Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z160

Cog1, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 980 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cog1Q9Z160 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cog1Q9Z160 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cog1Q9Z160 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Cog1Q9Z160 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cog1Q9Z160 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cog1Q9Z160 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cog1Q9Z160 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cog1Q9Z160 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cog1Q9Z160 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cog1Q9Z160 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cog1Q9Z160 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cog1Q9Z160 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cog1Q9Z160 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cog1Q9Z160 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cog1Q9Z160 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cog1Q9Z160 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cog1Q9Z160 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cog1Q9Z160 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cog1Q9Z160 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cog1Q9Z160 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cog1Q9Z160 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cog1Q9Z160 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cog1Q9Z160 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cog1Q9Z160 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cog1Q9Z160 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cog1Q9Z160 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cog1Q9Z160 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cog1Q9Z160 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cog1Q9Z160 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cog1Q9Z160 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cog1Q9Z160 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cog1Q9Z160 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cog1Q9Z160 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cog1Q9Z160 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cog1Q9Z160 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cog1Q9Z160 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cog1Q9Z160 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Cog1Q9Z160 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cog1Q9Z160 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cog1Q9Z160 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cog1Q9Z160 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cog1Q9Z160 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cog1Q9Z160 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cog1Q9Z160 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cog1Q9Z160 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cog1Q9Z160 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cog1Q9Z160 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cog1Q9Z160 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cog1Q9Z160 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Cog1Q9Z160 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cog1Q9Z160 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cog1Q9Z160 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cog1Q9Z160 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cog1Q9Z160 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cog1Q9Z160 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cog1Q9Z160 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cog1Q9Z160 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cog1Q9Z160 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cog1Q9Z160 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cog1Q9Z160 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cog1Q9Z160 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cog1Q9Z160 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Cog1Q9Z160 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cog1Q9Z160 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cog1Q9Z160 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cog1Q9Z160 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cog1Q9Z160 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cog1Q9Z160 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cog1Q9Z160 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cog1Q9Z160 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cog1Q9Z160 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cog1Q9Z160 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cog1Q9Z160 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cog1Q9Z160 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cog1Q9Z160 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cog1Q9Z160 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cog1Q9Z160 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cog1Q9Z160 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cog1Q9Z160 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cog1Q9Z160 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cog1Q9Z160 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cog1Q9Z160 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Cog1Q9Z160 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Cog1Q9Z160 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cog1Q9Z160 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cog1Q9Z160 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cog1Q9Z160 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cog1Q9Z160 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cog1Q9Z160 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cog1Q9Z160 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cog1Q9Z160 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cog1Q9Z160 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cog1Q9Z160 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cog1Q9Z160 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cog1Q9Z160 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cog1Q9Z160 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cog1Q9Z160 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Cog1Q9Z160 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cog1Q9Z160 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cog1Q9Z160 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms