Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDK1

Trafd1, TRAF-type zinc finger domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trafd1Q3UDK1 1700108F19Rik-201ENSMUST00000185213 621 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Trafd1Q3UDK1 4930520M14Rik-201ENSMUST00000196947 701 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Trafd1Q3UDK1 Gm29755-201ENSMUST00000196976 948 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Trafd1Q3UDK1 Igkv4-56-201ENSMUST00000198436 349 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Trafd1Q3UDK1 Gm6261-201ENSMUST00000204707 760 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Trafd1Q3UDK1 Gm44683-201ENSMUST00000209088 484 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Trafd1Q3UDK1 Dlg2-216ENSMUST00000209170 1057 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Trafd1Q3UDK1 Gm45908-201ENSMUST00000212977 1177 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Trafd1Q3UDK1 AC165245.1-201ENSMUST00000214181 636 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Trafd1Q3UDK1 AC153937.2-201ENSMUST00000218485 632 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Trafd1Q3UDK1 AC127337.1-201ENSMUST00000220423 625 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Trafd1Q3UDK1 Olfr705-201ENSMUST00000060879 951 ntAPPRIS P1 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Trafd1Q3UDK1 Gm10064-201ENSMUST00000071235 399 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Trafd1Q3UDK1 Olfr1276-201ENSMUST00000073322 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Trafd1Q3UDK1 Magea1-201ENSMUST00000078193 1108 ntAPPRIS P1 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Trafd1Q3UDK1 Mageb16-202ENSMUST00000114016 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Trafd1Q3UDK1 Zfp758-203ENSMUST00000121315 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Trafd1Q3UDK1 Pcdh9-207ENSMUST00000195376 5096 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Trafd1Q3UDK1 Olfr1057-202ENSMUST00000217435 3249 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Trafd1Q3UDK1 Nlrp1b-202ENSMUST00000108514 3541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Trafd1Q3UDK1 Ubtfl1-203ENSMUST00000169398 4430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Trafd1Q3UDK1 Clk4-203ENSMUST00000109113 1627 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Trafd1Q3UDK1 Gm37703-201ENSMUST00000192292 1784 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Trafd1Q3UDK1 Gpr65-201ENSMUST00000075072 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Trafd1Q3UDK1 Zfp605-201ENSMUST00000086686 2085 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Trafd1Q3UDK1 Gm17021-202ENSMUST00000214413 2371 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Trafd1Q3UDK1 A730009L09Rik-201ENSMUST00000209558 2512 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Trafd1Q3UDK1 Acsl4-204ENSMUST00000112907 5137 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
Trafd1Q3UDK1 Serpinb5-201ENSMUST00000086701 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
Trafd1Q3UDK1 Ccr2-204ENSMUST00000171719 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
Trafd1Q3UDK1 Gm37767-201ENSMUST00000193239 1834 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Trafd1Q3UDK1 Olfr586-203ENSMUST00000213281 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
Trafd1Q3UDK1 9830107B12Rik-201ENSMUST00000063481 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
Trafd1Q3UDK1 Olfr1271-202ENSMUST00000216383 6613 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
Trafd1Q3UDK1 Pfkfb2-202ENSMUST00000066863 4425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
Trafd1Q3UDK1 Cep112os1-201ENSMUST00000137907 3005 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
Trafd1Q3UDK1 Dcun1d1-212ENSMUST00000198389 3020 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
Trafd1Q3UDK1 Gm8595-201ENSMUST00000118250 630 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Trafd1Q3UDK1 Gm15490-201ENSMUST00000119894 387 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Trafd1Q3UDK1 Gm13367-201ENSMUST00000119955 796 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Trafd1Q3UDK1 Gm6620-201ENSMUST00000120113 715 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Trafd1Q3UDK1 Gm15152-201ENSMUST00000121540 394 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Trafd1Q3UDK1 Gm7973-201ENSMUST00000122107 488 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Trafd1Q3UDK1 Gm24940-201ENSMUST00000158326 108 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Trafd1Q3UDK1 Gm3594-201ENSMUST00000169152 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
Trafd1Q3UDK1 Gm8321-201ENSMUST00000181691 980 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Trafd1Q3UDK1 Gm28186-201ENSMUST00000187447 679 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Trafd1Q3UDK1 Gm18011-201ENSMUST00000203717 565 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Trafd1Q3UDK1 Gm5418-201ENSMUST00000206932 528 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Trafd1Q3UDK1 Gm4587-201ENSMUST00000209135 637 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Trafd1Q3UDK1 Olfr1134-203ENSMUST00000213939 1015 ntAPPRIS P1 BASIC5.18□□□□□ -1.58
