Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V5

Hdac6, Histone deacetylase 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,149 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac6Q9Z2V5 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hdac6Q9Z2V5 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hdac6Q9Z2V5 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hdac6Q9Z2V5 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hdac6Q9Z2V5 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hdac6Q9Z2V5 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Hdac6Q9Z2V5 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Hdac6Q9Z2V5 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Hdac6Q9Z2V5 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Hdac6Q9Z2V5 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Hdac6Q9Z2V5 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Hdac6Q9Z2V5 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Hdac6Q9Z2V5 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Hdac6Q9Z2V5 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Hdac6Q9Z2V5 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Hdac6Q9Z2V5 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Hdac6Q9Z2V5 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Hdac6Q9Z2V5 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Hdac6Q9Z2V5 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hdac6Q9Z2V5 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hdac6Q9Z2V5 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hdac6Q9Z2V5 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hdac6Q9Z2V5 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hdac6Q9Z2V5 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Hdac6Q9Z2V5 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Hdac6Q9Z2V5 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hdac6Q9Z2V5 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hdac6Q9Z2V5 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hdac6Q9Z2V5 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hdac6Q9Z2V5 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hdac6Q9Z2V5 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hdac6Q9Z2V5 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hdac6Q9Z2V5 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hdac6Q9Z2V5 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hdac6Q9Z2V5 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hdac6Q9Z2V5 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hdac6Q9Z2V5 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hdac6Q9Z2V5 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hdac6Q9Z2V5 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hdac6Q9Z2V5 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hdac6Q9Z2V5 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hdac6Q9Z2V5 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hdac6Q9Z2V5 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hdac6Q9Z2V5 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hdac6Q9Z2V5 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Hdac6Q9Z2V5 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Hdac6Q9Z2V5 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Hdac6Q9Z2V5 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Hdac6Q9Z2V5 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Hdac6Q9Z2V5 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Hdac6Q9Z2V5 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Hdac6Q9Z2V5 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Hdac6Q9Z2V5 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Hdac6Q9Z2V5 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Hdac6Q9Z2V5 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Hdac6Q9Z2V5 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Hdac6Q9Z2V5 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Hdac6Q9Z2V5 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hdac6Q9Z2V5 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hdac6Q9Z2V5 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hdac6Q9Z2V5 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hdac6Q9Z2V5 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hdac6Q9Z2V5 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hdac6Q9Z2V5 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hdac6Q9Z2V5 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Hdac6Q9Z2V5 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hdac6Q9Z2V5 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hdac6Q9Z2V5 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hdac6Q9Z2V5 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hdac6Q9Z2V5 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hdac6Q9Z2V5 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hdac6Q9Z2V5 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hdac6Q9Z2V5 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hdac6Q9Z2V5 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hdac6Q9Z2V5 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hdac6Q9Z2V5 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hdac6Q9Z2V5 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hdac6Q9Z2V5 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hdac6Q9Z2V5 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hdac6Q9Z2V5 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hdac6Q9Z2V5 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hdac6Q9Z2V5 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Hdac6Q9Z2V5 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hdac6Q9Z2V5 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hdac6Q9Z2V5 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hdac6Q9Z2V5 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hdac6Q9Z2V5 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hdac6Q9Z2V5 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hdac6Q9Z2V5 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hdac6Q9Z2V5 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hdac6Q9Z2V5 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hdac6Q9Z2V5 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hdac6Q9Z2V5 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hdac6Q9Z2V5 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hdac6Q9Z2V5 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Hdac6Q9Z2V5 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Hdac6Q9Z2V5 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Hdac6Q9Z2V5 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Hdac6Q9Z2V5 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Hdac6Q9Z2V5 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
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