Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Gm31749-201ENSMUST00000206873 598 ntTSL 3 BASIC4.39□□□□□ -1.71
Ccl20O89093 AC140409.4-201ENSMUST00000215757 538 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
Ccl20O89093 1700048P04Rik-201ENSMUST00000219825 369 ntTSL 3 BASIC4.39□□□□□ -1.71
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Ccl20O89093 Trappc1-201ENSMUST00000060956 628 ntTSL 3 BASIC4.39□□□□□ -1.71
Ccl20O89093 Mup14-201ENSMUST00000071005 652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.39□□□□□ -1.71
Ccl20O89093 Olfr1307-202ENSMUST00000099606 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.39□□□□□ -1.71
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Ccl20O89093 Olfr1279-203ENSMUST00000216697 3385 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
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Ccl20O89093 Gm12051-201ENSMUST00000147771 1341 ntTSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
Ccl20O89093 Obox5-201ENSMUST00000098802 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
Ccl20O89093 Gm42436-201ENSMUST00000198804 3656 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
Ccl20O89093 Postn-202ENSMUST00000081564 2670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
Ccl20O89093 Olfr695-201ENSMUST00000216868 3953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
Ccl20O89093 Vmn1r30-202ENSMUST00000226334 1946 ntAPPRIS P1 BASIC4.38□□□□□ -1.71
Ccl20O89093 Olfr459-203ENSMUST00000214976 3770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.38□□□□□ -1.71
Ccl20O89093 1700061I17Rik-201ENSMUST00000029642 1962 ntTSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
Ccl20O89093 Zfp329-201ENSMUST00000072222 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
Ccl20O89093 Capn6-201ENSMUST00000087316 3561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
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Ccl20O89093 Gm28570-201ENSMUST00000188300 1495 ntTSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
Ccl20O89093 Hrnr-202ENSMUST00000093774 11187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
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Ccl20O89093 CT009754.2-201ENSMUST00000221683 3661 ntTSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
Ccl20O89093 Gramd1c-201ENSMUST00000036174 3501 ntTSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
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Ccl20O89093 Gm14603-201ENSMUST00000121275 448 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
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Ccl20O89093 Gm14003-201ENSMUST00000130919 313 ntTSL 3 BASIC4.38□□□□□ -1.71
Ccl20O89093 Gm15818-201ENSMUST00000134692 656 ntTSL 3 BASIC4.38□□□□□ -1.71
Ccl20O89093 Tmem132cos-202ENSMUST00000154361 699 ntTSL 3 BASIC4.38□□□□□ -1.71
Ccl20O89093 Gm26086-201ENSMUST00000157902 263 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
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Ccl20O89093 Gm20940-201ENSMUST00000197308 360 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
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Ccl20O89093 Gm29781-201ENSMUST00000203862 478 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
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Ccl20O89093 Ppih-201ENSMUST00000056458 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
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Ccl20O89093 A730004F24Rik-202ENSMUST00000195454 1704 ntTSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
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Ccl20O89093 Serpinb3b-202ENSMUST00000166100 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
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Ccl20O89093 Gm23844-201ENSMUST00000116959 121 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
Ccl20O89093 Gm24484-201ENSMUST00000117009 121 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
Ccl20O89093 Gm25347-201ENSMUST00000117026 121 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
Ccl20O89093 Gm22112-201ENSMUST00000117032 121 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
Ccl20O89093 Cnep1r1-202ENSMUST00000117775 728 ntTSL 3 BASIC4.37□□□□□ -1.71
Ccl20O89093 Ttc29-203ENSMUST00000117845 650 ntTSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
Ccl20O89093 Gm11409-201ENSMUST00000118621 403 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
Ccl20O89093 Gm14335-201ENSMUST00000119165 810 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
Ccl20O89093 Gm15828-201ENSMUST00000119911 522 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
Ccl20O89093 Atp5l2-ps-201ENSMUST00000120130 312 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
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