Protein–RNA interactions for Protein: P23336

Ggta1, N-acetyllactosaminide alpha-1,3-galactosyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ggta1P23336 Ugt2b5-201ENSMUST00000067790 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
Ggta1P23336 Olfr877-202ENSMUST00000213956 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Ggta1P23336 BC030870-201ENSMUST00000098713 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
Ggta1P23336 Ktn1-209ENSMUST00000187262 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
Ggta1P23336 Prune2-201ENSMUST00000087689 12512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
Ggta1P23336 Gm38067-201ENSMUST00000192346 1911 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Ggta1P23336 AI987944-201ENSMUST00000071804 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
Ggta1P23336 Gm6288-201ENSMUST00000100778 1590 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
Ggta1P23336 Zfp37-207ENSMUST00000222748 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
Ggta1P23336 Vmn2r112-201ENSMUST00000097381 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
Ggta1P23336 Vmn1r81-204ENSMUST00000228482 13495 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
Ggta1P23336 Gm24429-201ENSMUST00000104076 132 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Ggta1P23336 Cetn2-202ENSMUST00000114550 1124 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
Ggta1P23336 Gm7206-201ENSMUST00000117730 508 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Ggta1P23336 Gm11804-201ENSMUST00000121663 468 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Ggta1P23336 1700061J23Rik-201ENSMUST00000141678 537 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
Ggta1P23336 Gm14742-201ENSMUST00000148284 381 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
Ggta1P23336 Gm13839-201ENSMUST00000151639 506 ntTSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
Ggta1P23336 Tmem132cos-202ENSMUST00000154361 699 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
Ggta1P23336 Gm15810-201ENSMUST00000160241 681 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
Ggta1P23336 Gm15657-203ENSMUST00000163077 779 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
Ggta1P23336 Vmn1r-ps66-201ENSMUST00000173436 612 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Ggta1P23336 Gm4141-201ENSMUST00000174364 921 ntAPPRIS P1 BASIC4.91□□□□□ -1.62
Ggta1P23336 Gm4201-201ENSMUST00000174775 921 ntAPPRIS P1 BASIC4.91□□□□□ -1.62
Ggta1P23336 G530012D18Rik-201ENSMUST00000178024 420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
Ggta1P23336 Gm27234-201ENSMUST00000183362 581 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
Ggta1P23336 Mir7020-201ENSMUST00000183787 70 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Ggta1P23336 1810064F22Rik-202ENSMUST00000187399 630 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
Ggta1P23336 Trav7d-5-201ENSMUST00000197128 340 ntAPPRIS P1 BASIC4.91□□□□□ -1.62
Ggta1P23336 Igkv3-8-201ENSMUST00000197635 339 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Ggta1P23336 Gm43464-201ENSMUST00000198003 317 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
Ggta1P23336 Trav7n-5-201ENSMUST00000199753 340 ntAPPRIS P1 BASIC4.91□□□□□ -1.62
Ggta1P23336 Gm44623-201ENSMUST00000207934 434 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Ggta1P23336 AC192088.3-201ENSMUST00000227858 831 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Ggta1P23336 Rps4x-201ENSMUST00000033683 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
Ggta1P23336 Cetn2-201ENSMUST00000033713 1026 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
Ggta1P23336 BC049715-201ENSMUST00000052702 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
Ggta1P23336 Rnase9-201ENSMUST00000064214 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
Ggta1P23336 Mbd3l1-201ENSMUST00000069218 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
Ggta1P23336 Mir188-201ENSMUST00000083464 68 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Ggta1P23336 Rpl29-ps2-201ENSMUST00000086508 478 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Ggta1P23336 Gm5941-201ENSMUST00000096371 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
Ggta1P23336 Olfr599-201ENSMUST00000098201 1050 ntAPPRIS P1 BASIC4.91□□□□□ -1.62
Ggta1P23336 Olfr1275-201ENSMUST00000099620 1020 ntAPPRIS P1 BASIC4.91□□□□□ -1.62
Ggta1P23336 Olfr1097-202ENSMUST00000217403 4430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
Ggta1P23336 Gm7298-201ENSMUST00000204124 4657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
Ggta1P23336 9630010A21Rik-201ENSMUST00000192348 2703 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Ggta1P23336 Ctsm-202ENSMUST00000223778 1905 ntAPPRIS P1 BASIC4.91□□□□□ -1.62
Ggta1P23336 Vmn1r71-204ENSMUST00000227702 5034 ntAPPRIS P2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
Ggta1P23336 Olfr1191-ps1-202ENSMUST00000217379 5933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