Trafd1Q3UDK1 Gm40392-201ENSMUST00000220656 562 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
Trafd1Q3UDK1 5033424D13Rik-201ENSMUST00000221779 648 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Trafd1Q3UDK1 Gm6474-201ENSMUST00000223250 699 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Trafd1Q3UDK1 AC154806.4-201ENSMUST00000227406 439 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Trafd1Q3UDK1 AC121978.1-201ENSMUST00000228357 380 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Trafd1Q3UDK1 AC154283.1-201ENSMUST00000228417 389 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Trafd1Q3UDK1 Trappc1-201ENSMUST00000060956 628 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
Trafd1Q3UDK1 Klk1b7-ps-201ENSMUST00000078897 448 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
Trafd1Q3UDK1 Gm45415-201ENSMUST00000209644 2074 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Trafd1Q3UDK1 Gm18852-201ENSMUST00000184149 3593 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Trafd1Q3UDK1 AC159326.1-201ENSMUST00000219989 1302 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Trafd1Q3UDK1 5430403G16Rik-201ENSMUST00000092720 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
Trafd1Q3UDK1 Gm45222-201ENSMUST00000207029 4307 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Trafd1Q3UDK1 Olfr671-202ENSMUST00000210963 3157 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
Trafd1Q3UDK1 Olfr447-202ENSMUST00000216408 3185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
Trafd1Q3UDK1 Gm37504-201ENSMUST00000192537 2374 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Trafd1Q3UDK1 Slc5a3-201ENSMUST00000113975 10913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
Trafd1Q3UDK1 Olfr690-203ENSMUST00000216230 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
Trafd1Q3UDK1 Adam28-201ENSMUST00000022642 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
Trafd1Q3UDK1 Sdr16c6-202ENSMUST00000108383 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
Trafd1Q3UDK1 Vmn2r42-204ENSMUST00000142934 3694 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
Trafd1Q3UDK1 Olfr716-206ENSMUST00000215284 3515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
Trafd1Q3UDK1 Enpp3-201ENSMUST00000020169 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
Trafd1Q3UDK1 Gm42661-201ENSMUST00000202364 1442 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Trafd1Q3UDK1 Gm42561-201ENSMUST00000202563 1442 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Trafd1Q3UDK1 Olfr1311-203ENSMUST00000215321 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
Trafd1Q3UDK1 Olfr1330-202ENSMUST00000105035 1027 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
Trafd1Q3UDK1 Gm13579-201ENSMUST00000118519 517 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Trafd1Q3UDK1 Gm11742-201ENSMUST00000119903 233 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Trafd1Q3UDK1 Gm13484-201ENSMUST00000120738 412 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Trafd1Q3UDK1 Gm22885-201ENSMUST00000157410 107 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Trafd1Q3UDK1 Mir5112-201ENSMUST00000174897 60 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Trafd1Q3UDK1 Mir3090-201ENSMUST00000175597 87 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Trafd1Q3UDK1 Vmn1r-ps11-201ENSMUST00000176097 853 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Trafd1Q3UDK1 Lockd-204ENSMUST00000184991 243 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
Trafd1Q3UDK1 Gm18558-201ENSMUST00000186253 1214 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Trafd1Q3UDK1 Gm29284-201ENSMUST00000188363 255 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Trafd1Q3UDK1 Gm28061-201ENSMUST00000189085 807 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Trafd1Q3UDK1 Gm37973-201ENSMUST00000195767 1289 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Trafd1Q3UDK1 Gm43554-201ENSMUST00000199987 186 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Trafd1Q3UDK1 1700065J11Rik-201ENSMUST00000201560 424 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
Trafd1Q3UDK1 Pln-204ENSMUST00000219491 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
Trafd1Q3UDK1 AC164295.2-201ENSMUST00000228539 757 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Trafd1Q3UDK1 Fhl5-201ENSMUST00000029922 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
Trafd1Q3UDK1 Gm25818-201ENSMUST00000083282 164 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Trafd1Q3UDK1 Gm156-201ENSMUST00000095409 682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
Trafd1Q3UDK1 Olfr1024-201ENSMUST00000099912 984 ntAPPRIS P1 BASIC5.17□□□□□ -1.58
Trafd1Q3UDK1 Cenpj-201ENSMUST00000065302 4363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
Trafd1Q3UDK1 Agps-203ENSMUST00000175646 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 117.1 ms