Protein–RNA interactions for Protein: Q1RLL3

Cpne9, Copine-9, mousemouse

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne9Q1RLL3 Cntn4-201ENSMUST00000079416 2844 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Cpne9Q1RLL3 Zfhx4-205ENSMUST00000176383 13500 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Cpne9Q1RLL3 Cyp2c40-201ENSMUST00000160476 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Cpne9Q1RLL3 Gm3127-202ENSMUST00000171866 1758 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Cpne9Q1RLL3 Epha7-203ENSMUST00000108191 6615 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Cpne9Q1RLL3 Serpinb6c-202ENSMUST00000172184 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Cpne9Q1RLL3 Olfr874-202ENSMUST00000216982 2632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Cpne9Q1RLL3 Traj16-201ENSMUST00000103725 61 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Cpne9Q1RLL3 Gm24429-201ENSMUST00000104076 132 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Cpne9Q1RLL3 Gm11486-201ENSMUST00000107322 478 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Cpne9Q1RLL3 Gm14086-201ENSMUST00000117152 173 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Cpne9Q1RLL3 Gm15185-201ENSMUST00000117397 746 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Cpne9Q1RLL3 Psmb6-ps-201ENSMUST00000117520 713 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Cpne9Q1RLL3 Gm7206-201ENSMUST00000117730 508 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Cpne9Q1RLL3 Gm15981-201ENSMUST00000119196 457 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Cpne9Q1RLL3 Gm12925-203ENSMUST00000140510 665 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Cpne9Q1RLL3 Gm12753-201ENSMUST00000152086 653 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Cpne9Q1RLL3 Gm5699-201ENSMUST00000152491 723 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Cpne9Q1RLL3 Gm6542-201ENSMUST00000153606 772 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Cpne9Q1RLL3 4933417A18Rik-201ENSMUST00000160279 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Cpne9Q1RLL3 B230216N24Rik-204ENSMUST00000161661 719 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Cpne9Q1RLL3 Znrf1-215ENSMUST00000174454 494 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Cpne9Q1RLL3 Gm4832-202ENSMUST00000183295 375 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Cpne9Q1RLL3 Gm27688-201ENSMUST00000183634 91 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Cpne9Q1RLL3 Gm37421-201ENSMUST00000193088 132 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Cpne9Q1RLL3 Gm33952-201ENSMUST00000197795 408 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Cpne9Q1RLL3 Gm43215-201ENSMUST00000199108 252 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Cpne9Q1RLL3 A230098N10Rik-202ENSMUST00000200055 356 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Cpne9Q1RLL3 Tprkb-208ENSMUST00000200680 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Cpne9Q1RLL3 Gm18482-201ENSMUST00000202405 760 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Cpne9Q1RLL3 Gm2926-201ENSMUST00000205625 239 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Cpne9Q1RLL3 Abca15-204ENSMUST00000207220 567 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Cpne9Q1RLL3 E230029C05Rik-206ENSMUST00000208547 814 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Cpne9Q1RLL3 Gm45343-201ENSMUST00000210452 828 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Cpne9Q1RLL3 6430710M23Rik-201ENSMUST00000210843 1191 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Cpne9Q1RLL3 Gm45422-201ENSMUST00000211476 246 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Cpne9Q1RLL3 4933411E02Rik-201ENSMUST00000216779 1030 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Cpne9Q1RLL3 AC164576.1-201ENSMUST00000218783 693 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Cpne9Q1RLL3 AC142227.2-201ENSMUST00000220675 400 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Cpne9Q1RLL3 AC165953.1-201ENSMUST00000226386 357 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Cpne9Q1RLL3 AC107757.1-201ENSMUST00000226780 357 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Cpne9Q1RLL3 AC166574.7-201ENSMUST00000228502 704 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Cpne9Q1RLL3 Prelid2-201ENSMUST00000070949 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Cpne9Q1RLL3 Olfr739-201ENSMUST00000075261 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Cpne9Q1RLL3 Boll-201ENSMUST00000087585 882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Cpne9Q1RLL3 Mrgprb3-201ENSMUST00000094383 1009 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Cpne9Q1RLL3 Olfr599-201ENSMUST00000098201 1050 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Cpne9Q1RLL3 Adgrg2-203ENSMUST00000112401 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Cpne9Q1RLL3 Adgrg2-204ENSMUST00000112402 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Cpne9Q1RLL3 Adgrg2-205ENSMUST00000112404 