Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z262

Cldn6, Claudin-6, mousemouse

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Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn6Q9Z262 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cldn6Q9Z262 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cldn6Q9Z262 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cldn6Q9Z262 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cldn6Q9Z262 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cldn6Q9Z262 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Cldn6Q9Z262 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cldn6Q9Z262 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cldn6Q9Z262 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cldn6Q9Z262 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cldn6Q9Z262 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cldn6Q9Z262 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Cldn6Q9Z262 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cldn6Q9Z262 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Cldn6Q9Z262 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC16.64■□□□□ 0.26
Cldn6Q9Z262 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Cldn6Q9Z262 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Cldn6Q9Z262 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cldn6Q9Z262 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cldn6Q9Z262 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cldn6Q9Z262 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cldn6Q9Z262 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cldn6Q9Z262 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cldn6Q9Z262 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Cldn6Q9Z262 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
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Cldn6Q9Z262 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cldn6Q9Z262 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cldn6Q9Z262 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cldn6Q9Z262 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cldn6Q9Z262 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cldn6Q9Z262 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Cldn6Q9Z262 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cldn6Q9Z262 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Cldn6Q9Z262 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Cldn6Q9Z262 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cldn6Q9Z262 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cldn6Q9Z262 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
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Cldn6Q9Z262 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cldn6Q9Z262 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cldn6Q9Z262 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cldn6Q9Z262 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cldn6Q9Z262 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cldn6Q9Z262 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cldn6Q9Z262 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cldn6Q9Z262 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cldn6Q9Z262 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cldn6Q9Z262 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
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Cldn6Q9Z262 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cldn6Q9Z262 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cldn6Q9Z262 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cldn6Q9Z262 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cldn6Q9Z262 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cldn6Q9Z262 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cldn6Q9Z262 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cldn6Q9Z262 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cldn6Q9Z262 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cldn6Q9Z262 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cldn6Q9Z262 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cldn6Q9Z262 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cldn6Q9Z262 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cldn6Q9Z262 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cldn6Q9Z262 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cldn6Q9Z262 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cldn6Q9Z262 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cldn6Q9Z262 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cldn6Q9Z262 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cldn6Q9Z262 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cldn6Q9Z262 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cldn6Q9Z262 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cldn6Q9Z262 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cldn6Q9Z262 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cldn6Q9Z262 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cldn6Q9Z262 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cldn6Q9Z262 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cldn6Q9Z262 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cldn6Q9Z262 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cldn6Q9Z262 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cldn6Q9Z262 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cldn6Q9Z262 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cldn6Q9Z262 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cldn6Q9Z262 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cldn6Q9Z262 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cldn6Q9Z262 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cldn6Q9Z262 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cldn6Q9Z262 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cldn6Q9Z262 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cldn6Q9Z262 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cldn6Q9Z262 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cldn6Q9Z262 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cldn6Q9Z262 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cldn6Q9Z262 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cldn6Q9Z262 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Cldn6Q9Z262 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cldn6Q9Z262 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cldn6Q9Z262 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cldn6Q9Z262 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms