Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 680 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Olfr65-202ENSMUST00000209528 1106 ntAPPRIS P2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
Sh3bp1P55194 Gm40787-201ENSMUST00000218056 317 ntTSL 3 BASIC6.18□□□□□ -1.42
Sh3bp1P55194 Gm3800-201ENSMUST00000221086 554 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
Sh3bp1P55194 AC127242.4-201ENSMUST00000221242 470 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
Sh3bp1P55194 Gm18413-201ENSMUST00000221573 655 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
Sh3bp1P55194 AC141884.1-201ENSMUST00000226327 636 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
Sh3bp1P55194 AC166574.7-201ENSMUST00000228502 704 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
Sh3bp1P55194 Mlip-201ENSMUST00000034910 1227 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
Sh3bp1P55194 Olfr1023-201ENSMUST00000056408 936 ntAPPRIS P1 BASIC6.18□□□□□ -1.42
Sh3bp1P55194 Speer4a-201ENSMUST00000079447 2980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
Sh3bp1P55194 mt-Nd3-201ENSMUST00000082411 348 ntAPPRIS P1 BASIC6.18□□□□□ -1.42
Sh3bp1P55194 Olfr994-201ENSMUST00000099925 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.18□□□□□ -1.42
Sh3bp1P55194 Zfp763-201ENSMUST00000087654 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
Sh3bp1P55194 Gm19035-201ENSMUST00000193299 1742 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
Sh3bp1P55194 Gm36298-201ENSMUST00000223394 1732 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
Sh3bp1P55194 Olfr612-202ENSMUST00000214269 2420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
Sh3bp1P55194 Lrrc4c-203ENSMUST00000162807 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
Sh3bp1P55194 Zfp26-203ENSMUST00000159569 11276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
Sh3bp1P55194 Plcb4-201ENSMUST00000035646 3635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
Sh3bp1P55194 Tet1-201ENSMUST00000050826 13986 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
Sh3bp1P55194 Serpina3b-201ENSMUST00000085052 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
Sh3bp1P55194 Gm31258-201ENSMUST00000194532 3297 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
Sh3bp1P55194 Vmn1r167-202ENSMUST00000227713 2677 ntAPPRIS P1 BASIC6.17□□□□□ -1.42
Sh3bp1P55194 Gm28278-201ENSMUST00000185603 1499 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
Sh3bp1P55194 Gm28279-201ENSMUST00000186248 1493 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
Sh3bp1P55194 Gm28491-202ENSMUST00000186902 1493 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
Sh3bp1P55194 Gm29368-201ENSMUST00000187201 1489 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
Sh3bp1P55194 Gm28088-202ENSMUST00000187402 1493 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
Sh3bp1P55194 Gm28674-201ENSMUST00000187502 1493 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
Sh3bp1P55194 Gm28131-203ENSMUST00000187841 1493 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
Sh3bp1P55194 Gm28487-202ENSMUST00000187894 1493 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
Sh3bp1P55194 Gm29056-201ENSMUST00000187933 1493 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
Sh3bp1P55194 Gm29074-203ENSMUST00000188026 1493 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
Sh3bp1P55194 Gm28754-201ENSMUST00000188778 1493 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
Sh3bp1P55194 Gm28520-202ENSMUST00000189379 1493 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
Sh3bp1P55194 Gm29275-202ENSMUST00000189475 1494 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
Sh3bp1P55194 Gm28963-202ENSMUST00000189567 1493 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
Sh3bp1P55194 Gm28519-203ENSMUST00000190126 1493 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
Sh3bp1P55194 Gm29207-202ENSMUST00000190931 1493 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
Sh3bp1P55194 Gm28310-202ENSMUST00000191136 1493 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
Sh3bp1P55194 Gm29646-202ENSMUST00000191146 1493 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
Sh3bp1P55194 Gm28762-203ENSMUST00000191259 1493 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
Sh3bp1P55194 Gm28691-202ENSMUST00000191561 1493 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
Sh3bp1P55194 Gm38174-201ENSMUST00000191787 1494 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
Sh3bp1P55194 Vmn2r4-201ENSMUST00000170280 2484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
Sh3bp1P55194 Agbl1-201ENSMUST00000026854 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
Sh3bp1P55194 Ube2u-202ENSMUST00000133493 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
Sh3bp1P55194 C87499-202ENSMUST00000107142 672 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
Sh3bp1P55194 Csnk2a1-ps-201ENSMUST00000118846 1175 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
