Protein–RNA interactions for Protein: W4VSP7

Gm3238, MCG61407, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3238W4VSP7 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm3238W4VSP7 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm3238W4VSP7 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm3238W4VSP7 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm3238W4VSP7 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm3238W4VSP7 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm3238W4VSP7 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm3238W4VSP7 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm3238W4VSP7 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm3238W4VSP7 AC153912.1-201ENSMUST00000217011 724 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm3238W4VSP7 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm3238W4VSP7 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm3238W4VSP7 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm3238W4VSP7 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm3238W4VSP7 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm3238W4VSP7 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm3238W4VSP7 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm3238W4VSP7 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm3238W4VSP7 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm3238W4VSP7 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm3238W4VSP7 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm3238W4VSP7 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm3238W4VSP7 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm3238W4VSP7 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm3238W4VSP7 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm3238W4VSP7 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm3238W4VSP7 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm3238W4VSP7 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm3238W4VSP7 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm3238W4VSP7 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm3238W4VSP7 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm3238W4VSP7 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm3238W4VSP7 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm3238W4VSP7 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm3238W4VSP7 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm3238W4VSP7 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm3238W4VSP7 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm3238W4VSP7 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm3238W4VSP7 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm3238W4VSP7 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm3238W4VSP7 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm3238W4VSP7 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm3238W4VSP7 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm3238W4VSP7 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm3238W4VSP7 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm3238W4VSP7 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm3238W4VSP7 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm3238W4VSP7 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm3238W4VSP7 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm3238W4VSP7 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm3238W4VSP7 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm3238W4VSP7 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm3238W4VSP7 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm3238W4VSP7 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm3238W4VSP7 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm3238W4VSP7 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm3238W4VSP7 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm3238W4VSP7 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm3238W4VSP7 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm3238W4VSP7 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm3238W4VSP7 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm3238W4VSP7 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm3238W4VSP7 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm3238W4VSP7 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm3238W4VSP7 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm3238W4VSP7 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm3238W4VSP7 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm3238W4VSP7 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm3238W4VSP7 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm3238W4VSP7 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Gm3238W4VSP7 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm3238W4VSP7 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm3238W4VSP7 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm3238W4VSP7 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm3238W4VSP7 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm3238W4VSP7 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm3238W4VSP7 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm3238W4VSP7 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm3238W4VSP7 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm3238W4VSP7 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm3238W4VSP7 Gm6754-201ENSMUST00000117124 913 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm3238W4VSP7 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm3238W4VSP7 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm3238W4VSP7 Zfp738-202ENSMUST00000125495 712 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm3238W4VSP7 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm3238W4VSP7 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm3238W4VSP7 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm3238W4VSP7 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm3238W4VSP7 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm3238W4VSP7 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm3238W4VSP7 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm3238W4VSP7 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm3238W4VSP7 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm3238W4VSP7 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm3238W4VSP7 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm3238W4VSP7 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm3238W4VSP7 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm3238W4VSP7 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm3238W4VSP7 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm3238W4VSP7 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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