Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z321

Top3b, DNA topoisomerase 3-beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top3bQ9Z321 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Top3bQ9Z321 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Top3bQ9Z321 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Top3bQ9Z321 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Top3bQ9Z321 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Top3bQ9Z321 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Top3bQ9Z321 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Top3bQ9Z321 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Top3bQ9Z321 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Top3bQ9Z321 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Top3bQ9Z321 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Top3bQ9Z321 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Top3bQ9Z321 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Top3bQ9Z321 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Top3bQ9Z321 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Top3bQ9Z321 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Top3bQ9Z321 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Top3bQ9Z321 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Top3bQ9Z321 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Top3bQ9Z321 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Top3bQ9Z321 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Top3bQ9Z321 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Top3bQ9Z321 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Top3bQ9Z321 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Top3bQ9Z321 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Top3bQ9Z321 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Top3bQ9Z321 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Top3bQ9Z321 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Top3bQ9Z321 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Top3bQ9Z321 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Top3bQ9Z321 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Top3bQ9Z321 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Top3bQ9Z321 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Top3bQ9Z321 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Top3bQ9Z321 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Top3bQ9Z321 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Top3bQ9Z321 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Top3bQ9Z321 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Top3bQ9Z321 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Top3bQ9Z321 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Top3bQ9Z321 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Top3bQ9Z321 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Top3bQ9Z321 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Top3bQ9Z321 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Top3bQ9Z321 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Top3bQ9Z321 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Top3bQ9Z321 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Top3bQ9Z321 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Top3bQ9Z321 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Top3bQ9Z321 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Top3bQ9Z321 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Top3bQ9Z321 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Top3bQ9Z321 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Top3bQ9Z321 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Top3bQ9Z321 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Top3bQ9Z321 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Top3bQ9Z321 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Top3bQ9Z321 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Top3bQ9Z321 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Top3bQ9Z321 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Top3bQ9Z321 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Top3bQ9Z321 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Top3bQ9Z321 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Top3bQ9Z321 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Top3bQ9Z321 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Top3bQ9Z321 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Top3bQ9Z321 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Top3bQ9Z321 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Top3bQ9Z321 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Top3bQ9Z321 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Top3bQ9Z321 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Top3bQ9Z321 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Top3bQ9Z321 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Top3bQ9Z321 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Top3bQ9Z321 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Top3bQ9Z321 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Top3bQ9Z321 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Top3bQ9Z321 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Top3bQ9Z321 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Top3bQ9Z321 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Top3bQ9Z321 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Top3bQ9Z321 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Top3bQ9Z321 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Top3bQ9Z321 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Top3bQ9Z321 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Top3bQ9Z321 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Top3bQ9Z321 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Top3bQ9Z321 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Top3bQ9Z321 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Top3bQ9Z321 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Top3bQ9Z321 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Top3bQ9Z321 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Top3bQ9Z321 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Top3bQ9Z321 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Top3bQ9Z321 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Top3bQ9Z321 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Top3bQ9Z321 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Top3bQ9Z321 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Top3bQ9Z321 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Top3bQ9Z321 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms