Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z140

Cpne6, Copine-6, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne6Q9Z140 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Cpne6Q9Z140 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Cpne6Q9Z140 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cpne6Q9Z140 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Cpne6Q9Z140 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cpne6Q9Z140 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cpne6Q9Z140 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cpne6Q9Z140 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cpne6Q9Z140 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cpne6Q9Z140 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cpne6Q9Z140 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cpne6Q9Z140 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cpne6Q9Z140 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cpne6Q9Z140 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cpne6Q9Z140 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cpne6Q9Z140 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cpne6Q9Z140 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cpne6Q9Z140 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cpne6Q9Z140 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cpne6Q9Z140 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cpne6Q9Z140 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Cpne6Q9Z140 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Cpne6Q9Z140 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Cpne6Q9Z140 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cpne6Q9Z140 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cpne6Q9Z140 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cpne6Q9Z140 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cpne6Q9Z140 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cpne6Q9Z140 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cpne6Q9Z140 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cpne6Q9Z140 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cpne6Q9Z140 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cpne6Q9Z140 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cpne6Q9Z140 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cpne6Q9Z140 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cpne6Q9Z140 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cpne6Q9Z140 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cpne6Q9Z140 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cpne6Q9Z140 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cpne6Q9Z140 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cpne6Q9Z140 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cpne6Q9Z140 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cpne6Q9Z140 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cpne6Q9Z140 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cpne6Q9Z140 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cpne6Q9Z140 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cpne6Q9Z140 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Cpne6Q9Z140 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cpne6Q9Z140 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Cpne6Q9Z140 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cpne6Q9Z140 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cpne6Q9Z140 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cpne6Q9Z140 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cpne6Q9Z140 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cpne6Q9Z140 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cpne6Q9Z140 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cpne6Q9Z140 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cpne6Q9Z140 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cpne6Q9Z140 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cpne6Q9Z140 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cpne6Q9Z140 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cpne6Q9Z140 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cpne6Q9Z140 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cpne6Q9Z140 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cpne6Q9Z140 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cpne6Q9Z140 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cpne6Q9Z140 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cpne6Q9Z140 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cpne6Q9Z140 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cpne6Q9Z140 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cpne6Q9Z140 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cpne6Q9Z140 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cpne6Q9Z140 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cpne6Q9Z140 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cpne6Q9Z140 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cpne6Q9Z140 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cpne6Q9Z140 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cpne6Q9Z140 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cpne6Q9Z140 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cpne6Q9Z140 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cpne6Q9Z140 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cpne6Q9Z140 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cpne6Q9Z140 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cpne6Q9Z140 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cpne6Q9Z140 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cpne6Q9Z140 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cpne6Q9Z140 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cpne6Q9Z140 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cpne6Q9Z140 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cpne6Q9Z140 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cpne6Q9Z140 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cpne6Q9Z140 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cpne6Q9Z140 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cpne6Q9Z140 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cpne6Q9Z140 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cpne6Q9Z140 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cpne6Q9Z140 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cpne6Q9Z140 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cpne6Q9Z140 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cpne6Q9Z140 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.9 ms