Protein–RNA interactions for Protein: O19441

H2-Q1, Histocompatibility 2, Q region locus 1, mousemouse

Predictions only

Length 368 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Q1O19441 AC108401.1-201ENSMUST00000219740 361 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
H2-Q1O19441 4930452L12Rik-201ENSMUST00000220158 785 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
H2-Q1O19441 Gm5087-204ENSMUST00000225820 645 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
H2-Q1O19441 AC154323.1-201ENSMUST00000228329 1231 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
H2-Q1O19441 Vmn1r68-201ENSMUST00000058362 960 ntAPPRIS P1 BASIC5.29□□□□□ -1.56
H2-Q1O19441 Gm4861-201ENSMUST00000068546 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
H2-Q1O19441 Spink7-201ENSMUST00000076194 258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
H2-Q1O19441 Olfr107-201ENSMUST00000077008 1033 ntAPPRIS P1 BASIC5.29□□□□□ -1.56
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H2-Q1O19441 Scgb2b27-201ENSMUST00000085620 512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
H2-Q1O19441 Defa31-201ENSMUST00000098896 377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
H2-Q1O19441 Olfr1016-201ENSMUST00000099915 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.29□□□□□ -1.56
H2-Q1O19441 Cpne4-202ENSMUST00000077190 3409 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
H2-Q1O19441 Cxcl11-202ENSMUST00000122808 3794 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
H2-Q1O19441 A230103L15Rik-201ENSMUST00000207198 3872 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
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H2-Q1O19441 Rfx6-201ENSMUST00000050455 3088 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
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H2-Q1O19441 4930421C12Rik-201ENSMUST00000200814 1574 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
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H2-Q1O19441 Gm44822-201ENSMUST00000208559 6389 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
H2-Q1O19441 Dnah8-201ENSMUST00000170651 14583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
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H2-Q1O19441 Elavl4-203ENSMUST00000106597 4149 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
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H2-Q1O19441 Ptprd-204ENSMUST00000102834 8084 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
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H2-Q1O19441 Eaf2-203ENSMUST00000114825 668 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
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H2-Q1O19441 Rnase2a-201ENSMUST00000061936 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
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H2-Q1O19441 Olfr704-202ENSMUST00000098141 948 ntAPPRIS P1 BASIC5.28□□□□□ -1.56
H2-Q1O19441 Defa5-201ENSMUST00000098892 376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
H2-Q1O19441 Rev3l-207ENSMUST00000164763 10399 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
H2-Q1O19441 Trim30d-201ENSMUST00000033211 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
H2-Q1O19441 Pi15-201ENSMUST00000088476 6923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
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