Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ02

Gm2056, Predicted gene 2056, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2056J3QQ02 Igkv5-43-201ENSMUST00000103368 379 ntAPPRIS P1 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Gm2056J3QQ02 Ighv12-3-201ENSMUST00000103485 353 ntAPPRIS P1 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Gm2056J3QQ02 Gm24835-201ENSMUST00000116777 111 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Gm2056J3QQ02 Gm15311-201ENSMUST00000119682 282 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Gm2056J3QQ02 Gm15305-201ENSMUST00000120354 288 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Gm2056J3QQ02 Gm11472-201ENSMUST00000121305 556 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Gm2056J3QQ02 Pttg1-206ENSMUST00000121638 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Gm2056J3QQ02 Gm11254-201ENSMUST00000122368 653 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Gm2056J3QQ02 Gm15848-202ENSMUST00000125056 832 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Gm2056J3QQ02 1700025D23Rik-201ENSMUST00000129365 846 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Gm2056J3QQ02 1700047F07Rik-202ENSMUST00000143064 463 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Gm2056J3QQ02 Gm13629-202ENSMUST00000152740 645 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Gm2056J3QQ02 Gm23435-201ENSMUST00000157183 156 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Gm2056J3QQ02 Hmgb1-ps7-201ENSMUST00000173370 648 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Gm2056J3QQ02 Malat1-203ENSMUST00000173499 485 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Gm2056J3QQ02 Tnfsf10-202ENSMUST00000174840 989 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Gm2056J3QQ02 Gm8237-202ENSMUST00000178594 447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Gm2056J3QQ02 Gm22776-201ENSMUST00000178634 94 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Gm2056J3QQ02 Gm23767-201ENSMUST00000179278 94 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Gm2056J3QQ02 1700010L04Rik-203ENSMUST00000179662 1015 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Gm2056J3QQ02 Gm5527-201ENSMUST00000179821 642 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Gm2056J3QQ02 Gm21614-201ENSMUST00000183260 1005 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Gm2056J3QQ02 Gm28413-201ENSMUST00000189369 291 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Gm2056J3QQ02 Gm28564-201ENSMUST00000190864 240 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Gm2056J3QQ02 Gm37065-201ENSMUST00000191636 444 ntTSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Gm2056J3QQ02 Gm42522-201ENSMUST00000196071 255 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Gm2056J3QQ02 Gm9504-201ENSMUST00000196322 468 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Gm2056J3QQ02 Gm43675-201ENSMUST00000199468 1184 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Gm2056J3QQ02 Oaz3-204ENSMUST00000199678 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Gm2056J3QQ02 Gm44040-201ENSMUST00000203360 545 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Gm2056J3QQ02 Gm30784-201ENSMUST00000204491 794 ntTSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Gm2056J3QQ02 Lair1-209ENSMUST00000205296 412 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Gm2056J3QQ02 Gm44748-201ENSMUST00000206040 658 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Gm2056J3QQ02 Olfr1509-203ENSMUST00000206100 1161 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Gm2056J3QQ02 Olfr809-203ENSMUST00000218237 1100 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Gm2056J3QQ02 AC134528.1-201ENSMUST00000219156 387 ntTSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Gm2056J3QQ02 AC124601.1-201ENSMUST00000220531 135 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Gm2056J3QQ02 AC154426.1-201ENSMUST00000225614 1132 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Gm2056J3QQ02 AC154640.1-202ENSMUST00000227828 496 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Gm2056J3QQ02 Olfr809-201ENSMUST00000059891 1100 ntAPPRIS P1 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Gm2056J3QQ02 Olfr967-201ENSMUST00000069561 933 ntAPPRIS P1 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Gm2056J3QQ02 Vmn1r215-201ENSMUST00000072972 1048 ntAPPRIS P1 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Gm2056J3QQ02 Gm7099-201ENSMUST00000080066 554 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Gm2056J3QQ02 Gm24621-201ENSMUST00000082679 140 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Gm2056J3QQ02 Mir181a-1-201ENSMUST00000083631 87 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Gm2056J3QQ02 Olfr1305-201ENSMUST00000099608 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Gm2056J3QQ02 Olfr1016-201ENSMUST00000099915 930 ntAPPRIS P1 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Gm2056J3QQ02 Ndnf-201ENSMUST00000054351 10101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Gm2056J3QQ02 Tarm1-202ENSMUST00000203020 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Gm2056J3QQ02 Gdpd4-202ENSMUST00000170049 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Gm2056J3QQ02 C1s2-202ENSMUST00000218020 2662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Gm2056J3QQ02 C1s2-201ENSMUST00000068797 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Gm2056J3QQ02 Mlh3-203ENSMUST00000220854 4699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Gm2056J3QQ02 Nckap5-201ENSMUST00000057846 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Gm2056J3QQ02 2900079G21Rik-202ENSMUST00000144424 2944 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Gm2056J3QQ02 Zfp345-201ENSMUST00000109914 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Gm2056J3QQ02 Cyp4a10-201ENSMUST00000058785 2109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Gm2056J3QQ02 Nckap5-204ENSMUST00000112583 7212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Gm2056J3QQ02 Itih5l-ps-201ENSMUST00000145639 3964 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Gm2056J3QQ02 Cfap54-211ENSMUST00000212902 9516 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Gm2056J3QQ02 Gm7361-201ENSMUST00000074148 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Gm2056J3QQ02 Gm37755-201ENSMUST00000195880 2179 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Gm2056J3QQ02 Mapk8-205ENSMUST00000111945 5756 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Gm2056J3QQ02 AC164297.6-201ENSMUST00000224643 1568 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Gm2056J3QQ02 Ptprd-220ENSMUST00000174831 4518 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Gm2056J3QQ02 Gpatch11-201ENSMUST00000170759 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Gm2056J3QQ02 Fbxw22-201ENSMUST00000080626 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Gm2056J3QQ02 Galnt15-202ENSMUST00000164208 3563 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Gm2056J3QQ02 Gm10862-201ENSMUST00000193956 3350 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Gm2056J3QQ02 Psg20-202ENSMUST00000108482 1871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Gm2056J3QQ02 Grm8-202ENSMUST00000115323 3856 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Gm2056J3QQ02 Usp17lc-201ENSMUST00000079348 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Gm2056J3QQ02 Gdap1-201ENSMUST00000026879 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Gm2056J3QQ02 Ap4e1-201ENSMUST00000002063 4600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Gm2056J3QQ02 Aass-201ENSMUST00000031707 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Gm2056J3QQ02 Olfr11-202ENSMUST00000205631 3265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Gm2056J3QQ02 Golph3l-207ENSMUST00000177390 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Gm2056J3QQ02 Fbxw15-201ENSMUST00000056745 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Gm2056J3QQ02 Gm21750-201ENSMUST00000098874 1497 ntAPPRIS P1 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Gm2056J3QQ02 Nif3l1-201ENSMUST00000087521 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Gm2056J3QQ02 Sprr2a3-202ENSMUST00000193337 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Gm2056J3QQ02 Defb30-201ENSMUST00000100490 307 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Gm2056J3QQ02 Gm22267-201ENSMUST00000104008 131 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Gm2056J3QQ02 Gm25785-201ENSMUST00000104129 125 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Gm2056J3QQ02 Gm23485-201ENSMUST00000104181 155 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Gm2056J3QQ02 Gm14308-202ENSMUST00000117267 777 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Gm2056J3QQ02 Gm11908-201ENSMUST00000117755 347 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Gm2056J3QQ02 Gm14893-201ENSMUST00000117904 282 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Gm2056J3QQ02 Gm14158-201ENSMUST00000118409 308 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Gm2056J3QQ02 Gm13349-201ENSMUST00000118436 411 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Gm2056J3QQ02 Gm12242-201ENSMUST00000118824 738 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Gm2056J3QQ02 Gm14574-201ENSMUST00000120644 279 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Gm2056J3QQ02 Gm14530-201ENSMUST00000122391 333 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Gm2056J3QQ02 Gm24635-201ENSMUST00000122712 128 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Gm2056J3QQ02 Gm23740-201ENSMUST00000157385 100 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Gm2056J3QQ02 Gm9613-201ENSMUST00000171662 196 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Gm2056J3QQ02 Gm9944-201ENSMUST00000177649 309 ntAPPRIS P1 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Gm2056J3QQ02 Lipo1-202ENSMUST00000178735 1188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Gm2056J3QQ02 Mir7082-201ENSMUST00000183526 92 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Gm2056J3QQ02 Gm28616-201ENSMUST00000187344 441 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 109.1 ms