Protein–RNA interactions for Protein: O35599

Opn1mw, Medium-wave-sensitive opsin 1, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn1mwO35599 Zfp644-201ENSMUST00000045466 5569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Opn1mwO35599 Gm43216-201ENSMUST00000196295 1333 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Opn1mwO35599 Olfr726-205ENSMUST00000215278 1324 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Opn1mwO35599 Csnka2ip-201ENSMUST00000089279 1336 ntAPPRIS P2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Opn1mwO35599 Slamf6-207ENSMUST00000195656 5729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Opn1mwO35599 Olfr129-202ENSMUST00000216476 5275 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.53
Opn1mwO35599 Rsf1os2-202ENSMUST00000147690 3091 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.53
Opn1mwO35599 Samd12-201ENSMUST00000078673 9019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.53
Opn1mwO35599 Gm45762-201ENSMUST00000212863 2619 ntBASIC5.46□□□□□ -1.53
Opn1mwO35599 Ptprd-218ENSMUST00000174180 5694 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.53
Opn1mwO35599 Gm21778-202ENSMUST00000185926 1482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.53
Opn1mwO35599 Gm42598-201ENSMUST00000200110 2437 ntBASIC5.46□□□□□ -1.53
Opn1mwO35599 Lama2-207ENSMUST00000189575 4244 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Opn1mwO35599 9630002D21Rik-202ENSMUST00000222033 2345 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
Opn1mwO35599 Gm45548-201ENSMUST00000210076 3167 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Opn1mwO35599 Naip2-203ENSMUST00000167986 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Opn1mwO35599 Iqub-201ENSMUST00000052277 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
Opn1mwO35599 Serpinb7-201ENSMUST00000086690 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
Opn1mwO35599 Tcrg-V3-201ENSMUST00000103559 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Opn1mwO35599 Gm23274-201ENSMUST00000104056 130 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Opn1mwO35599 Tmco2-201ENSMUST00000106268 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
Opn1mwO35599 Gm13435-201ENSMUST00000120111 1023 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Opn1mwO35599 Gm15061-201ENSMUST00000121076 1046 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Opn1mwO35599 Gm25291-201ENSMUST00000122795 144 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Opn1mwO35599 Nr6a1os-202ENSMUST00000151229 525 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
Opn1mwO35599 Gm23513-201ENSMUST00000158181 133 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Opn1mwO35599 Vmn1r-ps25-201ENSMUST00000173545 799 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Opn1mwO35599 Mir3473c-201ENSMUST00000175262 81 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Opn1mwO35599 Esp38-201ENSMUST00000178880 243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Opn1mwO35599 Gm4832-201ENSMUST00000182679 399 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Opn1mwO35599 4930590L20Rik-201ENSMUST00000193820 553 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
Opn1mwO35599 Gm31026-201ENSMUST00000198762 821 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
Opn1mwO35599 4930519L02Rik-202ENSMUST00000200254 452 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Opn1mwO35599 C78283-201ENSMUST00000202711 848 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
Opn1mwO35599 Gm45524-201ENSMUST00000211374 1250 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
Opn1mwO35599 Gm45731-201ENSMUST00000211988 1203 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Opn1mwO35599 AC161250.1-201ENSMUST00000213426 1111 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Opn1mwO35599 Gm46102-201ENSMUST00000217005 731 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Opn1mwO35599 AC153532.1-201ENSMUST00000218126 1111 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Opn1mwO35599 Gnrh1-203ENSMUST00000223951 411 ntAPPRIS P1 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Opn1mwO35599 Cst12-201ENSMUST00000028932 644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
Opn1mwO35599 Spink14-201ENSMUST00000060328 566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Opn1mwO35599 Olfr870-201ENSMUST00000086476 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Opn1mwO35599 Smim4-203ENSMUST00000090205 426 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Opn1mwO35599 Gm12784-202ENSMUST00000206001 3739 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
Opn1mwO35599 4930555F03Rik-202ENSMUST00000126285 3604 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
Opn1mwO35599 Epha4-204ENSMUST00000188797 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
Opn1mwO35599 Akap11-201ENSMUST00000022593 5688 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Opn1mwO35599 9230019H11Rik-201ENSMUST00000095874 2801 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
