Protein–RNA interactions for Protein: Q04890

Sox12, Transcription factor SOX-12, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox12Q04890 Ypel2-201ENSMUST00000018571 4847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Sox12Q04890 Rbpj-208ENSMUST00000201912 5485 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Sox12Q04890 Papss2-201ENSMUST00000025833 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Sox12Q04890 Atf7ip-201ENSMUST00000032335 8059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Sox12Q04890 Hdlbp-202ENSMUST00000170883 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Sox12Q04890 Gm14895-201ENSMUST00000121858 1361 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Sox12Q04890 Rsf1os2-202ENSMUST00000147690 3091 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Sox12Q04890 Gramd1c-204ENSMUST00000214098 2046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Sox12Q04890 Myt1-202ENSMUST00000108756 5509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Sox12Q04890 Adgrf4-204ENSMUST00000170723 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Sox12Q04890 Gm6368-201ENSMUST00000119727 2147 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Sox12Q04890 Olfr672-202ENSMUST00000213942 1490 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Sox12Q04890 Fbxo16-203ENSMUST00000224629 3781 ntAPPRIS P2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Sox12Q04890 Slc7a12-201ENSMUST00000037321 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Sox12Q04890 Sipa1l1-201ENSMUST00000053969 7488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Sox12Q04890 Slc13a2os-201ENSMUST00000149865 3627 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Sox12Q04890 Akap2-205ENSMUST00000102903 6650 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Sox12Q04890 Fmr1os-201ENSMUST00000181533 2743 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Sox12Q04890 Zkscan7-201ENSMUST00000063980 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Sox12Q04890 Gm14910-201ENSMUST00000121037 1805 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Sox12Q04890 Olfr1199-203ENSMUST00000131038 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Sox12Q04890 Zfp641-202ENSMUST00000169721 3673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Sox12Q04890 Gm44679-201ENSMUST00000207202 2908 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Sox12Q04890 Dpy19l3-201ENSMUST00000051377 8006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Sox12Q04890 Ash1l-202ENSMUST00000186583 11644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Sox12Q04890 Gk-202ENSMUST00000113978 4279 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Sox12Q04890 Ighv14-1-201ENSMUST00000103463 351 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Sox12Q04890 Gm14891-201ENSMUST00000117378 596 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Sox12Q04890 Gm7429-201ENSMUST00000118664 348 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Sox12Q04890 Gm12174-201ENSMUST00000119853 813 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Sox12Q04890 Stau2-209ENSMUST00000145092 564 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Sox12Q04890 Gm14011-201ENSMUST00000145178 302 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Sox12Q04890 Gm23162-201ENSMUST00000175081 121 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Sox12Q04890 Gm24157-201ENSMUST00000175265 111 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Sox12Q04890 Gm24465-201ENSMUST00000178398 107 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Sox12Q04890 9430069I07Rik-201ENSMUST00000179647 336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Sox12Q04890 Gm22263-201ENSMUST00000180060 104 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Sox12Q04890 Gm28512-201ENSMUST00000187415 762 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Sox12Q04890 Cd68-201ENSMUST00000018918 1230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Sox12Q04890 Gm3321-201ENSMUST00000200603 1129 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Sox12Q04890 Gm44265-201ENSMUST00000203631 465 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Sox12Q04890 Gm29754-201ENSMUST00000206269 358 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Sox12Q04890 Gm20670-201ENSMUST00000206468 338 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Sox12Q04890 AC167013.4-201ENSMUST00000226712 317 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Sox12Q04890 2210407C18Rik-201ENSMUST00000048801 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Sox12Q04890 9130409I23Rik-201ENSMUST00000036819 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Sox12Q04890 Rbms3-202ENSMUST00000068962 3320 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Sox12Q04890 Birc5-202ENSMUST00000093906 3334 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Sox12Q04890 Zfp407-202ENSMUST00000125763 7906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Sox12Q04890 Gm45767-201ENSMUST00000212778 