4601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Cpne9Q1RLL3 Adgrg2-206ENSMUST00000112405 4634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Cpne9Q1RLL3 Malrd1-201ENSMUST00000146205 6738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Cpne9Q1RLL3 Clk4-203ENSMUST00000109113 1627 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Cpne9Q1RLL3 2900018N21Rik-201ENSMUST00000195805 1580 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Cpne9Q1RLL3 Btf3l4-204ENSMUST00000102742 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Cpne9Q1RLL3 Ccdc66-202ENSMUST00000223689 4262 ntAPPRIS P2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Cpne9Q1RLL3 Il6-203ENSMUST00000199183 2343 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Cpne9Q1RLL3 Olfr1348-207ENSMUST00000209029 2696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Cpne9Q1RLL3 Zscan4a-201ENSMUST00000210573 2279 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Cpne9Q1RLL3 Gm28687-201ENSMUST00000187203 1494 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Cpne9Q1RLL3 Gm29373-201ENSMUST00000190660 1494 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Cpne9Q1RLL3 Zfp780b-204ENSMUST00000206685 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Cpne9Q1RLL3 Gm17021-202ENSMUST00000214413 2371 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Cpne9Q1RLL3 Npat-201ENSMUST00000035850 6062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Cpne9Q1RLL3 Serpinb9g-201ENSMUST00000081927 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Cpne9Q1RLL3 Trav12n-1-201ENSMUST00000103587 344 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Cpne9Q1RLL3 Gm24230-201ENSMUST00000104313 129 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Cpne9Q1RLL3 Gm7657-201ENSMUST00000118851 666 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Cpne9Q1RLL3 n-R5s174-201ENSMUST00000122638 121 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Cpne9Q1RLL3 St8sia3os-201ENSMUST00000123473 652 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Cpne9Q1RLL3 Gm13610-201ENSMUST00000128298 951 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Cpne9Q1RLL3 Gm16180-201ENSMUST00000128662 312 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Cpne9Q1RLL3 Gm15687-201ENSMUST00000141440 269 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Cpne9Q1RLL3 Mir1963-201ENSMUST00000158594 59 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Cpne9Q1RLL3 Gm7316-201ENSMUST00000165395 445 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Cpne9Q1RLL3 Gm6047-201ENSMUST00000167221 574 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Cpne9Q1RLL3 Gm26693-201ENSMUST00000181318 1021 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Cpne9Q1RLL3 1700101I11Rik-201ENSMUST00000181594 896 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Cpne9Q1RLL3 Trav12d-1-202ENSMUST00000183652 344 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Cpne9Q1RLL3 Mocs2-217ENSMUST00000184781 1250 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Cpne9Q1RLL3 1700015G11Rik-202ENSMUST00000185758 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Cpne9Q1RLL3 Gm18952-201ENSMUST00000194471 846 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Cpne9Q1RLL3 Gm8911-201ENSMUST00000213986 652 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Cpne9Q1RLL3 Fcer1a-201ENSMUST00000049706 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Cpne9Q1RLL3 Olfr591-201ENSMUST00000074272 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Cpne9Q1RLL3 Gm25260-201ENSMUST00000083053 134 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Cpne9Q1RLL3 AC170999.1-201ENSMUST00000226359 1585 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Cpne9Q1RLL3 Gm44894-201ENSMUST00000205280 2174 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Cpne9Q1RLL3 Ttn-202ENSMUST00000099980 16891 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Cpne9Q1RLL3 Gm14988-201ENSMUST00000117224 1548 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Cpne9Q1RLL3 Olfr808-202ENSMUST00000203236 4523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Cpne9Q1RLL3 Olfr1303-202ENSMUST00000216114 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Cpne9Q1RLL3 Vmn1r35-205ENSMUST00000227961 1789 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Cpne9Q1RLL3 Gm42729-201ENSMUST00000201770 2930 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Cpne9Q1RLL3 Olfr738-203ENSMUST00000214853 2046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Cpne9Q1RLL3 Gm11743-201ENSMUST00000117385 1735 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Cpne9Q1RLL3 Gprc6a-202ENSMUST00000218684 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Cpne9Q1RLL3 Ctps2-204ENSMUST00000112301 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Cpne9Q1RLL3 Abca13-201ENSMUST00000042740 16011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Cpne9Q1RLL3 Chrnb3-203ENSMUST00000211104 3241 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
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