Ggta1P23336 Pate2-202ENSMUST00000118254 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
Ggta1P23336 Olfr273-202ENSMUST00000107670 4796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
Ggta1P23336 Fam122b-202ENSMUST00000114838 3536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
Ggta1P23336 2700089I24Rik-201ENSMUST00000190204 1827 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
Ggta1P23336 Piga-201ENSMUST00000033754 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
Ggta1P23336 Olfr984-202ENSMUST00000213858 5186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.62
Ggta1P23336 Gm43696-201ENSMUST00000199385 6071 ntBASIC4.9□□□□□ -1.62
Ggta1P23336 Trps1-202ENSMUST00000165201 9859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
Ggta1P23336 Prrc2c-210ENSMUST00000182660 11502 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.62
Ggta1P23336 Gm16041-201ENSMUST00000144339 3725 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
Ggta1P23336 Gm26535-201ENSMUST00000181602 2600 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
Ggta1P23336 Olfr947-ps1-201ENSMUST00000214075 2165 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.62
Ggta1P23336 Vmn1r27-203ENSMUST00000228530 3115 ntAPPRIS P2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Ggta1P23336 Gm26300-201ENSMUST00000102282 94 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Ggta1P23336 Ssxb2-202ENSMUST00000103000 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
Ggta1P23336 Hspe1-ps5-201ENSMUST00000118080 297 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Ggta1P23336 Gm15971-201ENSMUST00000119372 211 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Ggta1P23336 Gm17014-201ENSMUST00000120765 168 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Ggta1P23336 Gm22106-201ENSMUST00000122544 127 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Ggta1P23336 n-R5s98-201ENSMUST00000122549 119 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Ggta1P23336 Gm25176-201ENSMUST00000122640 125 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Ggta1P23336 3110004A20Rik-201ENSMUST00000123904 385 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
Ggta1P23336 Amy2a1-201ENSMUST00000132353 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Ggta1P23336 Gm14582-201ENSMUST00000141697 1189 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
Ggta1P23336 Gm15275-201ENSMUST00000154752 347 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Ggta1P23336 Gm22895-201ENSMUST00000157508 308 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Ggta1P23336 Gm26350-201ENSMUST00000157531 288 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Ggta1P23336 Gm10319-202ENSMUST00000159439 846 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Ggta1P23336 Gm8669-201ENSMUST00000183839 945 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Ggta1P23336 Gm27781-201ENSMUST00000185185 92 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Ggta1P23336 Gm37421-201ENSMUST00000193088 132 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Ggta1P23336 Gm38360-201ENSMUST00000195130 454 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Ggta1P23336 Gm18036-201ENSMUST00000195256 272 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Ggta1P23336 Gm42437-201ENSMUST00000197263 923 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Ggta1P23336 Gm9173-201ENSMUST00000198054 400 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Ggta1P23336 Gm42452-201ENSMUST00000199749 617 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Ggta1P23336 4930443G03Rik-201ENSMUST00000203475 1282 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Ggta1P23336 Gm18215-201ENSMUST00000204429 798 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Ggta1P23336 Gm45908-201ENSMUST00000212977 1177 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Ggta1P23336 Gm18904-201ENSMUST00000218756 329 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Ggta1P23336 AC137117.1-201ENSMUST00000226912 441 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Ggta1P23336 AC131997.2-201ENSMUST00000227452 362 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Ggta1P23336 A630091E08Rik-201ENSMUST00000069035 828 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
Ggta1P23336 Gm4963-201ENSMUST00000072718 378 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Ggta1P23336 Ube2d4-201ENSMUST00000075109 406 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Ggta1P23336 Olfr1503-ps1-201ENSMUST00000076614 803 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Ggta1P23336 Klk1b7-ps-201ENSMUST00000078897 448 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
Ggta1P23336 Olfr1054-201ENSMUST00000099895 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Ggta1P23336 Fam107b-209ENSMUST00000226435 3602 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Ggta1P23336 Pls3-202ENSMUST00000114057 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61 ms