Protein–RNA interactions for Protein: P33215

Nedd1, Protein NEDD1, mousemouse

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Length 660 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd1P33215 Gm2996-201ENSMUST00000211398 537 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Nedd1P33215 Gm8911-201ENSMUST00000213986 652 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Nedd1P33215 Gm18557-201ENSMUST00000218710 433 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Nedd1P33215 4930563J15Rik-203ENSMUST00000219796 574 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Nedd1P33215 CT573085.1-201ENSMUST00000224279 1197 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Nedd1P33215 AC154328.1-201ENSMUST00000225875 307 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Nedd1P33215 AC146601.1-201ENSMUST00000227910 905 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Nedd1P33215 Acrv1-201ENSMUST00000034620 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Nedd1P33215 Mcts1-201ENSMUST00000000365 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
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Nedd1P33215 Olfr340-201ENSMUST00000072854 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Nedd1P33215 Olfr1351-201ENSMUST00000080730 960 ntAPPRIS P1 BASIC7.2□□□□□ -1.26
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Nedd1P33215 Atm-201ENSMUST00000118282 10006 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Nedd1P33215 AC122346.1-201ENSMUST00000225266 3732 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Nedd1P33215 BC067074-201ENSMUST00000078163 3546 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Nedd1P33215 Ms4a13-202ENSMUST00000188464 1301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
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Nedd1P33215 Gm44220-201ENSMUST00000203784 2487 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Nedd1P33215 Olfr559-202ENSMUST00000215657 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Nedd1P33215 Abca4-207ENSMUST00000141135 3606 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Nedd1P33215 Xrn1-201ENSMUST00000034981 5499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
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Nedd1P33215 Lmo3-204ENSMUST00000162772 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Nedd1P33215 Olfr10-202ENSMUST00000217290 2776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
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Nedd1P33215 Spam1-203ENSMUST00000202569 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Nedd1P33215 Olfr20-202ENSMUST00000120137 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Nedd1P33215 Nfib-202ENSMUST00000064770 8429 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Nedd1P33215 Rbmy-201ENSMUST00000100360 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Nedd1P33215 Gm10256-202ENSMUST00000188114 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Nedd1P33215 Gm21708-203ENSMUST00000190283 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Nedd1P33215 Nxf7-202ENSMUST00000113163 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Nedd1P33215 Chn1-202ENSMUST00000102677 3760 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Nedd1P33215 Lrp1-201ENSMUST00000049149 14888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Nedd1P33215 Gm38156-201ENSMUST00000194601 2260 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
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Nedd1P33215 Gm13373-201ENSMUST00000144634 655 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Nedd1P33215 Gm14640-201ENSMUST00000145800 437 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
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Nedd1P33215 Sptssb-202ENSMUST00000171529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
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Nedd1P33215 Wdr49-203ENSMUST00000204341 1344 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Nedd1P33215 Mttp-201ENSMUST00000029805 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
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Nedd1P33215 Gm10032-201ENSMUST00000071522 1887 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Nedd1P33215 Adamts12-201ENSMUST00000061318 8579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Nedd1P33215 Gm36640-201ENSMUST00000203686 5934 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
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Nedd1P33215 Gm16568-201ENSMUST00000066038 1910 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Nedd1P33215 Ccdc144b-201ENSMUST00000166644 1685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Nedd1P33215 Gm7970-201ENSMUST00000167615 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Nedd1P33215 Gm7980-201ENSMUST00000168107 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Nedd1P33215 Gm8229-201ENSMUST00000168161 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Nedd1P33215 Dock7-214ENSMUST00000205650 6297 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Nedd1P33215 9430053O09Rik-201ENSMUST00000192654 2570 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Nedd1P33215 Olfr350-202ENSMUST00000214457 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Nedd1P33215 Olfr720-202ENSMUST00000206298 4437 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Nedd1P33215 Gm19093-201ENSMUST00000210671 1454 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Nedd1P33215 AY358078-201ENSMUST00000053821 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Nedd1P33215 AC152922.2-201ENSMUST00000213353 3879 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Nedd1P33215 Gm10826-201ENSMUST00000215366 3304 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Nedd1P33215 Aspa-201ENSMUST00000021119 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Nedd1P33215 Olfr1052-202ENSMUST00000215090 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.3 ms