Protein–RNA interactions for Protein: P04230

H2-Eb1, H-2 class II histocompatibility antigen, E-B beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Eb1P04230 Gm4822-201ENSMUST00000077551 479 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
H2-Eb1P04230 Snora44-201ENSMUST00000082670 129 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
H2-Eb1P04230 Gm26330-201ENSMUST00000082817 104 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
H2-Eb1P04230 1700034E13Rik-201ENSMUST00000091904 439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
H2-Eb1P04230 Lrrtm4-202ENSMUST00000126005 3733 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
H2-Eb1P04230 Gm13961-201ENSMUST00000119282 4772 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
H2-Eb1P04230 Gm17021-202ENSMUST00000214413 2371 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
H2-Eb1P04230 Adgrv1-201ENSMUST00000095585 19338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
H2-Eb1P04230 Vmn1r185-203ENSMUST00000227264 5589 ntAPPRIS P1 BASIC5.09□□□□□ -1.59
H2-Eb1P04230 Gm43164-201ENSMUST00000202529 2128 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
H2-Eb1P04230 Nfia-205ENSMUST00000107062 9239 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.6
H2-Eb1P04230 Olfr1166-202ENSMUST00000217575 2004 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.6
H2-Eb1P04230 A730081D07Rik-201ENSMUST00000153685 1804 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
H2-Eb1P04230 AA792892-201ENSMUST00000097477 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
H2-Eb1P04230 Vmn1r185-205ENSMUST00000227461 5318 ntAPPRIS P1 BASIC5.09□□□□□ -1.6
H2-Eb1P04230 Tbx22-204ENSMUST00000168403 1715 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
H2-Eb1P04230 Vmn2r110-201ENSMUST00000169559 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.6
H2-Eb1P04230 Gm14326-204ENSMUST00000178829 1665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
H2-Eb1P04230 Gm42905-201ENSMUST00000196237 1611 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
H2-Eb1P04230 Olfr736-203ENSMUST00000213755 2338 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
H2-Eb1P04230 Gm43428-201ENSMUST00000200108 3845 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
H2-Eb1P04230 Vmn1r217-202ENSMUST00000227110 9888 ntAPPRIS P1 BASIC5.08□□□□□ -1.6
H2-Eb1P04230 Gm43319-201ENSMUST00000198036 2270 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
H2-Eb1P04230 Plcz1-201ENSMUST00000032356 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
H2-Eb1P04230 Gm11264-201ENSMUST00000143755 2969 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
H2-Eb1P04230 Vmn2r89-201ENSMUST00000159611 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
H2-Eb1P04230 Spef2-206ENSMUST00000208854 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
H2-Eb1P04230 Igkv15-103-201ENSMUST00000103324 375 ntAPPRIS P1 BASIC5.08□□□□□ -1.6
H2-Eb1P04230 Gm22592-201ENSMUST00000104242 131 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
H2-Eb1P04230 Gm12039-201ENSMUST00000118219 180 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
H2-Eb1P04230 Gm15428-201ENSMUST00000121352 333 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
H2-Eb1P04230 1700007M16Rik-201ENSMUST00000129075 435 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
H2-Eb1P04230 Gm5699-201ENSMUST00000152491 723 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
H2-Eb1P04230 Gm24944-201ENSMUST00000158330 128 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
H2-Eb1P04230 Gm25048-201ENSMUST00000158598 91 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
H2-Eb1P04230 Gm3594-201ENSMUST00000169152 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
H2-Eb1P04230 Gm18828-202ENSMUST00000181035 310 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
H2-Eb1P04230 Gm28514-201ENSMUST00000187488 450 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
H2-Eb1P04230 Gm28962-201ENSMUST00000187993 621 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
H2-Eb1P04230 Gm5066-201ENSMUST00000188479 822 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
H2-Eb1P04230 Gm28692-202ENSMUST00000189645 621 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
H2-Eb1P04230 Gm38180-201ENSMUST00000192381 395 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
H2-Eb1P04230 Gm37123-201ENSMUST00000192994 1171 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
H2-Eb1P04230 A730094K22Rik-201ENSMUST00000193867 740 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
H2-Eb1P04230 Gm34768-201ENSMUST00000193884 565 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
H2-Eb1P04230 Gm19708-201ENSMUST00000199386 543 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
H2-Eb1P04230 Asb17os-202ENSMUST00000200329 497 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
H2-Eb1P04230 Gm44091-201ENSMUST00000205212 649 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
H2-Eb1P04230 CT025625.1-201ENSMUST00000217786 460 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