Sh3bp1P55194 Gm3931-201ENSMUST00000119038 455 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
Sh3bp1P55194 Mup-ps16-201ENSMUST00000120085 596 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
Sh3bp1P55194 Gm15331-201ENSMUST00000120225 385 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
Sh3bp1P55194 Saxo1os-201ENSMUST00000131790 628 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
Sh3bp1P55194 Gm23539-201ENSMUST00000157537 224 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
Sh3bp1P55194 Gm24402-201ENSMUST00000157873 91 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
Sh3bp1P55194 Gm25459-201ENSMUST00000157953 114 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
Sh3bp1P55194 Gm22158-201ENSMUST00000158411 126 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
Sh3bp1P55194 Gm26169-201ENSMUST00000158420 135 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
Sh3bp1P55194 Gm16161-201ENSMUST00000162239 290 ntTSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
Sh3bp1P55194 Gm18199-201ENSMUST00000173820 835 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
Sh3bp1P55194 Gm26954-201ENSMUST00000182106 622 ntTSL 3 BASIC6.17□□□□□ -1.42
Sh3bp1P55194 BE692007-201ENSMUST00000186054 954 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
Sh3bp1P55194 Gm29013-201ENSMUST00000187431 237 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
Sh3bp1P55194 Gm8826-201ENSMUST00000193161 948 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
Sh3bp1P55194 4931440P22Rik-205ENSMUST00000194448 474 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
Sh3bp1P55194 Gm37072-201ENSMUST00000194570 837 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
Sh3bp1P55194 Ighv1-44-201ENSMUST00000195597 352 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
Sh3bp1P55194 Gm29736-201ENSMUST00000198189 385 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
Sh3bp1P55194 Gm4742-201ENSMUST00000200261 771 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
Sh3bp1P55194 AC153845.2-203ENSMUST00000215889 617 ntTSL 3 BASIC6.17□□□□□ -1.42
Sh3bp1P55194 AC160413.1-201ENSMUST00000217909 932 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
Sh3bp1P55194 AC154828.2-201ENSMUST00000220908 1070 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
Sh3bp1P55194 Gm7550-201ENSMUST00000223334 282 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
Sh3bp1P55194 Zfp429-203ENSMUST00000224684 524 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
Sh3bp1P55194 Olfr482-201ENSMUST00000081184 972 ntAPPRIS P1 BASIC6.17□□□□□ -1.42
Sh3bp1P55194 mt-Nd1-201ENSMUST00000082392 957 ntAPPRIS P1 BASIC6.17□□□□□ -1.42
Sh3bp1P55194 Olfr685-203ENSMUST00000214712 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
Sh3bp1P55194 Vmn2r21-201ENSMUST00000163607 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
Sh3bp1P55194 Vmn2r20-201ENSMUST00000172199 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
Sh3bp1P55194 Slfn10-ps-201ENSMUST00000100716 3621 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
Sh3bp1P55194 Agtr1b-202ENSMUST00000163776 1633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
Sh3bp1P55194 Gm42645-201ENSMUST00000201573 1627 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
Sh3bp1P55194 Olfr57-202ENSMUST00000203906 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
Sh3bp1P55194 Gm10330-201ENSMUST00000072014 1354 ntAPPRIS P1 BASIC6.17□□□□□ -1.42
Sh3bp1P55194 Gm2033-201ENSMUST00000210753 2287 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
Sh3bp1P55194 AC155255.1-201ENSMUST00000218751 1428 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
Sh3bp1P55194 Mndal-204ENSMUST00000188804 2026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
Sh3bp1P55194 Olfr738-203ENSMUST00000214853 2046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
Sh3bp1P55194 Olfr1382-202ENSMUST00000213152 4236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
Sh3bp1P55194 Ktn1-207ENSMUST00000186761 3902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
Sh3bp1P55194 Gm36529-201ENSMUST00000222495 1529 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
Sh3bp1P55194 Ugt2b35-201ENSMUST00000031186 3359 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
Sh3bp1P55194 Olfr1181-202ENSMUST00000102619 1240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
Sh3bp1P55194 Magea6-202ENSMUST00000112562 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
Sh3bp1P55194 Gm5751-201ENSMUST00000115561 444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
Sh3bp1P55194 Gm6893-201ENSMUST00000118385 522 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
Sh3bp1P55194 Gm7189-201ENSMUST00000119811 429 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
Sh3bp1P55194 Gm12569-202ENSMUST00000126189 796 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
Sh3bp1P55194 Crem-207ENSMUST00000126578 915 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
Sh3bp1P55194 Gm16180-201ENSMUST00000128662 312 ntTSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.6 ms