Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z131

Sh3bp5, SH3 domain-binding protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp5Q9Z131 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sh3bp5Q9Z131 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sh3bp5Q9Z131 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sh3bp5Q9Z131 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sh3bp5Q9Z131 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sh3bp5Q9Z131 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sh3bp5Q9Z131 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Sh3bp5Q9Z131 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sh3bp5Q9Z131 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sh3bp5Q9Z131 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Sh3bp5Q9Z131 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Sh3bp5Q9Z131 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sh3bp5Q9Z131 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sh3bp5Q9Z131 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sh3bp5Q9Z131 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sh3bp5Q9Z131 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sh3bp5Q9Z131 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Sh3bp5Q9Z131 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sh3bp5Q9Z131 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sh3bp5Q9Z131 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sh3bp5Q9Z131 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sh3bp5Q9Z131 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sh3bp5Q9Z131 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sh3bp5Q9Z131 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sh3bp5Q9Z131 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sh3bp5Q9Z131 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sh3bp5Q9Z131 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sh3bp5Q9Z131 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sh3bp5Q9Z131 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sh3bp5Q9Z131 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sh3bp5Q9Z131 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sh3bp5Q9Z131 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sh3bp5Q9Z131 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sh3bp5Q9Z131 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Sh3bp5Q9Z131 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sh3bp5Q9Z131 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sh3bp5Q9Z131 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sh3bp5Q9Z131 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sh3bp5Q9Z131 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sh3bp5Q9Z131 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Sh3bp5Q9Z131 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sh3bp5Q9Z131 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sh3bp5Q9Z131 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sh3bp5Q9Z131 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sh3bp5Q9Z131 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sh3bp5Q9Z131 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sh3bp5Q9Z131 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sh3bp5Q9Z131 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sh3bp5Q9Z131 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sh3bp5Q9Z131 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Sh3bp5Q9Z131 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sh3bp5Q9Z131 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sh3bp5Q9Z131 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sh3bp5Q9Z131 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sh3bp5Q9Z131 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Sh3bp5Q9Z131 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Sh3bp5Q9Z131 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sh3bp5Q9Z131 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sh3bp5Q9Z131 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sh3bp5Q9Z131 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sh3bp5Q9Z131 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sh3bp5Q9Z131 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sh3bp5Q9Z131 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sh3bp5Q9Z131 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sh3bp5Q9Z131 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sh3bp5Q9Z131 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sh3bp5Q9Z131 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sh3bp5Q9Z131 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sh3bp5Q9Z131 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sh3bp5Q9Z131 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sh3bp5Q9Z131 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sh3bp5Q9Z131 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sh3bp5Q9Z131 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sh3bp5Q9Z131 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sh3bp5Q9Z131 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sh3bp5Q9Z131 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sh3bp5Q9Z131 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sh3bp5Q9Z131 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sh3bp5Q9Z131 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sh3bp5Q9Z131 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Sh3bp5Q9Z131 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sh3bp5Q9Z131 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sh3bp5Q9Z131 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sh3bp5Q9Z131 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sh3bp5Q9Z131 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sh3bp5Q9Z131 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
Sh3bp5Q9Z131 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Sh3bp5Q9Z131 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Sh3bp5Q9Z131 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Sh3bp5Q9Z131 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Sh3bp5Q9Z131 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Sh3bp5Q9Z131 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Sh3bp5Q9Z131 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Sh3bp5Q9Z131 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Sh3bp5Q9Z131 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Sh3bp5Q9Z131 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Sh3bp5Q9Z131 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Sh3bp5Q9Z131 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sh3bp5Q9Z131 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sh3bp5Q9Z131 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 472.1 ms