H2-Eb1P04230 AC159379.1-201ENSMUST00000218192 620 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
H2-Eb1P04230 Gm34719-201ENSMUST00000222231 382 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
H2-Eb1P04230 AC131117.1-201ENSMUST00000225154 1171 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
H2-Eb1P04230 Olfr143-201ENSMUST00000093865 942 ntAPPRIS P2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
H2-Eb1P04230 Gm3985-201ENSMUST00000132101 2515 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
H2-Eb1P04230 Abcb11-201ENSMUST00000102709 5025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
H2-Eb1P04230 Mapk10-204ENSMUST00000112848 6761 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
H2-Eb1P04230 Gm42492-201ENSMUST00000195780 2915 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
H2-Eb1P04230 Ccr9-204ENSMUST00000168910 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
H2-Eb1P04230 Cdk14-203ENSMUST00000115451 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
H2-Eb1P04230 Zscan4-ps3-201ENSMUST00000210559 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
H2-Eb1P04230 Gm42671-201ENSMUST00000198013 1604 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
H2-Eb1P04230 Gm38243-201ENSMUST00000194737 1567 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
H2-Eb1P04230 Olfr231-202ENSMUST00000214446 5204 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
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H2-Eb1P04230 Vmn2r124-201ENSMUST00000176802 2568 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
H2-Eb1P04230 Gm30211-201ENSMUST00000197227 3078 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
H2-Eb1P04230 Myo3a-201ENSMUST00000044749 5082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
H2-Eb1P04230 Ccna2-205ENSMUST00000196316 2001 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
H2-Eb1P04230 Usf3-204ENSMUST00000169582 12604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
H2-Eb1P04230 Gm11674-201ENSMUST00000124855 3005 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
H2-Eb1P04230 Zfp780b-204ENSMUST00000206685 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
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H2-Eb1P04230 Olfr620-201ENSMUST00000052152 3157 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
H2-Eb1P04230 Gm43121-201ENSMUST00000199065 1305 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
H2-Eb1P04230 Traj25-201ENSMUST00000103716 57 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
H2-Eb1P04230 Eaf2-203ENSMUST00000114825 668 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
H2-Eb1P04230 Gm13195-201ENSMUST00000117229 261 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
H2-Eb1P04230 Gm15421-202ENSMUST00000118224 399 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
H2-Eb1P04230 Olfr637-ps1-201ENSMUST00000120386 471 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
H2-Eb1P04230 Gm12332-201ENSMUST00000121397 922 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
H2-Eb1P04230 Gm12936-201ENSMUST00000121439 301 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
H2-Eb1P04230 Gm13189-201ENSMUST00000138462 252 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
H2-Eb1P04230 Fpr2-202ENSMUST00000149944 883 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
H2-Eb1P04230 Gm23993-201ENSMUST00000157478 144 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
H2-Eb1P04230 Gm26172-201ENSMUST00000158421 134 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
H2-Eb1P04230 AC122858.3-202ENSMUST00000161721 433 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
H2-Eb1P04230 Inpp4b-209ENSMUST00000172031 8067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
H2-Eb1P04230 Vmn1r-ps21-201ENSMUST00000176891 925 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
H2-Eb1P04230 Gm26731-201ENSMUST00000180683 543 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
H2-Eb1P04230 Gm26909-201ENSMUST00000181668 627 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
H2-Eb1P04230 Mir6539-201ENSMUST00000183732 110 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
H2-Eb1P04230 Gm2147-201ENSMUST00000193588 639 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
H2-Eb1P04230 Gm6543-201ENSMUST00000197353 808 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
H2-Eb1P04230 Gm43215-201ENSMUST00000199108 252 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
H2-Eb1P04230 Tprkb-208ENSMUST00000200680 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
H2-Eb1P04230 Gm44571-201ENSMUST00000208092 533 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
H2-Eb1P04230 Gm39384-201ENSMUST00000213703 743 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
H2-Eb1P04230 Gm6477-201ENSMUST00000217098 764 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
H2-Eb1P04230 AC153729.4-201ENSMUST00000217582 3826 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
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