Protein–RNA interactions for Protein: W4VSN7

Gm3550, 60S ribosomal protein L29, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3550W4VSN7 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm3550W4VSN7 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm3550W4VSN7 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm3550W4VSN7 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm3550W4VSN7 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm3550W4VSN7 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm3550W4VSN7 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm3550W4VSN7 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm3550W4VSN7 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm3550W4VSN7 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm3550W4VSN7 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm3550W4VSN7 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm3550W4VSN7 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm3550W4VSN7 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm3550W4VSN7 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm3550W4VSN7 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm3550W4VSN7 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm3550W4VSN7 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm3550W4VSN7 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm3550W4VSN7 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm3550W4VSN7 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm3550W4VSN7 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Gm3550W4VSN7 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm3550W4VSN7 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm3550W4VSN7 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm3550W4VSN7 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm3550W4VSN7 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm3550W4VSN7 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm3550W4VSN7 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm3550W4VSN7 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm3550W4VSN7 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm3550W4VSN7 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm3550W4VSN7 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm3550W4VSN7 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm3550W4VSN7 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Gm3550W4VSN7 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm3550W4VSN7 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm3550W4VSN7 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm3550W4VSN7 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm3550W4VSN7 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm3550W4VSN7 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm3550W4VSN7 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm3550W4VSN7 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Gm3550W4VSN7 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm3550W4VSN7 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Gm3550W4VSN7 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Gm3550W4VSN7 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm3550W4VSN7 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm3550W4VSN7 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm3550W4VSN7 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm3550W4VSN7 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Gm3550W4VSN7 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm3550W4VSN7 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm3550W4VSN7 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm3550W4VSN7 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm3550W4VSN7 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm3550W4VSN7 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm3550W4VSN7 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm3550W4VSN7 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm3550W4VSN7 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm3550W4VSN7 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm3550W4VSN7 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm3550W4VSN7 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm3550W4VSN7 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm3550W4VSN7 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm3550W4VSN7 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm3550W4VSN7 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Gm3550W4VSN7 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm3550W4VSN7 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm3550W4VSN7 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm3550W4VSN7 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm3550W4VSN7 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Gm3550W4VSN7 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm3550W4VSN7 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm3550W4VSN7 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Gm3550W4VSN7 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Gm3550W4VSN7 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm3550W4VSN7 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm3550W4VSN7 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm3550W4VSN7 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm3550W4VSN7 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm3550W4VSN7 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm3550W4VSN7 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm3550W4VSN7 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm3550W4VSN7 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm3550W4VSN7 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm3550W4VSN7 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm3550W4VSN7 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm3550W4VSN7 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm3550W4VSN7 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm3550W4VSN7 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm3550W4VSN7 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm3550W4VSN7 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm3550W4VSN7 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm3550W4VSN7 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm3550W4VSN7 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Gm3550W4VSN7 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm3550W4VSN7 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm3550W4VSN7 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm3550W4VSN7 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms