Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V6

Hdac5, Histone deacetylase 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac5Q9Z2V6 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Hdac5Q9Z2V6 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Hdac5Q9Z2V6 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Hdac5Q9Z2V6 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.64
Hdac5Q9Z2V6 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
Hdac5Q9Z2V6 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Hdac5Q9Z2V6 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.64
Hdac5Q9Z2V6 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Hdac5Q9Z2V6 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Hdac5Q9Z2V6 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Hdac5Q9Z2V6 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Hdac5Q9Z2V6 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Hdac5Q9Z2V6 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Hdac5Q9Z2V6 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Hdac5Q9Z2V6 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Hdac5Q9Z2V6 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Hdac5Q9Z2V6 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Hdac5Q9Z2V6 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Hdac5Q9Z2V6 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Hdac5Q9Z2V6 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Hdac5Q9Z2V6 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Hdac5Q9Z2V6 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Hdac5Q9Z2V6 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Hdac5Q9Z2V6 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Hdac5Q9Z2V6 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Hdac5Q9Z2V6 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Hdac5Q9Z2V6 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Hdac5Q9Z2V6 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Hdac5Q9Z2V6 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Hdac5Q9Z2V6 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Hdac5Q9Z2V6 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Hdac5Q9Z2V6 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Hdac5Q9Z2V6 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Hdac5Q9Z2V6 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Hdac5Q9Z2V6 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Hdac5Q9Z2V6 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Hdac5Q9Z2V6 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Hdac5Q9Z2V6 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Hdac5Q9Z2V6 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Hdac5Q9Z2V6 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Hdac5Q9Z2V6 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Hdac5Q9Z2V6 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Hdac5Q9Z2V6 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Hdac5Q9Z2V6 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Hdac5Q9Z2V6 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Hdac5Q9Z2V6 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Hdac5Q9Z2V6 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Hdac5Q9Z2V6 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Hdac5Q9Z2V6 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Hdac5Q9Z2V6 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Hdac5Q9Z2V6 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Hdac5Q9Z2V6 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Hdac5Q9Z2V6 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Hdac5Q9Z2V6 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Hdac5Q9Z2V6 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Hdac5Q9Z2V6 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Hdac5Q9Z2V6 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Hdac5Q9Z2V6 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Hdac5Q9Z2V6 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Hdac5Q9Z2V6 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Hdac5Q9Z2V6 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Hdac5Q9Z2V6 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Hdac5Q9Z2V6 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Hdac5Q9Z2V6 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Hdac5Q9Z2V6 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Hdac5Q9Z2V6 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Hdac5Q9Z2V6 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Hdac5Q9Z2V6 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Hdac5Q9Z2V6 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Hdac5Q9Z2V6 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Hdac5Q9Z2V6 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Hdac5Q9Z2V6 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Hdac5Q9Z2V6 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Hdac5Q9Z2V6 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Hdac5Q9Z2V6 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Hdac5Q9Z2V6 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Hdac5Q9Z2V6 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Hdac5Q9Z2V6 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Hdac5Q9Z2V6 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Hdac5Q9Z2V6 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Hdac5Q9Z2V6 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Hdac5Q9Z2V6 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Hdac5Q9Z2V6 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Hdac5Q9Z2V6 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Hdac5Q9Z2V6 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Hdac5Q9Z2V6 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Hdac5Q9Z2V6 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Hdac5Q9Z2V6 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Hdac5Q9Z2V6 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Hdac5Q9Z2V6 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Hdac5Q9Z2V6 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Hdac5Q9Z2V6 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Hdac5Q9Z2V6 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Hdac5Q9Z2V6 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Hdac5Q9Z2V6 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Hdac5Q9Z2V6 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Hdac5Q9Z2V6 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Hdac5Q9Z2V6 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Hdac5Q9Z2V6 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Hdac5Q9Z2V6 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms