Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2A0

Pdpk1, 3-phosphoinositide-dependent protein kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdpk1Q9Z2A0 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pdpk1Q9Z2A0 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Pdpk1Q9Z2A0 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Pdpk1Q9Z2A0 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Pdpk1Q9Z2A0 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Pdpk1Q9Z2A0 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pdpk1Q9Z2A0 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Pdpk1Q9Z2A0 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Pdpk1Q9Z2A0 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Pdpk1Q9Z2A0 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pdpk1Q9Z2A0 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pdpk1Q9Z2A0 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pdpk1Q9Z2A0 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pdpk1Q9Z2A0 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Pdpk1Q9Z2A0 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pdpk1Q9Z2A0 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pdpk1Q9Z2A0 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pdpk1Q9Z2A0 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pdpk1Q9Z2A0 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pdpk1Q9Z2A0 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pdpk1Q9Z2A0 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pdpk1Q9Z2A0 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pdpk1Q9Z2A0 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pdpk1Q9Z2A0 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Pdpk1Q9Z2A0 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pdpk1Q9Z2A0 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pdpk1Q9Z2A0 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
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Pdpk1Q9Z2A0 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
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Pdpk1Q9Z2A0 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pdpk1Q9Z2A0 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pdpk1Q9Z2A0 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pdpk1Q9Z2A0 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pdpk1Q9Z2A0 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pdpk1Q9Z2A0 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pdpk1Q9Z2A0 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pdpk1Q9Z2A0 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pdpk1Q9Z2A0 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pdpk1Q9Z2A0 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
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Pdpk1Q9Z2A0 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pdpk1Q9Z2A0 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pdpk1Q9Z2A0 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
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Pdpk1Q9Z2A0 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pdpk1Q9Z2A0 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
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Pdpk1Q9Z2A0 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
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Pdpk1Q9Z2A0 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
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Pdpk1Q9Z2A0 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pdpk1Q9Z2A0 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
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Pdpk1Q9Z2A0 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
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Pdpk1Q9Z2A0 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pdpk1Q9Z2A0 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Pdpk1Q9Z2A0 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pdpk1Q9Z2A0 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pdpk1Q9Z2A0 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pdpk1Q9Z2A0 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pdpk1Q9Z2A0 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pdpk1Q9Z2A0 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pdpk1Q9Z2A0 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pdpk1Q9Z2A0 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pdpk1Q9Z2A0 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pdpk1Q9Z2A0 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Pdpk1Q9Z2A0 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pdpk1Q9Z2A0 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pdpk1Q9Z2A0 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pdpk1Q9Z2A0 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pdpk1Q9Z2A0 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pdpk1Q9Z2A0 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pdpk1Q9Z2A0 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pdpk1Q9Z2A0 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pdpk1Q9Z2A0 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pdpk1Q9Z2A0 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
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