Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1J2

Nek4, Serine/threonine-protein kinase Nek4, mousemouse

Predictions only

Length 792 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek4Q9Z1J2 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nek4Q9Z1J2 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nek4Q9Z1J2 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nek4Q9Z1J2 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nek4Q9Z1J2 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nek4Q9Z1J2 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nek4Q9Z1J2 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Nek4Q9Z1J2 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Nek4Q9Z1J2 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Nek4Q9Z1J2 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nek4Q9Z1J2 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nek4Q9Z1J2 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nek4Q9Z1J2 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nek4Q9Z1J2 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nek4Q9Z1J2 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nek4Q9Z1J2 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nek4Q9Z1J2 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nek4Q9Z1J2 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nek4Q9Z1J2 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nek4Q9Z1J2 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Nek4Q9Z1J2 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nek4Q9Z1J2 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nek4Q9Z1J2 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nek4Q9Z1J2 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nek4Q9Z1J2 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nek4Q9Z1J2 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nek4Q9Z1J2 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nek4Q9Z1J2 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nek4Q9Z1J2 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nek4Q9Z1J2 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nek4Q9Z1J2 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nek4Q9Z1J2 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nek4Q9Z1J2 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nek4Q9Z1J2 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nek4Q9Z1J2 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nek4Q9Z1J2 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nek4Q9Z1J2 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nek4Q9Z1J2 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nek4Q9Z1J2 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nek4Q9Z1J2 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nek4Q9Z1J2 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nek4Q9Z1J2 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nek4Q9Z1J2 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nek4Q9Z1J2 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nek4Q9Z1J2 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nek4Q9Z1J2 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Nek4Q9Z1J2 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nek4Q9Z1J2 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nek4Q9Z1J2 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nek4Q9Z1J2 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nek4Q9Z1J2 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nek4Q9Z1J2 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nek4Q9Z1J2 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Nek4Q9Z1J2 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Nek4Q9Z1J2 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Nek4Q9Z1J2 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Nek4Q9Z1J2 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Nek4Q9Z1J2 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Nek4Q9Z1J2 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Nek4Q9Z1J2 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Nek4Q9Z1J2 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Nek4Q9Z1J2 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Nek4Q9Z1J2 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Nek4Q9Z1J2 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Nek4Q9Z1J2 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Nek4Q9Z1J2 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Nek4Q9Z1J2 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Nek4Q9Z1J2 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Nek4Q9Z1J2 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Nek4Q9Z1J2 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Nek4Q9Z1J2 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Nek4Q9Z1J2 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Nek4Q9Z1J2 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Nek4Q9Z1J2 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Nek4Q9Z1J2 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nek4Q9Z1J2 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nek4Q9Z1J2 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nek4Q9Z1J2 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nek4Q9Z1J2 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nek4Q9Z1J2 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nek4Q9Z1J2 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nek4Q9Z1J2 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nek4Q9Z1J2 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nek4Q9Z1J2 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nek4Q9Z1J2 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nek4Q9Z1J2 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nek4Q9Z1J2 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nek4Q9Z1J2 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nek4Q9Z1J2 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nek4Q9Z1J2 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nek4Q9Z1J2 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nek4Q9Z1J2 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nek4Q9Z1J2 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Nek4Q9Z1J2 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nek4Q9Z1J2 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nek4Q9Z1J2 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Nek4Q9Z1J2 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nek4Q9Z1J2 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nek4Q9Z1J2 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nek4Q9Z1J2 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms