Protein–RNA interactions for Protein: Q8BL06

Usp54, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 54, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp54Q8BL06 Gm16456-201ENSMUST00000174431 920 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Usp54Q8BL06 Rab26os-201ENSMUST00000176215 477 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Usp54Q8BL06 Gm19617-201ENSMUST00000202977 308 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Usp54Q8BL06 Gm44738-201ENSMUST00000206393 371 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Usp54Q8BL06 Gm45052-201ENSMUST00000206457 405 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Usp54Q8BL06 AC157515.1-201ENSMUST00000220953 450 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Usp54Q8BL06 AC154627.3-201ENSMUST00000228441 334 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Usp54Q8BL06 Anxa10-202ENSMUST00000034054 1222 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Usp54Q8BL06 Defb35-201ENSMUST00000076786 267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Usp54Q8BL06 Olfr1214-203ENSMUST00000217469 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Usp54Q8BL06 Frmpd4-202ENSMUST00000112146 8153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Usp54Q8BL06 Gm38368-201ENSMUST00000193181 1335 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Usp54Q8BL06 Gm3604-202ENSMUST00000187656 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Usp54Q8BL06 Olfr1062-203ENSMUST00000217481 3726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Usp54Q8BL06 Shoc2-202ENSMUST00000169861 4065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Usp54Q8BL06 Gm44144-201ENSMUST00000203683 1960 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Usp54Q8BL06 Sox6-204ENSMUST00000166877 8079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Usp54Q8BL06 Arpp19-203ENSMUST00000166549 1747 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Usp54Q8BL06 4930533I22Rik-201ENSMUST00000176290 2564 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Usp54Q8BL06 Olfr845-203ENSMUST00000215572 3446 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Usp54Q8BL06 Gm3896-201ENSMUST00000176020 4094 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Usp54Q8BL06 Taf1-201ENSMUST00000101341 8054 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Usp54Q8BL06 Igkv11-106-201ENSMUST00000103331 346 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Usp54Q8BL06 Gm14985-201ENSMUST00000118693 786 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Usp54Q8BL06 Gm26085-201ENSMUST00000157900 116 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Usp54Q8BL06 Hsd11b1-203ENSMUST00000160929 1256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Usp54Q8BL06 Gm3159-201ENSMUST00000164038 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Usp54Q8BL06 Mir6899-201ENSMUST00000184798 64 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Usp54Q8BL06 A930005H10Rik-205ENSMUST00000187055 436 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Usp54Q8BL06 AC137127.3-201ENSMUST00000213340 349 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Usp54Q8BL06 Tmem209-211ENSMUST00000222934 1212 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Usp54Q8BL06 AC138765.1-201ENSMUST00000228657 385 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Usp54Q8BL06 Smc5-206ENSMUST00000226111 3265 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Usp54Q8BL06 A630031M04Rik-201ENSMUST00000146587 3568 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Usp54Q8BL06 Tyr-201ENSMUST00000004770 6042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Usp54Q8BL06 Vsig4-201ENSMUST00000050707 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Usp54Q8BL06 Gm43921-201ENSMUST00000204296 1792 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Usp54Q8BL06 Fbxw25-201ENSMUST00000163839 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Usp54Q8BL06 Gtf3c3-201ENSMUST00000041638 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Usp54Q8BL06 Gm45470-201ENSMUST00000209685 7044 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Usp54Q8BL06 Trbv26-201ENSMUST00000103280 344 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Usp54Q8BL06 Gm14221-201ENSMUST00000109473 340 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Usp54Q8BL06 Gm15245-201ENSMUST00000129410 1186 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Usp54Q8BL06 Gm27568-201ENSMUST00000184220 99 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Usp54Q8BL06 Gm28957-201ENSMUST00000190174 373 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Usp54Q8BL06 Rps27a-ps1-201ENSMUST00000191424 463 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Usp54Q8BL06 Gm37223-202ENSMUST00000193592 490 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Usp54Q8BL06 Gm37670-201ENSMUST00000193622 229 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Usp54Q8BL06 Gm33050-201ENSMUST00000198132 501 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Usp54Q8BL06 Gm42640-201ENSMUST00000199792 1195 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Usp54Q8BL06 Gm42761-201ENSMUST00000201899 738 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Usp54Q8BL06 Gm8719-201ENSMUST00000203602 534 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Usp54Q8BL06 Ctsj-201ENSMUST00000071526 1271 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Usp54Q8BL06 Olfr881-201ENSMUST00000074611 948 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Usp54Q8BL06 Gm24031-201ENSMUST00000083930 131 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Usp54Q8BL06 Kat6a-202ENSMUST00000110696 9041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Usp54Q8BL06 A630009H07Rik-201ENSMUST00000208485 2159 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Usp54Q8BL06 Nsd2-205ENSMUST00000114399 7786 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Usp54Q8BL06 Gm44739-201ENSMUST00000205294 1426 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Usp54Q8BL06 Pcdh15-205ENSMUST00000105429 6719 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Usp54Q8BL06 Gm30524-201ENSMUST00000204271 2300 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Usp54Q8BL06 Slmap-201ENSMUST00000038522 4501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Usp54Q8BL06 Kcnj16-205ENSMUST00000178798 3678 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Usp54Q8BL06 Emsy-202ENSMUST00000205276 7693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Usp54Q8BL06 Pcdh15-202ENSMUST00000092420 6917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Usp54Q8BL06 Dnah11-201ENSMUST00000084806 14072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Usp54Q8BL06 Arhgap32-201ENSMUST00000168954 8703 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Usp54Q8BL06 Tank-205ENSMUST00000112502 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Usp54Q8BL06 Bclaf1-202ENSMUST00000092678 5307 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Usp54Q8BL06 Zpld1-201ENSMUST00000036412 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Usp54Q8BL06 Vmn2r112-201ENSMUST00000097381 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Usp54Q8BL06 Olfr571-202ENSMUST00000214160 4999 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Usp54Q8BL06 Tnfsf10-201ENSMUST00000046383 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Usp54Q8BL06 Gm37137-201ENSMUST00000195138 2684 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Usp54Q8BL06 Nlrp1a-202ENSMUST00000108518 3767 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Usp54Q8BL06 G930045G22Rik-201ENSMUST00000101402 480 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Usp54Q8BL06 Gm23594-201ENSMUST00000104307 134 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Usp54Q8BL06 Gm23171-201ENSMUST00000157159 264 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Usp54Q8BL06 Gm7271-201ENSMUST00000172369 519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Usp54Q8BL06 Gm5558-201ENSMUST00000178933 495 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Usp54Q8BL06 Gm27611-201ENSMUST00000184690 108 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Usp54Q8BL06 Gm9685-201ENSMUST00000211275 538 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Usp54Q8BL06 Olfr858-ps1-201ENSMUST00000212591 930 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Usp54Q8BL06 AC164087.1-201ENSMUST00000215174 733 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Usp54Q8BL06 Ugt2b5-201ENSMUST00000067790 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Usp54Q8BL06 Clcn3-202ENSMUST00000056508 5684 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Usp54Q8BL06 Olfr684-203ENSMUST00000215744 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Usp54Q8BL06 Tlr6-201ENSMUST00000062315 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Usp54Q8BL06 Gm21244-202ENSMUST00000189201 3115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Usp54Q8BL06 Olfr1389-202ENSMUST00000216641 3707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Usp54Q8BL06 Mmp1a-202ENSMUST00000217651 2011 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Usp54Q8BL06 Mmp1a-201ENSMUST00000034492 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Usp54Q8BL06 Zbed6-201ENSMUST00000190574 5007 ntAPPRIS P1 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Usp54Q8BL06 Gm43771-201ENSMUST00000202931 1578 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Usp54Q8BL06 Gm37769-201ENSMUST00000193753 2369 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Usp54Q8BL06 Pof1b-201ENSMUST00000039887 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Usp54Q8BL06 Gm43363-201ENSMUST00000201590 2647 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Usp54Q8BL06 Arhgap15-201ENSMUST00000055776 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Usp54Q8BL06 Ptprj-202ENSMUST00000111495 4197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Usp54Q8BL06 Rapgef6-204ENSMUST00000108894 3475 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.8 ms