Opn1mwO35599 Zbbx-203ENSMUST00000107776 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Opn1mwO35599 Fam35a-206ENSMUST00000228626 3100 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Opn1mwO35599 Pola1-201ENSMUST00000006856 5346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Opn1mwO35599 Rnf24-201ENSMUST00000059372 5978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Opn1mwO35599 Gm43027-201ENSMUST00000202906 3691 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Opn1mwO35599 Olfr231-202ENSMUST00000214446 5204 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Opn1mwO35599 Tlr1-201ENSMUST00000059349 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Opn1mwO35599 Gm28320-201ENSMUST00000187777 2273 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Opn1mwO35599 Ccl28-201ENSMUST00000099241 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Opn1mwO35599 Bche-201ENSMUST00000029367 6210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Opn1mwO35599 AU023762-203ENSMUST00000209897 2179 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Opn1mwO35599 Gm7903-202ENSMUST00000179953 3519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Opn1mwO35599 Kcnma1-208ENSMUST00000177634 4605 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Opn1mwO35599 Ighv9-4-201ENSMUST00000103482 294 ntAPPRIS P1 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Opn1mwO35599 Trav14d-3-dv8-201ENSMUST00000103608 456 ntAPPRIS P1 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Opn1mwO35599 Gm24578-201ENSMUST00000103970 129 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Opn1mwO35599 Gm21637-201ENSMUST00000105124 778 ntAPPRIS P1 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Opn1mwO35599 Mir1945-201ENSMUST00000157919 78 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Opn1mwO35599 Airn-203ENSMUST00000159791 485 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Opn1mwO35599 Gm8256-201ENSMUST00000169178 453 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Opn1mwO35599 Crxos-205ENSMUST00000171280 571 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Opn1mwO35599 G530012D18Rik-201ENSMUST00000178024 420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Opn1mwO35599 6330403N20Rik-201ENSMUST00000180467 1189 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Opn1mwO35599 Gm28782-201ENSMUST00000185980 414 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Opn1mwO35599 Gm18553-201ENSMUST00000194152 634 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Opn1mwO35599 Gm37126-201ENSMUST00000195289 883 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Opn1mwO35599 Gm18660-201ENSMUST00000199542 629 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Opn1mwO35599 Gm43342-201ENSMUST00000201027 924 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Opn1mwO35599 A730082K24Rik-201ENSMUST00000205365 465 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Opn1mwO35599 Olfr1488-ps1-201ENSMUST00000207436 136 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Opn1mwO35599 Gm45721-201ENSMUST00000212267 607 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Opn1mwO35599 Supt4b-201ENSMUST00000214434 351 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Opn1mwO35599 AC154264.1-201ENSMUST00000216064 386 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Opn1mwO35599 Gm36372-201ENSMUST00000221011 778 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Opn1mwO35599 AC156576.2-202ENSMUST00000222525 411 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Opn1mwO35599 Olfr430-201ENSMUST00000055873 954 ntAPPRIS P1 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Opn1mwO35599 Olfr974-201ENSMUST00000062833 1080 ntAPPRIS P1 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Opn1mwO35599 Olfr591-201ENSMUST00000074272 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Opn1mwO35599 Gm25139-201ENSMUST00000083247 210 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Opn1mwO35599 Abcc9-204ENSMUST00000111771 7499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Opn1mwO35599 Zfp9-201ENSMUST00000161170 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Opn1mwO35599 Vmn2r39-201ENSMUST00000174388 3577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Opn1mwO35599 Gm3259-202ENSMUST00000160045 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Opn1mwO35599 Sytl2-202ENSMUST00000107210 3718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Opn1mwO35599 AC158232.1-202ENSMUST00000218352 3343 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Opn1mwO35599 Slc9a9-201ENSMUST00000033463 3468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Opn1mwO35599 Brinp3-201ENSMUST00000074622 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Opn1mwO35599 Lrrc9-206ENSMUST00000162159 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Opn1mwO35599 Gm13928-201ENSMUST00000120326 1732 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Opn1mwO35599 Olfr813-202ENSMUST00000204622 2410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Opn1mwO35599 Gm38062-201ENSMUST00000192541 1856 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72 ms