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Pkp1P97350 Gm14995-201ENSMUST00000117135 391 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Pkp1P97350 Gm15073-201ENSMUST00000117432 634 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Pkp1P97350 Gm12039-201ENSMUST00000118219 180 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Pkp1P97350 Gm6305-201ENSMUST00000121027 1012 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Pkp1P97350 n-R5s24-201ENSMUST00000122518 117 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Pkp1P97350 Gm24371-201ENSMUST00000122662 267 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Pkp1P97350 Plgrkt-201ENSMUST00000016639 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Pkp1P97350 Lsm5-203ENSMUST00000176595 274 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Pkp1P97350 Mir7674-201ENSMUST00000184964 63 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Pkp1P97350 Gm28863-201ENSMUST00000186888 431 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Pkp1P97350 Ly6a-203ENSMUST00000187171 853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Pkp1P97350 1700111N16Rik-201ENSMUST00000188663 1133 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Pkp1P97350 Mrgprb9-ps-201ENSMUST00000188739 892 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Pkp1P97350 1700031M16Rik-204ENSMUST00000189724 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Pkp1P97350 1700031M16Rik-207ENSMUST00000191513 847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Pkp1P97350 Gm9134-201ENSMUST00000193186 551 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Pkp1P97350 AL645522.1-201ENSMUST00000197692 104 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Pkp1P97350 Gm8999-201ENSMUST00000204951 969 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Pkp1P97350 Gm4587-201ENSMUST00000209135 637 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Pkp1P97350 Gm45579-201ENSMUST00000209367 887 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Pkp1P97350 AC137127.3-201ENSMUST00000213340 349 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Pkp1P97350 2310002D06Rik-201ENSMUST00000218103 508 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Pkp1P97350 Gm18409-202ENSMUST00000220105 529 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Pkp1P97350 3830406C13Rik-203ENSMUST00000223631 1014 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Pkp1P97350 AL671874.1-201ENSMUST00000223746 1123 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Pkp1P97350 AC154806.4-201ENSMUST00000227406 439 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Pkp1P97350 Pmis2-201ENSMUST00000051495 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Pkp1P97350 n-R5s170-201ENSMUST00000083726 113 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Pkp1P97350 Olfr726-208ENSMUST00000217422 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
Pkp1P97350 Mef2c-202ENSMUST00000163888 6277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
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