Protein–RNA interactions for Protein: A0A0N4SWI3

D6Ertd527e, DNA segment, Chr 6, ERATO Doi 527,-expressed, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm15790-201ENSMUST00000161109 1251 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Vmn1r158-201ENSMUST00000174643 924 ntAPPRIS P1 BASIC3.1□□□□□ -1.91
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm18150-201ENSMUST00000195341 645 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm42720-201ENSMUST00000196813 300 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 9430078K24Rik-202ENSMUST00000219857 348 ntTSL 3 BASIC3.1□□□□□ -1.91
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC125190.2-201ENSMUST00000221160 497 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC134860.4-201ENSMUST00000223592 978 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC154840.1-201ENSMUST00000225216 408 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC133203.2-201ENSMUST00000226709 464 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC154323.1-201ENSMUST00000228329 1231 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Prss37-201ENSMUST00000031967 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.1□□□□□ -1.91
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm23796-201ENSMUST00000084011 160 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Trmt2b-201ENSMUST00000087540 822 ntTSL 1 (best) BASIC3.1□□□□□ -1.91
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 A630073D07Rik-201ENSMUST00000091791 484 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.1□□□□□ -1.91
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr224-202ENSMUST00000215322 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.1□□□□□ -1.91
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Setd2-201ENSMUST00000153838 8350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.1□□□□□ -1.91
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm18508-201ENSMUST00000215790 1642 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nusap1-202ENSMUST00000068225 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.1□□□□□ -1.91
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nfib-201ENSMUST00000050872 8770 ntTSL 1 (best) BASIC3.1□□□□□ -1.91
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dctn4-201ENSMUST00000025505 3738 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.1□□□□□ -1.91
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mapk10-204ENSMUST00000112848 6761 ntTSL 1 (best) BASIC3.1□□□□□ -1.91
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm6866-202ENSMUST00000206653 3081 ntTSL 5 BASIC3.1□□□□□ -1.91
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm19514-201ENSMUST00000206856 4489 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pbrm1-201ENSMUST00000022471 5871 ntTSL 5 BASIC3.1□□□□□ -1.91
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm44026-201ENSMUST00000203985 2088 ntTSL 1 (best) BASIC3.1□□□□□ -1.91
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm33378-201ENSMUST00000219831 2758 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr430-202ENSMUST00000213425 3873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.1□□□□□ -1.91
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC141438.1-201ENSMUST00000216055 3205 ntTSL 2 BASIC3.1□□□□□ -1.91
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm45222-201ENSMUST00000207029 4307 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm43437-201ENSMUST00000198535 3955 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr699-202ENSMUST00000215952 3669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.09□□□□□ -1.91
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Vmn2r-ps38-201ENSMUST00000173752 2573 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sel1l2-202ENSMUST00000122367 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.91
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 4933403O08Rik-202ENSMUST00000152343 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.91
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Trim6-201ENSMUST00000098180 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.91
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm14399-204ENSMUST00000109060 1911 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.09□□□□□ -1.91
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ros1-201ENSMUST00000020045 7401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.91
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr733-202ENSMUST00000214372 3530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.09□□□□□ -1.91
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm15169-201ENSMUST00000126095 2753 ntTSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.91
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 R3hdm1-201ENSMUST00000036288 4795 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.09□□□□□ -1.91
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Anapc10-201ENSMUST00000048147 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.91
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm37101-201ENSMUST00000191656 3660 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm38128-201ENSMUST00000192085 3250 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Agbl2-208ENSMUST00000170320 4507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.91
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Vmn1r71-201ENSMUST00000079113 4996 ntAPPRIS P2 BASIC3.09□□□□□ -1.91
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm14661-201ENSMUST00000152669 2051 ntTSL 5 BASIC3.09□□□□□ -1.91
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zfp932-202ENSMUST00000112536 2509 ntTSL 5 BASIC3.09□□□□□ -1.91
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Igkv6-17-201ENSMUST00000103391 377 ntAPPRIS P1 BASIC3.09□□□□□ -1.91
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm9733-201ENSMUST00000108361 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.91
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm11020-201ENSMUST00000109447 186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.09□□□□□ -1.91
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm11447-201ENSMUST00000118983 858 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm6884-201ENSMUST00000119318 615 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm9085-201ENSMUST00000119994 1072 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm6620-201ENSMUST00000120113 715 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Crem-206ENSMUST00000124747 973 ntTSL 2 BASIC3.09□□□□□ -1.91
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 9030622O22Rik-201ENSMUST00000129082 1245 ntTSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.91
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm12974-201ENSMUST00000129875 333 ntTSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.91
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm12602-202ENSMUST00000154352 707 ntTSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.91
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm25605-201ENSMUST00000158364 124 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Scarna10-201ENSMUST00000158992 325 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Skint1-204ENSMUST00000162158 1260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.91
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Vmn1r116-201ENSMUST00000164288 924 ntAPPRIS P1 BASIC3.09□□□□□ -1.91
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Vmn1r152-201ENSMUST00000168326 924 ntAPPRIS P1 BASIC3.09□□□□□ -1.91
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Vmn1r95-201ENSMUST00000168984 924 ntAPPRIS P1 BASIC3.09□□□□□ -1.91
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rab11a-206ENSMUST00000169058 462 ntTSL 5 BASIC3.09□□□□□ -1.91
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Vmn1r104-201ENSMUST00000169689 924 ntAPPRIS P1 BASIC3.09□□□□□ -1.91
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Vmn1r155-201ENSMUST00000177632 924 ntAPPRIS P1 BASIC3.09□□□□□ -1.91
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Vmn1r148-201ENSMUST00000177774 924 ntAPPRIS P1 BASIC3.09□□□□□ -1.91
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Vmn1r100-201ENSMUST00000177815 924 ntAPPRIS P1 BASIC3.09□□□□□ -1.91
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Vmn1r137-201ENSMUST00000177884 924 ntAPPRIS P1 BASIC3.09□□□□□ -1.91
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Vmn1r130-201ENSMUST00000177936 924 ntAPPRIS P1 BASIC3.09□□□□□ -1.91
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Vmn1r107-201ENSMUST00000179079 924 ntAPPRIS P1 BASIC3.09□□□□□ -1.91
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Vmn1r165-201ENSMUST00000179594 924 ntAPPRIS P1 BASIC3.09□□□□□ -1.91
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm26579-201ENSMUST00000181656 918 ntTSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.91
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mir6412-201ENSMUST00000184477 97 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Il19-203ENSMUST00000187410 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.09□□□□□ -1.91
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm28269-201ENSMUST00000189511 559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.09□□□□□ -1.91
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm28769-201ENSMUST00000190176 615 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm34716-201ENSMUST00000194060 621 ntTSL 5 BASIC3.09□□□□□ -1.91
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm30353-202ENSMUST00000195486 622 ntTSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.91
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 C230071H17Rik-201ENSMUST00000196044 2973 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm3143-201ENSMUST00000196308 580 ntTSL 3 BASIC3.09□□□□□ -1.91
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm42952-201ENSMUST00000196393 731 ntTSL 2 BASIC3.09□□□□□ -1.91
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gbp2-ps-201ENSMUST00000198870 1269 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm7721-201ENSMUST00000200446 546 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm44074-201ENSMUST00000204562 337 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm44515-201ENSMUST00000209045 379 ntTSL 5 BASIC3.09□□□□□ -1.91
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm44582-201ENSMUST00000209125 445 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm45870-201ENSMUST00000211269 601 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC122395.1-201ENSMUST00000214666 374 ntTSL 5 BASIC3.09□□□□□ -1.91
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr1065-202ENSMUST00000216162 2148 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.09□□□□□ -1.91
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm8137-201ENSMUST00000218997 463 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC153548.2-201ENSMUST00000219770 885 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 4930407I19Rik-201ENSMUST00000220265 923 ntTSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.91
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cxcl13-201ENSMUST00000023840 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.91
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm22220-201ENSMUST00000082671 149 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 n-R5s13-201ENSMUST00000093707 119 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Vmn1r125-201ENSMUST00000098739 924 ntAPPRIS P1 BASIC3.09□□□□□ -1.91
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Vmn1r55-201ENSMUST00000098844 1284 ntAPPRIS P1 BASIC3.09□□□□□ -1.91
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr461-202ENSMUST00000215009 4292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.09□□□□□ -1.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.7 ms