4561 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Sox12Q04890 Dlg2-201ENSMUST00000074273 5278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Sox12Q04890 Gm43279-201ENSMUST00000202376 2512 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Sox12Q04890 Stard13-202ENSMUST00000110483 5662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Sox12Q04890 Etv1-210ENSMUST00000161980 1939 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Sox12Q04890 Musk-203ENSMUST00000098057 3422 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Sox12Q04890 Clec2g-201ENSMUST00000000254 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Sox12Q04890 Olfr1246-202ENSMUST00000213221 5338 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Sox12Q04890 Olfr1246-203ENSMUST00000217192 5301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Sox12Q04890 Serping1-201ENSMUST00000023994 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Sox12Q04890 Olfr744-202ENSMUST00000213668 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Sox12Q04890 Sox2ot-215ENSMUST00000199171 3486 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Sox12Q04890 Zc3h12c-202ENSMUST00000213645 6764 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Sox12Q04890 Map3k13-201ENSMUST00000042065 6709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Sox12Q04890 Slc22a19-201ENSMUST00000025666 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Sox12Q04890 Fam217a-201ENSMUST00000021851 2402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Sox12Q04890 AC144772.2-201ENSMUST00000228830 2859 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Sox12Q04890 Umodl1-202ENSMUST00000066981 4662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Sox12Q04890 Gapt-201ENSMUST00000058806 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Sox12Q04890 Gm14106-201ENSMUST00000119382 438 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Sox12Q04890 Gm12929-201ENSMUST00000122406 370 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Sox12Q04890 Gm22384-201ENSMUST00000158187 104 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Sox12Q04890 Gm16572-201ENSMUST00000160258 279 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Sox12Q04890 Zwint-204ENSMUST00000160337 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Sox12Q04890 Gm16545-201ENSMUST00000161968 463 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Sox12Q04890 Gm20396-201ENSMUST00000173358 745 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Sox12Q04890 Gm25640-201ENSMUST00000175378 125 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Sox12Q04890 Dnah7c-201ENSMUST00000178395 612 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Sox12Q04890 1700028D13Rik-202ENSMUST00000187272 675 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Sox12Q04890 Gm28980-201ENSMUST00000187877 219 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Sox12Q04890 Ikzf2-209ENSMUST00000191262 1146 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Sox12Q04890 Lncbate1-201ENSMUST00000211953 812 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Sox12Q04890 Fkbp1b-202ENSMUST00000219880 246 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Sox12Q04890 4930529N20Rik-201ENSMUST00000220538 639 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Sox12Q04890 AC174797.2-203ENSMUST00000224017 716 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Sox12Q04890 Stfa3-201ENSMUST00000068182 412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Sox12Q04890 4930512M02Rik-201ENSMUST00000081896 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Sox12Q04890 Gm22358-201ENSMUST00000082877 122 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Sox12Q04890 Gm25188-201ENSMUST00000083913 122 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Sox12Q04890 Gm43219-201ENSMUST00000197972 1937 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Sox12Q04890 Ssh2-201ENSMUST00000037912 9178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Sox12Q04890 Zfp386-204ENSMUST00000183125 4779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Sox12Q04890 Eapp-206ENSMUST00000163433 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Sox12Q04890 Pde10a-204ENSMUST00000115715 2783 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Sox12Q04890 Acsm5-201ENSMUST00000066465 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Sox12Q04890 Gm42656-201ENSMUST00000201506 2305 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Sox12Q04890 Gm7534-201ENSMUST00000097849 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Sox12Q04890 Kars-ps1-201ENSMUST00000122077 1767 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Sox12Q04890 2610044O15Rik8-205ENSMUST00000190157 1776 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Sox12Q04890 Usp54-201ENSMUST00000022356 6580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Sox12Q04890 Gm10248-201ENSMUST00000090409 2731 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.2 ms